科学家呼吁:第一时间共享新型冠状病毒基因组序列
來點(diǎn)科學(xué)/中青報(bào)·中青在線
記者今天從中國科學(xué)院北京基因組研究所國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心獲悉,1月26日,國家生物信息中心/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心收錄由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所提供的5株2019新型冠狀病毒全基因組序列。
這是自2019年12月該病爆發(fā)以來,國內(nèi)公共數(shù)據(jù)平臺(tái)首次公開發(fā)布數(shù)據(jù)。
據(jù)國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心主任鮑一明介紹,從2020年1月以來,陸續(xù)有30余株2019新型冠狀病毒的基因組序列被國內(nèi)外科學(xué)家破譯,絕大部分?jǐn)?shù)據(jù)都遞交到由德國建立的全球流感序列數(shù)據(jù)庫(GISAID)系統(tǒng)。
從該數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)獲取數(shù)據(jù)需要注冊(cè)賬號(hào)并經(jīng)過審核,獲得權(quán)限的研究人員才可登錄系統(tǒng)瀏覽數(shù)據(jù),并且只能單個(gè)下載基因組序列。這就造成了中國產(chǎn)生的數(shù)據(jù)需要先出口再入口的使用模式和現(xiàn)象,而且數(shù)據(jù)下載十分繁瑣費(fèi)時(shí)。
2020年1月22日,我國搭建的新型冠狀病毒信息庫(https://bigd.big.ac.cn/ncov)正式上線。
國家生物信息中心/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心一直致力于構(gòu)建國家級(jí)組學(xué)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)與共享公共平臺(tái),力爭第一時(shí)間為國內(nèi)乃至全球科學(xué)家提供基因組數(shù)據(jù)的存管用服務(wù)。此次疫情爆發(fā)后,新型冠狀病毒信息庫上線,保持該病毒基因組數(shù)據(jù)發(fā)布動(dòng)態(tài),持續(xù)為國內(nèi)外科研人員提供方便快捷的數(shù)據(jù)檢索及下載資源。
此次發(fā)布的5株2019新型冠狀病毒基因組序列的序列號(hào)為GWHABKF00000000、
GWHABKG00000000、
總結(jié)
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