在單細胞數(shù)據(jù)分析過程中，上游的拆庫定量，中游的分群注釋，目前的門檻是很低的了。但是解析細胞類型異質(zhì)性不應(yīng)止于這些，還可以看細胞群之間的通訊。當然，這方面我們介紹過CellChat：細胞間相互作用分析利器。CellChat是以信號通路為單位來計算細胞間交流狀態(tài)的，很多同學用cellphonedb來做基于配受體對的細胞間交流。今天，我們就來用經(jīng)典的pbmc3k數(shù)據(jù)跑一下cellphonedb，并嘗試可視化。

先放一張想象圖：

?

文章剩余內(nèi)容<<<

?

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的cellphonedb 及其可视化的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

如果覺得生活随笔網(wǎng)站內(nèi)容還不錯，歡迎將生活随笔推薦給好友。