三大基因组编辑工具在诱导多能干细胞中的应用情况如何?
生活随笔
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三大基因组编辑工具在诱导多能干细胞中的应用情况如何?
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將患者成體細(xì)胞重編程為誘導(dǎo)多能干細(xì)胞的iPS技術(shù),在構(gòu)建疾病模型和新藥開(kāi)發(fā)中有著很高的應(yīng)用價(jià)值。然而由于遺傳變異等原因,iPS構(gòu)建的疾病模型可能與患病細(xì)胞并不完全一樣。現(xiàn)在的潮流是,將基因編輯工具用到iPS中去,獲得同基因型的疾病模性。日前,Stem Cells and Development雜志上刊登的一篇綜述性文章全面探討了這個(gè)問(wèn)題,我們可以在該雜志的網(wǎng)站上免費(fèi)讀到這篇綜述。西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院的Ihor Lemischka、Huen Suk Kim、Jeffrey Bernitz和Dung-Fang Lee在這篇文章中,詳細(xì)介紹了iPSC構(gòu)建疾病模型的新進(jìn)展,分析了三種主要基因組編輯工具在這一領(lǐng)域中的應(yīng)用前景(鋅指酶ZFN、TALEN和CRISPR)。“iPSC在藥物篩選和疾病模型中越來(lái)越受到重視,而基因組編輯工具可以幫助我們進(jìn)一步完善這一過(guò)程。Ihor Lemischka等人為我們展示了這些技術(shù)的優(yōu)勢(shì)和短板,”雜志主編Graham C. Parker博士說(shuō)。人胚胎干細(xì)胞(hESC)是研究早期人類(lèi)發(fā)育的理想工具,也是細(xì)胞替代治療的寶貴資源。然而免疫排斥和倫理學(xué)爭(zhēng)議阻礙了hESC的臨床使用。不過(guò),山中伸彌及其同事開(kāi)發(fā)的iPS技術(shù)繞過(guò)了這些障礙。在那之后,iPS技術(shù)又迎來(lái)了多次改進(jìn)。現(xiàn)在人們已經(jīng)利用這一技術(shù)在體外獲得了多種類(lèi)型的細(xì)胞(神經(jīng)元、心肌細(xì)胞、造血細(xì)胞等),并且在小鼠模型中對(duì)這些細(xì)胞進(jìn)行了功能研究。將來(lái)自患者的iPSC誘導(dǎo)成為受疾病影響的細(xì)胞類(lèi)型,可以模擬人類(lèi)疾病和進(jìn)行藥物篩選。有時(shí)iPS建立的疾病模型與真實(shí)的疾病狀態(tài)并不完全一致。一般來(lái)說(shuō),對(duì)于有著明確致病突變和患病細(xì)胞的單基因疾病,iPS技術(shù)可以很好的再現(xiàn)其病理現(xiàn)象。但在其它情況下,iPSC并沒(méi)有那么成功,導(dǎo)致無(wú)法進(jìn)行精確的分析。為此,iPSC與對(duì)照之間的基因變異應(yīng)該被去除,確保更精確的比較和分子分析,在模擬疾病時(shí)。越來(lái)越多的人開(kāi)始關(guān)注基因組編輯工具,希望由此獲得與患病細(xì)胞基因型完全相同的疾病模型。ZFN和TALEN已經(jīng)在這類(lèi)研究中幫人們成功鑒定了一些疾病新機(jī)制。在這種情況下,理解基因組編輯工具的特點(diǎn)和局限性,對(duì)于建立更好的疾病模型非常關(guān)鍵。目前,iPS構(gòu)建疾病模型主要用到的基因組編輯工具是ZFN,也有少數(shù)研究使用了TALEN,但CRISPR在這方面的應(yīng)用還未見(jiàn)報(bào)道。ZFN和TALEN的問(wèn)題在于,它們都會(huì)引發(fā)脫靶效應(yīng),而且在靶標(biāo)甲基化基因組位點(diǎn)時(shí)效率較低。CRISPR系統(tǒng)易于構(gòu)建,對(duì)DNA甲基化不敏感,而且在人類(lèi)細(xì)胞中的效率更高。不過(guò)CRISPR的脫靶效應(yīng)也不容忽視。此外,生成完美iPSC還有許多因素需要考慮,包括選擇標(biāo)記、載體、培養(yǎng)條件、基因校正策略、脫靶效應(yīng)和基因組的完整性。
總結(jié)
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