人类染色质开放状态数据库,ATACdb使用介绍
生活随笔
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人类染色质开放状态数据库,ATACdb使用介绍
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
對于轉錄因子預測而言,我們昨天的數據庫介紹當中也提到了。轉錄因子主要是通過識別DNA序列當中的基序(motif)來調控目標基因的。所以其實我們在知道了一個基因的motif的時候就差不多能找到這個轉錄因子都和哪些位置結合了。但是對于預測的結果和現實還是有區別的。因為真核生物的核DNA并不是裸露的,而是與組蛋白結合形成染色體的基本結構單位核小體,核小體再經逐步的壓縮折疊最終形成染色體高級結構。只有當DNA復制的時候,核小體才會打開,進而轉錄因子這些的才能進行調控。這部分打開的染色質,就叫開放染色質,打開的染色質允許其他調控因子結合的特性稱為染色質的可及性(chromatin accessibility)。
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因此對于預測一個轉錄因子調控的話,需要在其開放染色質的基礎上預測到的結果才算是準確的。所以今天就介紹一個預測人類染色體開放狀態的數據庫:?ATACdb[地址見文末].
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總結
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