DGL RDKit | 基于Attentive FP的分子性质线性模型
生活随笔
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DGL RDKit | 基于Attentive FP的分子性质线性模型
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基于分子圖的深度學習在化學和藥物領域非常熱門。
2019年8月13日JMC(Journal of Medicinal Chemistry)刊登了一篇文章“Pushing the Boundaries of Molecular Representation for Drug Discovery with the Graph Attention Mechanism”,介紹了一種基于注意力機制的圖神經網絡模型(Attentive FP)。該模型可以用于分子表征,在多個藥物發現相關的數據集上的預測表現達到當前最優,并且該模型所學到的內容具有可解釋性。
Attentive FP Attentive FP總體框架以及與同類的圖神經網絡模型比較DGL具有許多用于化學信息學、藥物與生物信息學任務的函數。
DGL開發人員提供了基于DGL實現的Attentive FP模型, 基于Attentive FP探索分子性質預測的線性模型。
總結
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