"Blue"这款DNA序列误差校正工具怎么样?
生活随笔
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"Blue"这款DNA序列误差校正工具怎么样?
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目前呢,研究人員,將最好的誤差校正工具與標準的生物信息學分析流程相結合,可以產生更高質量的基因組數據和更準確預估的基因變異。然而,"Blue"這款DNA序列誤差校正工具也不能完全準確得校正。因為準確地校正誤差本身就是一個難題,主要是因為基因組的重復性和模糊性。不過,校正簡單的堿基置換(substitution)誤差是很容易的
“Blue”這款DNA序列校正工具是由澳大利亞悉尼大學的研究人員與英聯邦科學與工業研究組織(CSIRO)的同事最近發布的。Blue是一種高性能的C#應用程序,可在Windows系統、Mono on Linux和OS X運行。Blue的特點有:1、明顯快于其他可用的工具,特別在Windows系統中,更加準確。2、它能糾正所有三種類型的可能誤差(substitutions、deletions和insertions),使其適合用于Roche 454和Life Technologies Ion Torrent系統所產生的測序數據。3、可校正與另一組讀長具有一致序列的一組讀長,即“交叉校正cross-correction”方法。
“Blue”這款DNA序列校正工具是由澳大利亞悉尼大學的研究人員與英聯邦科學與工業研究組織(CSIRO)的同事最近發布的。Blue是一種高性能的C#應用程序,可在Windows系統、Mono on Linux和OS X運行。Blue的特點有:1、明顯快于其他可用的工具,特別在Windows系統中,更加準確。2、它能糾正所有三種類型的可能誤差(substitutions、deletions和insertions),使其適合用于Roche 454和Life Technologies Ion Torrent系統所產生的測序數據。3、可校正與另一組讀長具有一致序列的一組讀長,即“交叉校正cross-correction”方法。
總結
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