如何将二代测序技术应用到临床医学领域?以及存在搭建二代平台遇到的困难?
生活随笔
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如何将二代测序技术应用到临床医学领域?以及存在搭建二代平台遇到的困难?
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第二代測序技術(shù)-大規(guī)模平行測序 大規(guī)模平行測序平臺(massively parallel DNA sequencing platform)的出現(xiàn)不僅令DNA測序費用降到了以前的百分之一,還讓基因組測序這項以前專屬于大型測序中心的“特權(quán)”能夠被眾多研究人員分享。新一代DNA測序技術(shù)有助于人們以更低廉的價格,更全面、更深入地分析基因組、轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)之間交互作用組的各項數(shù)據(jù)。市面上出現(xiàn)了很多新一代測序儀產(chǎn)品,例如美國Roche Applied Science公司的454基因組測序儀、美國Illumina公司和英國Solexa technology公司合作開發(fā)的Illumina測序儀、美國Applied Biosystems公司的SOLiD測序儀。Illumina/Solexa Genome Analyzer測序的基本原理是邊合成邊測序。并且包 括 全 基 因 組 重 測 序 (whole-genomesequencing,WGS)、全外顯子組測序 (whole-exomesequencing,WES) 和目標區(qū)域測序 (Targeted regionssequencing,TRS),它們同屬于新一代測序技術(shù)??傮w而言,NGS 技術(shù)具有通量大、時間短、精確度高和信息量豐富等優(yōu)點,使得遺傳學者可以在短時間內(nèi)對感興趣的基因進行精確定位。但這些不同的測序技術(shù)在測序范圍、數(shù)據(jù)分析量以及測序費用和時間等方面又有很大差別,如果選擇適合的方法,對于臨床診斷和科學研究將起到事半功倍的作用。因此我相信選擇合適的測序方法和適合的測序儀器應該是一個很大的問題吧。
總結(jié)
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