UA MATH571B 试验设计III 单因素试验设计3
UA MATH571B 試驗設計III 單因素試驗設計3
- Contrast
- 多個contrast的聯合推斷
- 配對比較
- Tukey檢驗
- Fisher Least Significant Difference方法
- Dunnett方法
在單因素ANOVA模型中,有時需要對treatment effect做一些其他比較。以下方法就是用來各種不同的比較的。
Contrast
在均值模型中
yij=μi+?ij,?ij~iidN(0,σ2)i=1,2,?,a;j=1,2,?,ny_{ij} = \mu_i+ \epsilon_{ij},\epsilon_{ij}\sim_{iid}N(0,\sigma^2)\\ i = 1,2,\cdots,a; j=1,2,\cdots,n yij?=μi?+?ij?,?ij?~iid?N(0,σ2)i=1,2,?,a;j=1,2,?,n
假設要做下列假設檢驗
H0:L=∑i=1aciμi=L0H_0:L = \sum_{i=1}^a c_i \mu_i=L_0 H0?:L=i=1∑a?ci?μi?=L0?
其中cic_ici?可以是任何常數。先考慮LLL的估計量
L^=∑i=1aciμ^i=∑i=1aciyˉi.\hat{L} = \sum_{i=1}^a c_i \hat{\mu}_i = \sum_{i=1}^a c_i \bar{y}_{i.} L^=i=1∑a?ci?μ^?i?=i=1∑a?ci?yˉ?i.?
顯然這個估計量是正態的,其方差為
Var(L^)=∑i=1aci2Var(yˉi.)=∑i=1aci2σ2niVar(\hat{L}) = \sum_{i=1}^a c_i^2 Var(\bar{y}_{i.}) =\sum_{i=1}^a c_i^2 \frac{\sigma^2}{n_i} Var(L^)=i=1∑a?ci2?Var(yˉ?i.?)=i=1∑a?ci2?ni?σ2?
其中σ2\sigma^2σ2的估計量是MSEMSEMSE,由此可以構造t統計量
L^?L0MSE∑i=1aci2ni~t(N?a)\frac{\hat{L}-L_0}{\sqrt{MSE \sum_{i=1}^a \frac{c_i^2 }{n_i}}} \sim t(N-a) MSE∑i=1a?ni?ci2???L^?L0??~t(N?a)
用t檢驗來做。
在上面的線性組合中,如果∑i=1aci=0\sum_{i=1}^a c_i=0∑i=1a?ci?=0,則稱這樣的線性組合為一個contrast,定義此時的線性組合為Γ=∑i=1aciμi\Gamma = \sum_{i=1}^a c_i\mu_iΓ=∑i=1a?ci?μi?,通常關于constrast的檢驗是H0:Γ=0H_0:\Gamma=0H0?:Γ=0,這個檢驗也用t檢驗做。如果兩個contrast的系數cic_ici?和did_idi?滿足
∑i=1acidini=0\sum_{i=1}^a c_id_in_i=0 i=1∑a?ci?di?ni?=0
則稱這兩個contrast正交。需要注意的是contrast是在試驗之前要設計好的,避免做了試驗拿到了數據之后再來選哪些檢驗能顯著!
多個contrast的聯合推斷
假設要做多個contrast的假設檢驗
H0:Γ1=Γ10,?,Γm=Γm0H_0:\Gamma_1=\Gamma_{10},\cdots,\Gamma_m=\Gamma_{m0} H0?:Γ1?=Γ10?,?,Γm?=Γm0?
假設CI1,?,CImCI_1,\cdots,CI_mCI1?,?,CIm?是每一個contrast的100(1?α)%100(1-\alpha)\%100(1?α)%置信區間,則
P(Γi0?CIi∣H0)=αP(\Gamma_{i0} \notin CI_i|H_0)=\alphaP(Γi0?∈/?CIi?∣H0?)=α
但要要拒絕原假設,只需要任一Γi0?CIi\Gamma_{i0} \notin CI_iΓi0?∈/?CIi?,根據Bonferroni不等式,假設要讓在原假設成立時拒絕原假設的概率保持為α\alphaα,需要P(Γi0?CIi∣H0)=α′P(\Gamma_{i0} \notin CI_i|H_0)=\alpha'P(Γi0?∈/?CIi?∣H0?)=α′
P(atleastoneiΓi0?CIi∣H0)≤∑i=1mP(Γi0?CIi∣H0)=mα′P(at\ least\ one\ i\, \Gamma_{i0} \notin CI_i|H_0) \le \sum_{i=1}^m P(\Gamma_{i0} \notin CI_i|H_0) = m\alpha' P(at?least?one?iΓi0?∈/?CIi?∣H0?)≤i=1∑m?P(Γi0?∈/?CIi?∣H0?)=mα′
近似地可以有α′=α/m\alpha'=\alpha/mα′=α/m。如果這些constrastconstrastconstrast是正交了,它們的估計量就是獨立的,因此上式可以直接取等,并且可以用一個ANOVA同時做這個檢驗。α′=α/m\alpha'=\alpha/mα′=α/m表明如果希望假陽性是α\alphaα,那么每一個置信區間CIiCI_iCIi?需要用置信水平100(1?α/m)%100(1-\alpha/m)\%100(1?α/m)%來構造,這種做聯合推斷的調整叫Bonferroni調整。
另一種做聯合推斷的方法是Scheffe方法。根據Scheffe方法構造的單個contrast的置信區間為
Γ^i?(a?1)Fα,a?1,N?aMSE∑i=1aci2ni≤Γi≤Γ^i+(a?1)Fα,a?1,N?aMSE∑i=1aci2ni≤Γi\hat{\Gamma}_i - \sqrt{(a-1)F_{\alpha,a-1,N-a}} \sqrt{MSE \sum_{i=1}^a \frac{c_i^2 }{n_i}}\le \Gamma_i \le \hat{\Gamma}_i + \sqrt{(a-1)F_{\alpha,a-1,N-a}} \sqrt{MSE \sum_{i=1}^a \frac{c_i^2 }{n_i}}\le \Gamma_i Γ^i??(a?1)Fα,a?1,N?a??MSEi=1∑a?ni?ci2???≤Γi?≤Γ^i?+(a?1)Fα,a?1,N?a??MSEi=1∑a?ni?ci2???≤Γi?
