有關(guān)install.packages()函數(shù)的詳見：R包 package?的安裝（install.packages函數(shù)詳解）

R的包（package）通常有兩種：
1 binary package：這種包屬于即得即用型（ready-to-use），但是依賴與平臺，即Win和Linux平臺下不同。
2 Source package:?此類包可以跨平臺使用，但用之前需要處理或者編譯（compiled）。

以下一些常用的包相關(guān)的函數(shù)：
.libPaths()：查看包的安裝目錄
library()：查看已經(jīng)安裝的包目錄
library(mypackage)：載入mypackage包

getOption("defaultPackages")：查看啟動R時自動載入的包。
help(package = 'mypackage')：查看‘mypackage’的幫助
args(function)：查看函數(shù)的參數(shù)
example(function)：自動運(yùn)行該函數(shù)幫助文檔中的例子，很贊！
demo("package")：展示一些包中demostration，需要再看下？？
vignette('mypackage')：有的包，特別是bioconductor的包有vignette，用函數(shù)查看
openVignette('mypackage')：這個函數(shù)也可以查看vignette，更好用一些
RSiteSearch("helpinfor")：搜索R網(wǎng)站上的“helpinfor”相關(guān)信息
help.start()：查看已經(jīng)安裝包的詳細(xì)HTML文檔，這個命令非常爽。
更新：
search()：查看當(dāng)前載入的包

sessionInfo()：查看R中載入的包
methods()：查看某個S3泛型函數(shù)中所有的方法或者一個類中所有的方法（S3：S version 3）

showMethods(class = "myClass")：查看S4類的方法

findMethods("myMethods")：查看method的代碼

class(myObject)：查看某個對象的類
getClass(“class/package”)：查看某個class或者包的具體內(nèi)容

getSlots("class")：查看某個class的slot

slotNames(MyObject)：查看某個對象的slot。

可以使用Myobject@slotNames訪問對象的slot值，這個@設(shè)計實(shí)在是太爽了，可以連續(xù)用。

查詢包內(nèi)信息：1.??function/method：查看某個“函數(shù)”或者“方法”的詳細(xì)內(nèi)容
?????????????????????????2.?class?graph::graph：查看“組”的詳細(xì)內(nèi)容的一個例子。這個例子的來源是查詢graph包時候，查看其中class的信息，輸入??graph后出現(xiàn)一個graph::graph-class。
ls("package:mypackage")：查看"mypackage"中的所有對象。

安裝source package方法

1?在終端輸入?# R CMD INSTALL /.../mypackage.tar.gz
使用此方法，需要解決包依賴問題，即安裝此包所依賴的包，安裝過程有提示

2?也可以使用R的install.packages()函數(shù)安裝
???回答：可以使用install.packages()函數(shù)安裝，而且比較簡便，即聯(lián)網(wǎng)即可裝，裝了就可用。
???#?R
???>?install.packages('mypackage')

???回答2：可以使用install.packages()安裝本地下載的包，尤其適用于在服務(wù)器上安裝包

???$ R

???>?install.packages( c("XML_0.99-5.tar.gz", "http://www.cnblogs.com/Interfaces/Perl/RSPerl_0.8-0.tar.gz"), repos = NULL, configure.args =?c(XML = '--with-xml-config=xml-config', RSPerl = "--with-modules='IO Fcntl'"))

3 Bioconductor的安裝方法
>?source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
>?biocLite("mypackage")

?

4?卸載package

remove.packages("mypackage")

remove.packages(utils)
remove.packages()所屬R語言包：utils

remove.packages(pkgs, lib)
參數(shù)：pkgs
a character vector with the names of the packages to be removed.
要刪除的軟件包的名稱與特征向量。

參數(shù)：lib
a character vector giving the library directories to remove the packages from. ?If missing, defaults to the first element in .libPaths().
給一個字符向量庫目錄中刪除軟件包。如果缺少，默認(rèn)的第一個元素在.libPaths()

?

5?查看R及其package的version

R version:?version?或者?R.version

R package version:?

?

6?更新包

update.packages( )??可以定期執(zhí)行以下

?

7?使用別人安裝的包

修改.bashrc文件，添加環(huán)境變量R的lib路徑

export R_LIBS=/home/.../R/lib64/R/library

R中用.libPaths()函數(shù)查看lib路徑，如果有多個lib,install.packages()默認(rèn)是安裝在第一個目錄下

轉(zhuǎn)載于:https://www.cnblogs.com/triple-y/p/11181909.html

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的R语言包在linux上的安装等知识的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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