【转】Dicom基础知识
DICOM?文件可以大致分為兩部分:
一部分:與?圖像?相關?的?元?信息?,包括患者信息,檢查信息,序列信息,圖像信息等等。
另一部分:圖像的像素數據。
在解析DICOM文件中的像素數據的時候,我們先需要讀取以下圖像相關信息:
以下?是?某個CT影像中的圖像信息示例:
(0028,0002)? ? ? ? Samples per Pixel? ?? ? ? ?? ???VR: US? ? ? ? Length: 2? ? ? ???Value: 1?
(0028,0004)? ? ? ? Photometric Interpretation??VR: CS? ? ? ? Length: 12? ? ? ???Value: MONOCHROME2
(0028,0010)? ? ? ? Rows? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?VR: US? ? ? ? Length: 2? ? ? ???Value: 512?
(0028,0011)? ? ? ? Columns? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?VR: US? ? ? ? Length: 2? ? ? ???Value: 512?
(0028,0030)? ? ? ? Pixel Spacing? ?? ?? ?? ?? ?VR: DS? ? ? ? Length: 22? ? ? ???Value: 0.48828125\0.48828125
(0028,0100)? ? ? ? Bits Allocated? ?? ?? ?? ???VR: US? ? ? ? Length: 2? ? ? ???Value: 16?
(0028,0101)? ? ? ? Bits Stored? ?? ?? ?? ?? ???VR: US? ? ? ? Length: 2? ? ? ???Value: 12?
(0028,0102)? ? ? ? High Bit? ?? ?? ?? ?? ?? ???VR: US? ? ? ? Length: 2? ? ? ???Value: 11?
(0028,0103)? ? ? ? Pixel Representation? ?? ???VR: US? ? ? ? Length: 2? ? ? ???Value: 0?
(0028,1050)? ? ? ? Window Center? ?? ?? ?? ?? ?VR: DS? ? ? ? Length: 12? ? ? ???Value: 00100\00100
(0028,1051)? ? ? ? Window Width? ?? ?? ?? ?? ? VR: DS? ? ? ? Length: 12? ? ? ???Value: 00500\00500
(0028,1052)? ? ? ? Rescale Intercept? ?? ?? ???VR: DS? ? ? ? Length: 6? ? ? ???Value: -1000
(0028,1053)? ? ? ? Rescale Slope? ?? ?? ?? ?? ?VR: DS? ? ? ? Length: 2? ? ? ???Value: 1
(0028,2110)? ? ? ? Lossy Image Compression? ???VR: CS? ? ? ? Length: 2? ? ? ???Value: 01
(0028,2112)? ? ? ? Lossy Image Compression Ratio? ?VR: DS? ? ? ? Length: 8? ? ? ???Value: 6.228918
1.(0028,0002)? ? ? ? Samples per Pixel?
