tcga数据下载_TCGA数据下载（mRNA）
生活随笔
收集整理的這篇文章主要介紹了
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小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
進(jìn)入GDC網(wǎng)頁
https://portal.gdc.cancer.gov/
點擊Repository
點擊Cases，選擇需要研究的腫瘤樣本。以結(jié)腸癌為例，主要參數(shù)：【Primary Site】:colon;?【Program】:TCGA;?【Program】:TCGA-COAD;?
點擊Files，選擇文件類型。主要參數(shù)：【Dta Category】:
transcriptome profiling; 【Experimental Strategy】:RNA-seq; 【W(wǎng)orkflow Type】:HTseq-FPKM; 【Data Format】:txt。
加入你的購物車。
進(jìn)入購物車，下載文件：Manifest、Cart(該文件較大，需要一點時間)、Metadata、Clinical.JSON。
好了。
總結(jié)
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