超深度测序技术在 HBV 准种研究中有什么进展吗?
生活随笔
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超深度测序技术在 HBV 准种研究中有什么进展吗?
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
有啊,1993 年,Blum 首先提出乙型肝炎病毒 (HBV) 存在準(zhǔn)種的假說(shuō)。HBV 復(fù)制過(guò)程中的高復(fù)制率和高出錯(cuò)率,導(dǎo)致大量變異株的產(chǎn)生,這些變異株組成了 HBV 準(zhǔn)種,超深度測(cè)序突破了 Sanger 測(cè)序的局限,對(duì)于混合樣本中的每對(duì)堿基可以達(dá)到 10 000 次以上的覆蓋,高通量和高敏感性的特點(diǎn)使之前很多難以開(kāi)展的研究得以實(shí)現(xiàn),為 HBV 準(zhǔn)種提供了一個(gè)強(qiáng)有力的研究工具。Margeridon-Thermet 等分別用超深度測(cè)序和 PCR 直接測(cè)序的方法對(duì) 20 份接受過(guò) NAs (LAM、阿德福韋酯和恩替卡韋) 治療和 17 份未接受過(guò) NAs 治療的乙型肝炎患者血清進(jìn)行分析,檢測(cè)其相關(guān)突變位點(diǎn),對(duì)于接受過(guò) NAs 治療的患者,每個(gè)血清樣本中,應(yīng)用 UDS 可以比直接測(cè)序法平均多檢測(cè)到 4.6 個(gè)突變位點(diǎn),顯現(xiàn)了 UDS 檢測(cè) HBV 耐藥突變的優(yōu)勢(shì)。
總結(jié)
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