? ? ? ? 每一個像素的取樣數,一般來說,CT,MR,DR等灰度圖像都是1,而彩超等彩**圖像都是3,分別表示R, G, B三個顏色通道。
2.(0028,0004)? ? ? ? Photometric Interpretation
? ? 我們經常碰到的Photometric Interpretation有以下幾種類型:
? ? ? ? Monochrome2??一般的灰度圖像都采用這種,Pixel值越大,圖像就越白。
? ? ? ? Monochrome1 只有部分CR, DR圖像使用,Pixel值越大,圖像就越黑。
? ? ? ? Palette Colour 一般用于彩超圖像,每個像素占用8位或者16位,調色板保存在[0028,1201]RedPaletteColorLookupTableData, [0028,1202]GreenPaletteColorLookupTableData, [0028,1203]BluePaletteColorLookupTableData的屬性中。
? ? ? ? RGB??這是最常用的彩**圖像格式。
? ? ? ? YBR_FULL??另外一種彩**圖像格式, 存儲格式為Y(Luminance 亮度), B(Blueness 藍色), R(Redness, 紅色)
? ? ? ? YBR_FULL_422 一般用于JPG有損壓縮格式的彩**圖像,每兩個像素共同使用32位,每一個像素都有自己的Y(Luminance 亮度),但是共享相同的B(Blueness 藍色), R(Redness, 紅色)。所以,它的像素值存儲方式是:YYBR,YYBT,YYBR
? ? ? ? YBR_RCT 用于JPEG 2000無損壓縮彩**圖*像,Reversible Color Transformation, 可逆色彩變換。
? ? ? ? Y = (R+2G+B)/4,??CB = B-G??, CR = R - G
? ? ? ? G = Y - (CR+CB)/4 ,??R = CR + G,??B = CB + G
? ? ? ? YBR_ICT 用于JPEG 2000有損壓縮彩**圖像 Irreversible Color Transformation, 不可逆色彩變換。
? ? ? ? Y = + .29900R + .58700G + .11400B
? ? ? ? CB = - .16875R - .33126G + .50000B
? ? ? ? CR = + .50000R - .41869G - .08131B
3.??(0028,0010)Rows?
? ? 圖像的高度
4.??(0028,0011)Columns
? ? 圖像的寬度
5.??(0028,0030)Pixel Spacing??
? ? 圖像像素間距,讀取Pixel Data的時候不需要,主要用于長度測量。
6.??(0028,0100)Bits Allocated
? ? 一個像素取樣點存儲時分配到的位數,一般RGB的圖像,每一個顏色通道都使用8位,所以一般取值為8。對于灰度圖像,如果是256級灰階,一般就是8位。如果高于256級灰階,一般就采用16位。
7. (0028,0101)Bits Stored??? ? ? ??
? ? ? ? 一個像素取樣點存儲時使用到的位數。比方說示例中CT影像,采用的是4K灰階,像素值取值范圍為0~4095,所以使用到的位數為12位。
8.??(0028,0102)High Bit?
? ? 最高位序號,它定義了存儲點在分配的內存中的排列方式,它的值是最后一個bit的序號。如果第一個bit放在0位,那么最后一個bit為Bits Stored -1。
9.??(0028,0103)Pixel Representation?
? ???如果這個值為0, 這表明是無符號類型,其VR類型應該為US,Unsigned Short. 如果這個值為1, 這表明為有符號類型,其VR類型應該為SS,Signed Short.
10.??(0028,1050)Window Center 和 (0028,1051)? ? ? ? Window Width
? ?? ? 窗寬窗位,不解釋
11.??(0028,1052)Rescale Intercept 和 (0028,1053)Rescale Slope
? ?? ?用于根據像素值計算原始值,比方說,CT可以用于計算HU值。
? ?? ?比方說:HU = Rescale Slope * X + Rescale Intercept.
12.??(0028,2110)Lossy Image Compression
? ?? ?當該值為1時,表明該圖像曾經經過有損壓縮處理。即使后來解壓縮后,再用非壓縮格式存儲和傳輸,該值也需要保持為1.
13.? ?(0028,2112)Lossy Image Compression Ratio
? ?? ?有損壓縮壓縮率。
對于?多?幀圖像,我們還需要讀取Number of Frames (0028,0008)來獲取幀數,然后,逐幀讀取Pixel Data。
對于彩*圖像,我們還需要讀取Planar configuration (0028,0006),它定義了各個彩色通道值在Pixel Data中排列的排列方式。
當此值為0的時候,它這樣排列的RGBRGBRGBRGBRGB。
當此值為1的時候,它是這樣排列的:RRRRR......GGGGG.......BBBBB。 對于多幀圖像,它是這樣排列的:第一幀的RRR..,第一幀的GGG...,第一幀的BBB...,第二幀的RRR..,第二幀的GGG...,第二幀的BBB...
總結
以上是生活随笔為你收集整理的【转】Dicom基础知识的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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