有人了解人群相关分析法吗?
生活随笔
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有人了解人群相关分析法吗?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
補充一點:標記位點與致病基因越近,且突變率越低,雜合度越高,則用標記檢測致病基因位點的機率越高。LDM法假設在人群中某一致病基因起源于同一遠祖,經過若干代的傳遞,那些與致病基因緊密連鎖的基因或DNA 標記被一起分配到不同的患病個體。研究那些表面上無親緣關系的患者是否有相同的DNA 標記的等位基因,根據該DNA 標記可以得到待研究基因在染色體上的定位。
人群相關分析法,又稱連鎖不平衡定位(linkage disequilibrium mapping, LDM)法,原理是在一定人群中設置患者組和對照組,在可能的候選致病基因附近選擇遺傳標記,通過觀察標記位點與致病基因位點間存在連鎖不平衡現象,得到某一遺傳標記和引起疾病基因關聯的相對危險度。LDM法適合在人口流動極小,相對同源的人群中進行。該類人群遺傳背景及環境相近,但患者間親緣關系遠(較家系分析而言),故其連鎖不平衡作用大,此時定位基因所需遺傳標記及研究的患者數較一般人群相關性分析少。其優點有:①無親緣關系患者樣本容易隨機采集,并完全符合群體中疾病的臨床譜;②為非參數分析;③檢出力高于家系連鎖分析,在復雜病研究中不但可以檢出主效基因,而且可以檢出相對風險率小于5.0的次效基因;④檢出的相關位點與致病突變的距離多在1cM以內,而家系連鎖分析則為2~10cM;⑤可提示相關位點或基因的傳遞方式及效應性質,并可由亞組分析發現疾病的遺傳異質性。缺點:在種群組成差異的兩組間,會因標記位點等位基因頻率及易感基因頻率差異導致假陽性結果,即群體分層現象。
人群相關分析法,又稱連鎖不平衡定位(linkage disequilibrium mapping, LDM)法,原理是在一定人群中設置患者組和對照組,在可能的候選致病基因附近選擇遺傳標記,通過觀察標記位點與致病基因位點間存在連鎖不平衡現象,得到某一遺傳標記和引起疾病基因關聯的相對危險度。LDM法適合在人口流動極小,相對同源的人群中進行。該類人群遺傳背景及環境相近,但患者間親緣關系遠(較家系分析而言),故其連鎖不平衡作用大,此時定位基因所需遺傳標記及研究的患者數較一般人群相關性分析少。其優點有:①無親緣關系患者樣本容易隨機采集,并完全符合群體中疾病的臨床譜;②為非參數分析;③檢出力高于家系連鎖分析,在復雜病研究中不但可以檢出主效基因,而且可以檢出相對風險率小于5.0的次效基因;④檢出的相關位點與致病突變的距離多在1cM以內,而家系連鎖分析則為2~10cM;⑤可提示相關位點或基因的傳遞方式及效應性質,并可由亞組分析發現疾病的遺傳異質性。缺點:在種群組成差異的兩組間,會因標記位點等位基因頻率及易感基因頻率差異導致假陽性結果,即群體分層現象。
總結
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