如果mmm比較大就用Scheffe,如果mmm比較小就用Bonferroni。
配對比較
假設要對所有的treatment group mean做兩兩比較,?i≠j\forall i \ne j?i?=j
H0:μi=μjHa:μi≠μjH_0: \mu_i = \mu_j \\ H_a: \mu_i \ne \mu_j H0?:μi?=μj?Ha?:μi??=μj?
Tukey檢驗
如果試驗是平衡的,可以用Tukey檢驗,如果試驗是不平衡的,可以用Tukey-Kramer方法。因為思路都一樣,這里介紹Tukey檢驗。首先構造
q=yˉmax?yˉminMSE/nq=\frac{\bar{y}_{max}-\bar{y}_{min}}{\sqrt{MSE/n}} q=MSE/n?yˉ?max??yˉ?min??
其中yˉmax\bar{y}_{max}yˉ?max?與yˉmin\bar{y}_{min}yˉ?min?是待比較的ppp個組內平均的最大值和最小值,它的分布可以查表,記為qα(p,f)q_{\alpha}(p,f)qα?(p,f),其中α\alphaα是百分比,qαq_{\alpha}qα?代表上分位點,fff是MSEMSEMSE的自由度。Tukey檢驗給出的μi?μj\mu_i-\mu_jμi??μj?的置信區間邊界
yˉi.?yˉj.±qα(a,f)MSE/n\bar{y}_{i.} - \bar{y}_{j.} \pm q_{\alpha}(a,f)\sqrt{MSE/n} yˉ?i.??yˉ?j.?±qα?(a,f)MSE/n?
Fisher Least Significant Difference方法
因為兩總體比較μi?μj\mu_i-\mu_jμi??μj?的置信區間邊界可以寫成
yˉi.?yˉj.±tα/2,N?aMSE(1ni+1nj)\bar{y}_{i.} - \bar{y}_{j.} \pm t_{\alpha/2,N-a}\sqrt{MSE(\frac{1}{n_i}+\frac{1}{n_j})} yˉ?i.??yˉ?j.?±tα/2,N?a?MSE(ni?1?+nj?1?)?
定義
LSD=tα/2,N?aMSE(1ni+1nj)LSD = t_{\alpha/2,N-a}\sqrt{MSE(\frac{1}{n_i}+\frac{1}{n_j})} LSD=tα/2,N?a?MSE(ni?1?+nj?1?)?
為Least Significant Difference,代表置信區間的長度。用這個值進行比較的過程是計算∣yˉi.?yˉj.∣|\bar{y}_{i.} - \bar{y}_{j.}|∣yˉ?i.??yˉ?j.?∣,如果比LSD大就認為μi?μj\mu_i-\mu_jμi??μj?顯著異于0。
Dunnett方法
如果有一組是對照組,那么實驗組的結果都要與它比較。假設對照組是第aaa組,則需要做的假設檢驗是?i=1,?,a?1\forall i=1,\cdots,a-1?i=1,?,a?1,
H0:μi=μaHa:μi≠μaH_0: \mu_i = \mu_a \\ H_a:\mu_i \ne \mu_a H0?:μi?=μa?Ha?:μi??=μa?
Dunnett方法與Fisher LSD比較像,都是給一個判別值判斷均值的差是否超過了判別值。Dunnett方法的判別值是
dα(a?1,N?a)MSE(1ni+1nj)d_{\alpha}(a-1,N-a)\sqrt{MSE(\frac{1}{n_i}+\frac{1}{n_j})} dα?(a?1,N?a)MSE(ni?1?+nj?1?)?
需要注意的是α\alphaα是這a?1a-1a?1個假設檢驗的聯合type I error。
總結
以上是生活随笔為你收集整理的UA MATH571B 试验设计III 单因素试验设计3的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
- 上一篇: UA MATH571B 试验设计III
- 下一篇: UA MATH571B 试验设计IV R