開(kāi)課背景

生物信息學(xué)說(shuō)起來(lái)很好理解，可是對(duì)大部分想學(xué)習(xí)生信的人來(lái)說(shuō)，操作起來(lái)卻是有些棘手，無(wú)有頭緒。生信的研究?jī)?nèi)容主要包括兩個(gè)方面：首先，需要生物研究者利用實(shí)驗(yàn)收集、整理、儲(chǔ)存、獲取生物學(xué)數(shù)據(jù)；另一方面，需要依托數(shù)理信息科學(xué)的技術(shù)和方法管理和分析數(shù)據(jù)。如今工具開(kāi)發(fā)者（IT）和工具應(yīng)用者（Biologist）的界限越來(lái)越模糊，只要您是生信領(lǐng)域的工作者，都需要了解生物信息學(xué)分析基本知識(shí)。

生物學(xué)家產(chǎn)生數(shù)據(jù)的能力和興趣是沒(méi)有止境的，尤其隨著現(xiàn)代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，生物數(shù)據(jù)的積累不斷爆發(fā)。轉(zhuǎn)錄組是常用的分析解決生物問(wèn)題的手段之一，如何做好轉(zhuǎn)錄組設(shè)計(jì)、分析轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)、解讀轉(zhuǎn)錄組結(jié)果是必須的能力。Linux、Python、R是生物信息分析的三個(gè)程序基礎(chǔ)，掌握基礎(chǔ)原理和程序知識(shí)有助于我們提高轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的效率。

生信學(xué)習(xí)是一個(gè)曲折的過(guò)程，但是只要你找準(zhǔn)方向并堅(jiān)持學(xué)習(xí)，就不難。為此，易生信在8月為大家推出一期連續(xù)5天的暑期線下課程，幫您清掃生信道路上眼花繚亂的障礙。本次培訓(xùn)課將從最基礎(chǔ)的測(cè)序原理、數(shù)據(jù)挖掘入手，實(shí)踐操作整套轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析流程，讓您有能力完成分析。然后再把流程拆解開(kāi)，幫您實(shí)現(xiàn)自主定制分析和可視化。

課程安排

第一天 2018.8.8

高通量測(cè)序的應(yīng)用、設(shè)計(jì)和案例分享

高通量測(cè)序原理、注意事項(xiàng)

轉(zhuǎn)錄組分析流程和結(jié)果解讀

Linux基礎(chǔ)

R基礎(chǔ)

第二天 2018.8.9

Linux軟件安裝套路和轉(zhuǎn)錄組分析軟件自動(dòng)安裝

轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)戰(zhàn)和解讀（比對(duì)、定量、差異、富集、WGCNA）

第三天 2018.8.10

Linux進(jìn)階-轉(zhuǎn)錄組分析流程的深入解讀和結(jié)果轉(zhuǎn)換提取

第四天 2018.8.11

R進(jìn)階-轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘和可視化（PCA，熱圖聚類，火山，富集圖，箱線圖等）

第五天 2018.8.12

Python編程實(shí)戰(zhàn)-轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果提取和轉(zhuǎn)換

您能學(xué)到什么

掌握二代測(cè)序原理和轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目設(shè)計(jì)、解讀方法

掌握Linux、R和Python用于數(shù)據(jù)分析的技能

獨(dú)立進(jìn)行轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)分析和解讀的能力

轉(zhuǎn)錄組后續(xù)定制分析的能力

勤加練習(xí)即可快速入手同類分析方法

課程框架概覽

主講老師

主講老師包括中科院微生物所、遺傳發(fā)育所、基因組所、生物物理所等多名本領(lǐng)域一線技術(shù)專家。

劉永鑫，博士，中科院遺傳發(fā)育所，微生物組專家，致力于16S和宏基因組的研究和推廣，運(yùn)營(yíng)有數(shù)十萬(wàn)關(guān)注度的《宏基因組》微信公眾號(hào)。

陳同，博士，2015畢業(yè)于中科院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所，生物信息專業(yè)，在Cell Stem Cell，NAR等高水平雜志以第一作者或主要作者發(fā)表文章，運(yùn)營(yíng)有數(shù)萬(wàn)關(guān)注度的《生信寶典》微信公眾號(hào)。

Chen Tong*, Hao Ya-Juan*, Zhang Ying*, Li Miao-Miao*, Wang Meng, Han Weifang, Wu Yongsheng, Lv Ying, Hao Jie, Wang Libin, Li Ang, Yang Ying, Jin Kang-Xuan, Zhao Xu, Li Yuhuan, Ping Xiao-Li, Lai Wei-Yi, Wu Li-Gang, Jiang Guibin, Wang Hai-Lin, Sang Lisi, Wang Xiu-Jie, Yang Yun-Gui, and Zhou Qi. (2015) m6A RNA methylation is regulated by microRNAs and promotes reprogramming to pluripotency. Cell Stem Cell 16, 289–301 (cover story)

