PyMol入门1
PyMol和Chimera的功能類似,據(jù)說Chimera難學一點,那就先從PyMol開始吧!
1. Wizard--demo
先了解PyMol可以展示什么。Wizard--demo--representations。線型,棒狀,球體,表面,網(wǎng),點,帶型和卡通。右邊偏下的Demonstrations工具欄里,可以一次點擊認識一下。
2. 導入PDB文件
三種打開PDB的方法:File--open 已經(jīng)下載好的PDB文件;File--Get PDB,輸入4字母PDB code,下載PDB文件;在命令框里輸入fetch PDB的4字母。
PDB文件儲存的地方。雙擊PDB文件打開PyMol,工作路徑為該PDB文件所在文件夾。直接打開PyMol,工作路徑為PyMol的安裝文件夾。File--Working Directory可查看當前工作路徑。?
3. 對象展示
右側中部對象工具欄,A--Action,S--Show,H--Hide,L--Label,C--Color。可以對object進行非常多操作,自己試試看。點擊object名字,灰色展示,黑色隱藏,跟PS有些類似。
4. 鼠標操作
按住左鍵拖拽--旋轉調整object展示角度。
按住滾輪拖拽--移動object在視野中的位置。
滑動滾輪--切割object,展示不同景深的層。
按住右鍵拖拽--調整object大小。
總結
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