大家好，我是小馬老師。
Lammps模擬完成后，一般需要進行圖像后處理，因為lammps不帶后處理功能，這些圖像后處理需要借助第三方軟件實現，比如vmd、ovito等。
本文主要介紹在Ovito中如何標記原子的內部運動。
比如，在下面的剪切模擬中，中間部分原子被標記為綠色，在后續的剪切過程中，可以明顯地觀察到這些原子的運動軌跡。

下面介紹一下具體實現的過程。

導入數據文件
打開Ovito軟件，導入dump.xyz軌跡文件，如下圖所示。

選擇中間原子
點擊Ovito右上角菜單“Add modification”，選擇“Expression selection”

在“Boolean expression”窗口內輸入：
Position.X >25 && Position.X < 32
選擇x坐標處于（25，32）之間的原子。

凍結屬性
點擊Ovito右上角菜單“Add modification”，選擇“Freeze property”：

在Property to freeze欄目下選擇“Selection”作為要凍結的屬性。

指定顏色
點擊Ovito右上角菜單“Add modification”，指定一種顏色即可。

這樣，在觀察各幀的原子圖像時，就可以看到中間原子的運動軌跡。

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的lammps基础教程：Ovito标记原子内部运动方法介绍的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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