Cui Yi*, Xiao Zhifeng*, Chen Tong*, Wei Jianshu, Chen Lei, Liu Lijun, Chen Bing, Wang Xiujie, Li Xiaoran, and Dai Jianwu. (2014) The miR-7 identified from collagen biomaterial based 3-D cultured cells regulates neural stem cell differentiation. Stem Cells and Development 23, 4: 393-405. (*co-first author)

Wu Hua-Jun*, Ma Ying-Ke*, Chen Tong, Wang Meng and Wang Xiu-Jie. (2012) PsRobot: a web-based plant small RNA meta-analysis toolbox. Nucleic Acids Research 40:W22-W28.

助教團(tuán)隊(duì)

十余名科學(xué)院、清華、北大碩士、博士，輪值講師和助教，輔助學(xué)員學(xué)習(xí)和矯正教授過(guò)程中不足的點(diǎn)。

課程福利

贈(zèng)送價(jià)值約3000元的Linux、R、Python、轉(zhuǎn)錄組視頻和教案（按照?qǐng)?bào)名內(nèi)容贈(zèng)送相應(yīng)在線課）

報(bào)名后即可進(jìn)入學(xué)習(xí)群，助教發(fā)布學(xué)習(xí)計(jì)劃，提前熟悉基礎(chǔ)知識(shí)

學(xué)習(xí)群一直保留，供大家交流解決問(wèn)題

提供易漢博基因科技兼職助教機(jī)會(huì)、實(shí)習(xí)機(jī)會(huì)或工作機(jī)會(huì)

報(bào)名還有優(yōu)惠政策（見(jiàn)下方）

課程價(jià)格

最優(yōu)惠價(jià)格：轉(zhuǎn)發(fā)減500，五人同時(shí)報(bào)名各減500，贈(zèng)送課程338，等同于2512元學(xué)習(xí)前兩天的轉(zhuǎn)錄組。

時(shí)間地點(diǎn)

時(shí)間：

2018-08-08 到 2018-08-12 (五天線下講解實(shí)戰(zhàn))

每天早9點(diǎn)到晚7點(diǎn)，半封閉式教學(xué) 報(bào)到時(shí)間：當(dāng)天

地點(diǎn)：北京市西城區(qū)鼓樓明德大廈 (北京市舊鼓樓大街47號(hào)院2號(hào))))

注意事項(xiàng)

需自備筆記本電腦，系統(tǒng)不限。課程實(shí)踐需要會(huì)提供云計(jì)算平臺(tái)

培訓(xùn)班所有數(shù)據(jù)，文檔為內(nèi)部資料，僅供參閱，未經(jīng)允許不得翻印外傳登刊

上課期間禁止錄音，錄像

成功付款的學(xué)員，若臨時(shí)有緊急事情不能到來(lái)的，可申請(qǐng)延期，更換后續(xù)培訓(xùn)班；也可申請(qǐng)退款

若開(kāi)課2周 (含) 前申請(qǐng)退款可退還85%費(fèi)用；開(kāi)課3個(gè)工作日 (含) 前申請(qǐng)退款退還70%的費(fèi)用

不可先延期再退款

學(xué)習(xí)建議：

這次課程是把最開(kāi)始的4門課程

（轉(zhuǎn)錄組、R、Python和Linux）

打包在一起的集中授課

前兩天滿足基本分析，后3天實(shí)現(xiàn)定制進(jìn)階

建議上課前聽(tīng)完贈(zèng)送的視頻課程（或視頻節(jié)選），帶著問(wèn)題來(lái)

做的好這可能是你最后一次參加生信培訓(xùn)

報(bào)名網(wǎng)站： http://www.ehbio.com/Training

轉(zhuǎn)錄組研究

• 39個(gè)轉(zhuǎn)錄組分析工具，120種組合評(píng)估(轉(zhuǎn)錄組分析工具哪家強(qiáng)-導(dǎo)讀版)
• 39個(gè)轉(zhuǎn)錄組分析工具，120種組合評(píng)估(轉(zhuǎn)錄組分析工具大比拼 （完整翻譯版）)
• 無(wú)參轉(zhuǎn)錄組分析工具評(píng)估和流程展示
• 120分的轉(zhuǎn)錄組試題 （第一份答案）
• 120分的轉(zhuǎn)錄組試題（第二份答案）
• 120分的轉(zhuǎn)錄組試題（第三份答案）
• DESeq2差異基因分析和批次效應(yīng)移除

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的易生信极高性价比暑期黑马集训 -- 低至2500每人的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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