华为机试HJ63:DNA序列
生活随笔
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华为机试HJ63:DNA序列
小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
作者:翟天保Steven
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題目描述:
一個(gè)DNA序列由A/C/G/T四個(gè)字母的排列組合組成。G和C的比例(定義為GC-Ratio)是序列中G和C兩個(gè)字母的總的出現(xiàn)次數(shù)除以總的字母數(shù)目(也就是序列長(zhǎng)度)。在基因工程中,這個(gè)比例非常重要。因?yàn)楦叩腉C-Ratio可能是基因的起始點(diǎn)。
給定一個(gè)很長(zhǎng)的DNA序列,以及限定的子串長(zhǎng)度N,請(qǐng)幫助研究人員在給出的DNA序列中從左往右找出GC-Ratio最高且長(zhǎng)度為N的第一個(gè)子串。
DNA序列為ACGT的子串有:ACG,CG,CGT等等,但是沒有AGT,CT等等
輸入描述:
輸入一個(gè)string型基因序列,和int型子串的長(zhǎng)度
輸出描述:
找出GC比例最高的子串,如果有多個(gè)則輸出第一個(gè)的子串
示例:
輸入:
ACGT 2輸出:
CG說明:
ACGT長(zhǎng)度為2的子串有AC,CG,GT3個(gè),其中AC和GT2個(gè)的GC-Ratio都為0.5,CG為1,故輸出CG解題思路:
本題為字符串操作題。輸入string基因序列和子串長(zhǎng)度后,挨個(gè)子串分析GC的比例,定位出最大GC-Ratio的子串輸出即可。
測(cè)試代碼:
#include <iostream> #include <string> #include <vector>using namespace std;int main() {string str;int length;while(cin>>str>>length){vector<string> ls;int size=str.size();float max=0.f;string result;for(int i=0;i<size-length+1;++i){string t=str.substr(i,length);float sum=0.f;for(int j=0;j<t.size();++j){if(t[j]=='G'||t[j]=='C')sum++;}float R=float(sum/t.size());if(R>max){max=R;result=t;}}cout<<result<<endl;}return 0; }總結(jié)
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