精选| 2021年9月R新包推荐(第58期)
翻譯:黃小偉,目前就職有贊數據分析團隊!
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2021年9月,220個R新包收錄于CRAN(2021年8月份收錄160個),累計收錄約19,862個R包!此次選摘了40個R包(14個類別),分布結構如下:
一. 計算方法
1.?abmR: 提供運行agent-based models (ABM) 的工具,如 Gochanour 等人所述?(2021),?包括兩個基于Ornstein-Uhlenbeck 模型 (1930) 的運動函數.
2.?SemiEstimate: 實現了一種基于隱式分析的兩步牛頓-拉夫森(Newton-Raphson)迭代的改進方法.
3.?SimEngine: 支持在本地和集群計算環境中構造、維護、運行和調試統計模擬.
二. 數據
1.?asylum: 提供來自英國內政部的庇護和重新安置數據.
2.?hockeyR: 提供從 NHL.com 和 Hockey-Reference.com 抓取曲棍球比賽數據的功能,包括積分榜、球員統計數據和球衣號碼歷史記錄.
3. yowie: 提供1979年至2018年全國青年工資數據集和若干人口統計變量,包括:最高完成年級至高中的工資數據、高中輟學學生的工資數據、1979年調查年度人口統計數據等.
三. 藝術
1.?rfishdraw: 支持使用fishdraw JavaScript庫自動生成fish圖形.
四.?計量經濟
1.?COINr:實現復合指標和記分板的開發環境,包括構建(指標選擇、命名、插補、數據處理、歸一化、加權和聚合)、分析(多元分析、相關繪圖).
2.?spflow: 提供用于估計始發地-目的地流量的空間計量經濟模型的函數,該模型可能在因變量和解釋變量中表現出空間自相關.
五.?金融保險
1.?DOSPortfolio: 根據Bodnar等人(2021年)的推導,對在給定再分配點重建的全局最小方差投資組合的權重實施動態最優收縮估計.
2.?SPLICE: 擴展個人索賠模擬器( SynthETIC),以模擬保險索賠整個生命周期內發生的損失案例的演變.
六.?基因組學
1.?MAnorm2: 實現了一種用于標準化單個樣本或樣本組的 ChIP-seq 信號的方法,以及一個統計模型系統,用于調用兩個或多個生物條件之間的差異 ChIP-seq 信號.
2.?RevGadgets: 提供處理、可視化RevBayesphylogenetic圖形建模軟件中,復雜系統演化分析輸出的功能.
七. 機器學習ML
1.?morphemepiece: 提供通過表查找或修改的詞條標記化算法將文本標記化為語素的功能.
2.?NIMAA: 實現了一個數據挖掘管道,可以有效地發現數據之間的特殊關系.
八. 醫藥學
1.?gapclosing: 提供函數來估計在治療變量(例如大學)被均衡時持續存在的類別(例如黑人和白人)之間的差異.
2.?iDOVE: 實施一種非參數最大似然法,用于評估在交錯登記和時變社區傳播情況下針對SARS-CoV-2感染的潛在時變疫苗效力.
3.?powerly: 實現Constantin et al.(2021)提出的網絡模型樣本量計算方法,該方法采用三步遞歸算法的形式,在給定模型規范和性能指標的情況下,找到最佳樣本量.
4.?ppseq: 提供使用順序預測概率監測、設計臨床試驗的功能.
九.?網絡與圖形
1.?multigrapher: 實施Shafie(2015)介紹的分析多重圖的方法和模型,包括研究局部和全局特性以及擬合優度測試的方法.
2.?nevada:實現網絡值數據分析的統計框架,該框架利用了圖上分布空間的復雜性.
3.?robber: 如 Chabert-Liddell 等人所述,使用多種方法來計算具有二元相互作用的生態網絡的穩健性.
十. 科學
1.?argoFloats: 支持對 Argo 自主漂流剖面浮標記錄的海洋數據進行分析.
2.?biosurvey: 提供工具允許用戶規劃采樣點系統,以提高生物多樣性監測的效率.
3.?HostSwitch: 支持研究與當前和潛在宿主相互作用的有機體種群中宿主的動態變化.
十一. 統計學
1.?cvam: 擴展R對分類變量(因子)的實現,以處理粗化的觀察結果,并為粗化的分類數據(包括潛在類模型)實現了對數線性模型.
2.?JustifyAlpha: 通過避免Lindley悖論,或通過最小化或平衡錯誤率,為統計假設測試提供證明α水平的函數.
3.?sphunif: 提供函數來測試圓和超球面的均勻性.
4.?spatialRF: 實現自動生成和選擇隨機森林空間回歸的空間預測因子的方法.
5.?vdra: 實現三個協議,用于在多個數據伙伴之間對垂直分區的數據執行安全的線性、邏輯和Cox回歸,從而使數據不在數據伙伴之間共享.
十二. 時間序列
1.?GlarmaVarSel: 在高維稀疏GLARMA模型中實現變量選擇功能.
2.?mrf: 利用基于Haar小波變換的特征提取算法,實現了一種預測單變量時間序列的方法.
十三. 應用工具
1. colorblindcheck: 提供將色板與色覺缺陷模擬進行比較的功能,這些色覺缺陷包括雙目盲、原盲和三盲。它包括顏色之間距離的計算,并創建調色板之間差異的摘要和顏色視覺缺陷的模擬.
2.?filearray: 通過OpenMP使用千兆字節級別的多線程讀/寫實現用于內存不足計算的文件備份陣列.
3. httr2: 實現用于創建和修改HTTP請求、執行請求以及處理結果的工具。httr2是對httr的現代再改進,它使用基于管道的接口,解決了API包裝包面臨的更多問題.
4.?quadtree: 提供用于處理空間數據的區域四叉樹,從而允許可變大小的單元.
5.?tabxplor: 實現用于創建、操作和顏色高亮顯示交叉表的工具,并將其導出為Excel或HTML格式和顏色.
十四. 可視化
1.?bittermelon: 提供創建和修改位圖的功能,特別強調位圖字體及其圖示符,包括對十六進制和yaff位圖字體格式的本機讀/寫支持.
2.?d3po: 實現了一個Apache許可的Highcharter替代方案,該替代方案提供了用于降價和折扣的交互式可視化功能.
3.?ggHoriPlot:實現geom_horizon()和其他函數,以使用ggplot2構建水平圖.
4.?plotbb: 提供了實現基本R圖語法的概念證明.
5.?semptools: 實現用于自定義可以使用管道運算符鏈接的結構方程圖的函數.
說明:限于個人水平,錯誤之處難免,煩請批評指正,共同交流~
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總結
以上是生活随笔為你收集整理的精选| 2021年9月R新包推荐(第58期)的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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