python层次聚类法画图_Python实现简单层次聚类算法以及可视化
本文實例為大家分享了Python實現簡單層次聚類算法,以及可視化,供大家參考,具體內容如下
基本的算法思路就是:把當前組間距離最小的兩組合并成一組。
算法的差異在算法如何確定組件的距離,一般有最大距離,最小距離,平均距離,馬氏距離等等。
代碼如下: import numpy as np
import data_helper
np.random.seed(1)
def get_raw_data(n):
_data=np.random.rand(n,2)
#生成數據的格式是n個(x,y)
_groups={idx:[[x,y]] for idx,(x,y) in enumerate(_data)}
return _groups
def cal_distance(cluster1,cluster2):
#采用最小距離作為聚類標準
_min_distance=10000
for x1,y1 in cluster1:
for x2,y2 in cluster2:
_distance=(x1-x2)**2+(y1-y2)**2
if _distance<_min_distance:>
_min_distance=_distance
return _distance
groups=get_raw_data(10)
count=0
while len(groups)!=1:#判斷是不是所有的數據是不是歸為了同一類
min_distance=10000
len_groups=len(groups)
for i in groups.keys():
for j in groups.keys():
if i>=j:
continue
distance=cal_distance(groups[i],groups[j])
if distance
min_distance=distance
min_i=i
min_j=j#這里的j>i
groups[min_i].extend(groups.pop(min_j))
data_helper.draw_data(groups)
#一共n個簇,共迭代n-1次
運行的效果就是迭代一次,組數就會少一次,調用畫圖方法,同一組的數據被顯示為一個顏色。
以上就是本文的全部內容,希望對大家的學習有所幫助,也希望大家多多支持聚米學院。
總結
以上是生活随笔為你收集整理的python层次聚类法画图_Python实现简单层次聚类算法以及可视化的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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