8月26日计算机视觉理论学习笔记——医疗影像分割
生活随笔
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8月26日计算机视觉理论学习笔记——医疗影像分割
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
文章目錄
- 前言
- 一、影像存儲方式
- 1、DICOM 醫學數字成像和通信標準
- 2、MHD/RAW
- 3、NRRD
- 二、醫學影像任務
- 三、改進的 U-NET
- 1、目標函數-Dice 系數
- 2、U-NET 未能解決的一些問題
- 四、3D U-NET
- 五、V-Net
- 六、FC-DensNet
前言
本文為8月26日計算機視覺理論學習筆記——醫療影像分割,分為六個章節:
- 影像存儲方式;
- 醫學影像任務;
- 改進的 U-NET;
- 3D U-NET;
- V-Net;
- FC-DensNet。
一、影像存儲方式
1、DICOM 醫學數字成像和通信標準
應用于:
- 放射醫療;
- 心血管成像;
- 放射診療診斷設備。
2、MHD/RAW
MND 文件里包含:
- RAW 文件——原始影像信息的頭信息,比如:圖片大小、拍攝日常;
3、NRRD
包含元數據和 RAW 信息,并進行了壓縮。
二、醫學影像任務
對 MRI 影像中的前列腺組織進行分割,即判斷出影像中的每一個像素點是否屬于前列腺組織。
三、改進的 U-NET
- 用于生物影響分割的深度學習模型;
- 全卷積神經網絡,輸入和輸出都是圖像,沒有全連接層。
1、目標函數-Dice 系數
Dice 距離用于度量兩個集合的相似性,可用于計算兩個字符串的相似度和圖形掩碼區域的差異,取值范圍為 0 到 1:
s=2∣X∩Y∣∣X∣+∣Y∣s = \frac{2|X \cap Y|}{|X| + |Y|} s=∣X∣+∣Y∣2∣X∩Y∣?
2、U-NET 未能解決的一些問題
四、3D U-NET
以 3D 數據作為輸入,并用相應的操作來處理數據,包括3D 卷積、3D 最大池和3D 向上卷積層。
- 假設:
- 輸入數據的維度為:[a1,a2,a3][a1, a2, a3][a1,a2,a3];
- 通道數:ccc;
- 過濾器大小:fff;
- 過濾器維度:f×f×f×cf\times f\times f\times cf×f×f×c;
- 過濾器數量:nnn;
- 三位卷積的最終輸出為:[a1?f+1,a2?f+1,a2?f+1,a3?f+1,n][a1 - f + 1, a2 - f + 1, a2 - f + 1, a3 - f + 1, n][a1?f+1,a2?f+1,a2?f+1,a3?f+1,n]。
五、V-Net
U-NET 的另一個 3D 版本。
- 殘差學習機制:
- 把縮小端的底層特征送入放大端的相應位置幫助重建高質量圖像,并且加速模型收斂;
- 每一個 stage 中也使用了躍層連接。
六、FC-DensNet
- Dense block 結構:
- 第一層輸入:x0x_0x0? 有 m個特征圖;
- 第一層輸出:x1x_1x1? 有 k個特征圖;
- k個特征圖與 m個特征圖串聯,作為第二層的輸入;
- 重復 n次;
- 第 n層的 layer 輸出后與前面的 layer 輸出合并,共有 n×k 個特征圖。
總結
以上是生活随笔為你收集整理的8月26日计算机视觉理论学习笔记——医疗影像分割的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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