大家通常比較關注這個問題，然而事實并非如此。組裝結果是評價一個物種基因組項目結果好壞的重要的指標，如Scaffold N50的長度、基因組的覆蓋率等。其中，Scaffold N50是指通過shotgun文庫測序的數據及mate pair文庫的數據組裝后得到的所有Scaffold按照長度從大到小的順序依次累加，待總和為所有Scaffold總長一半時遇到的那個Scaffold長度。因此，Scaffold N50越長說明組裝結果越好。最理想的組裝結果是物種有幾條染色體就組裝得到幾個Scaffold，即每個Scaffold都是一條染色體。基因組覆蓋率是指組裝得到的序列占物種基因組大小的比例，假如一個物種的基因組大小是1Gb，組裝得到0.8Gb，則基因組覆蓋率為80%。然而，由于物種基因組中重復序列的存在及基因組雜合度的影響，大型真核生物的全基因組測序項目很難達到100%的覆蓋率。縱觀全基因組測序項目發表的文章，小麥基因組項目連續發表3篇Nature文章，而Scaffold N50只有19Kb及60多Kb；發表在Nature雜志的輪蟲基因組Scaffold N50為僅259Kb。然而，發表在Nature Communication雜志的雙峰駝基因組Scaffold N50高達2Mb多；發表在GB雜志的中國蓮基因組Scaffold N50達3.4Mb。從這些案例中不難看出，組裝結果對文章檔次的影響并非至關重要的。當文章的其他方面如分析等處于同等水平時，更好的組裝結果會使文章錦上添花，然而反之未必亦然。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的组装结果的差异是否直接导致文章发表档次的高低？的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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