新一代测序技术的发展瓶颈有哪些?
生活随笔
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新一代测序技术的发展瓶颈有哪些?
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
一項(xiàng)新一代測(cè)序技術(shù)NGS使用情況的用戶調(diào)查活動(dòng)的調(diào)查結(jié)果顯示,目前新一代測(cè)序技術(shù)流程中最大的瓶頸是分析和注釋數(shù)據(jù)所花費(fèi)的時(shí)間太長(zhǎng),大約有 32%的受訪者都將這些工作外包給生物信息學(xué)同事,或者第三方公司。目前大部分新一代測(cè)序技術(shù)研究工作主要集中在基礎(chǔ)研究和疾病相關(guān)的研究方面。這一調(diào)查受訪者中約有40%的研究人員參與了新一代測(cè)序研究,不過(guò)下半年的人數(shù)可能還會(huì)增加4%,還有一半受訪者表示在未來(lái)的兩年內(nèi),將計(jì)劃進(jìn)行著方面的研究。調(diào)查顯示,數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和操作成本,這兩者是購(gòu)買測(cè)序設(shè)備的最重要采購(gòu)標(biāo)準(zhǔn)。但是如果兩種儀器的數(shù)據(jù)精確度相同,那么操作成本、應(yīng)用的廣泛性,讀長(zhǎng)和通量就成為了第二重要的參考因素。NGS 工作流程的最大瓶頸是分析和注釋數(shù)據(jù)所花費(fèi)的時(shí)間太長(zhǎng)。有四分之一的研究人員表示NGS數(shù)據(jù)分析需要至少一周時(shí)間,還有32%的受訪者將這一工作外包給其他生物信息學(xué)組同事或第三方公司。數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和操作成本,這兩者是購(gòu)買測(cè)序設(shè)備的最重要采購(gòu)標(biāo)準(zhǔn)。但是如果兩種儀器的數(shù)據(jù)精確度相同,那么操作成本、應(yīng)用的廣泛性,讀長(zhǎng)和通量就成為了第二重要的參考因素。每年NGS 數(shù)據(jù)注釋軟件的預(yù)算是外包費(fèi)用的兩倍多,目前NGS 軟件整體平均預(yù)算約為8,500 美元,不過(guò)這一數(shù)據(jù)還表明,內(nèi)部和外包所花費(fèi)的費(fèi)用存在巨大差異,前者的費(fèi)用約為13,000-14,000美元,后者的費(fèi)用為4500-6300 美元)。
設(shè)備性能不夠穩(wěn)定!這個(gè)在中國(guó)也就幾臺(tái)新一代測(cè)序儀,但據(jù)說(shuō)使用起來(lái)并不是很方便,操作不夠簡(jiǎn)便,最主要的是性能不夠穩(wěn)定,測(cè)序起來(lái)問(wèn)題比較多,一般很少使用。這樣的設(shè)備肯定會(huì)阻礙技術(shù)的發(fā)展,希望能早日解決。
如果是有大批樣本一起上機(jī)的話,那么每個(gè)樣本平攤下來(lái)價(jià)格就會(huì)比較便宜了。
設(shè)備性能不夠穩(wěn)定!這個(gè)在中國(guó)也就幾臺(tái)新一代測(cè)序儀,但據(jù)說(shuō)使用起來(lái)并不是很方便,操作不夠簡(jiǎn)便,最主要的是性能不夠穩(wěn)定,測(cè)序起來(lái)問(wèn)題比較多,一般很少使用。這樣的設(shè)備肯定會(huì)阻礙技術(shù)的發(fā)展,希望能早日解決。
如果是有大批樣本一起上機(jī)的話,那么每個(gè)樣本平攤下來(lái)價(jià)格就會(huì)比較便宜了。
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的新一代测序技术的发展瓶颈有哪些?的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。
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