由沉降速度方程可知，顆粒的沉降速度與其大小成正比，若為球形顆粒，則與其直徑的平方成正比；與顆粒和介質的密度差成正比。因此，顆粒越大，和介質的密度差越大，沉降速度越大。顆粒大小和密度差是壓細胞分離的基礎。
大多數亞細胞的大小和密度都存在明顯差異。細胞核zui大，直徑達4～12μm，密度zui大。膜囊泡zui小，僅0.05～0.4μm，衍生囊泡的大小和密度受勻漿方法和勻漿介質密度影響。線粒體直徑0.4～2.5μm，密度為1.19克/立方厘米，用
臺式大容量離心機差速離心法容易進行分離。在這些亞細胞分離中顆粒大小起主導作用，但線粒體、溶酶體的大小和密度都有重疊，用常規方法難以分離。
臺式大容量離心機因轉子的材料組織疏密不均勻造成轉子質心與幾何形心不一致，轉子運轉時因質量不對稱造成慣性主軸偏離旋轉軸，都會產生不平衡，產生附加力和力矩。高速運轉的轉子相對離心力很大，很小的不平衡質量會產生很大的離心慣性力，這樣會使離心機產生振動，增加動負荷，降低離心機的使用效果，縮短使用壽命，嚴重時會導致離心機損壞。
（1）高速離心時，對于沉淀量大的樣品要先低速除去大顆粒。
（2）不要用密度不同的樣品組成一對對應管。
（3）一對對應管中的樣品重量要相同、體積要相同。
（4）離心管帽要先平衡，不同材質、不同機型的管帽重量不同，不要混用。
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