ascp? -i /your-path-to/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.putty --mode recv --host ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov --user anonftp?? --file-list? SRR_Download_List.txt

4、用SRA tools把SRA格式轉(zhuǎn)換成fastq

命令：fastq-dump.2.3.5.2 -A SRR*.sra

5、OK，大功告成！

my test command：ascp? -i? /share/home/jialj/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.putty --mode recv --host ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov --user anonftp?? --file-list? SRR_Download_List_file_list.txt

原文來(lái)自：http://liuwei441005.blog.163.com/blog/static/13570581120144935013905

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的linux 基因组数据下载,linux下用Aspera从NCBI上下载SRA格式宏基因组数据的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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