Ubuntu系统安装及Gamit 的安装流程
Ubuntu系統安裝及Gamit 的安裝流程
此文編寫內容主要來自科學網——摯友陳超博客,感謝我的好友陳超。
http://blog.sciencenet.cn/blog-858128-788101.html
運行Gamit 是基于linux系統運行的,可以在Sun,Solaris,HP,redhat 、ubuntu等類型上運行,ubuntu系統可以直接在windows系統上安裝,即雙系統,也可以借助VMware安裝。
目前已經出了Gamit 10.7版本了。
Gamit 10.5軟件文件
主要安裝過程
主要安裝最好是在root身份下安裝
gamit 需要的運行環境配置
gfortran , gcc , libx11, csh, tcsh配置
在終端中輸入:sudo -s,然后按提示輸入密碼安裝配置環境:
sudo -s apt-get install gcc apt-get install gfortran apt-get install csh apt-get install tcsh apt-get install libx11-dev上述配置環境請耐心等待安裝,要連接網絡。
配置shell
輸入
echo $SHELL看下當前是什么類型的shell,一般情況下,ubuntu 默認的都是bash,雖然gamit是用csh寫的,但是經過測試,即可以在csh中安裝,也可以在bash中安裝。
若想在csh中安裝,則需要改變當前的shell,在終端輸入
chsh按提示輸入密碼(如果是在root身份就不需要密碼)。然后輸入shell的路徑,以下操作是從bash改變為csh,因此輸入路徑為:
/bin/csh但是上面步驟完成以后,我們輸入
echo $SHELL再查看一下,發現shell仍然是bash,注意了,這里是改變登錄時的默認shell,因此若想讓以上改變生效,只需要注銷下,重新登錄下就可以啦。
bash臨時改變為csh
臨時改變shell的簡單方法,若是由bash改變為csh,只需要在終端輸入csh即可,同理變回來只需輸入bash。臨時的改變shell只對當前的終端是有效的,但這對于gamit的安裝已經足夠了。
gamit軟件的準備及安裝
一般情況下都是需要先將gamit的源代碼復制到/opt目錄下,假設你的gamit源代碼文件夾為gamit10.4,并且位于桌面上,那么只需要在終端輸入:mv ~/桌面/gamit10.4 /opt ,即可將其移動到opt下,然后進入opt,輸入 cd/opt/gamit10.4,繼續輸入ls -al,查看下gamit10.5文件夾下都有什么文件。找到一個叫install_software的文件,查看其權限,若沒有可執行權限,則給他加上就可以了(chmod +x install_software)。
chmod +x install_software然后在終端輸入
./install_software,則開始gamit的安裝了。
第一個直接輸入Y就可以了,然后它會問你x11的目錄是否正確,那么你需要找到gamit的配置文件并修改下,具體方法如下:按ctl+alt+t新開一個終端,進入到opt中的gamit10.4文件夾下,
cd libraries進入libraries文件夾中,
sudo gedit Makefile.config然后就會彈出一個該文件的編輯框,我們需要修改的地方主要有三個,第一個是x11的路徑,將其修改成gamit自動搜索到的x11路徑,如我的系統中是如下圖所示:這個common下的配置是按照不同的操作系統來配置的,每三行一組,我們的ubuntu是在一般操作系統中(Generic);
主要修改的就是x11LIBPATH和X11NCPATH。千萬記得保存一下哦。
第二個需要修改的地方就是gamit的內部參數了,實際上就是寫代碼時聲明的常量。分別是MAXSIT(最大測站數)、MAXSAT(最大衛星顆數)、MAXATM(最大的天頂延遲)、MAXEPC(最大歷元數);
在這里,我們只需要將MAXATM改為25即可(默認為13)。
其實,在這里不改也是可以的,以后我們用到的時候再改也不遲,這些常量的定義分別位于/gamit/include/dimpar.h 、makex.h頭文件中。第三個需要修改的地方就是操作系統的版本號啦,再往下拉,就可以看到OS dependent blocks字樣。這里也是按操作系統來分類的撒,可惜我們的ubuntu在最后幾個哦,所以再往下拉,找到for linux from 0.0.1 to 3.0.0字樣,然后我們修改下面的一行,OS_IDLinux 0001 3202,記住只修改最后的那四個數字為3001就好了。保存一下,關掉。再返回安裝linux的那個終端中,按Y繼續安裝就可以啦,到最后顯示gblock installed(當然過程還是比較漫長的,尤其是fortran編譯器在編譯時,給人的感覺像死機了一樣,連鼠標都動不了)。然后它問是否創建gg的鏈接文件(就是快捷方式),直接按Y就可以啦。
配置gamit的命令路徑
到上面幾步完成以后,會自動顯示怎么配置路徑的哦。如果路徑配置不好,上面的都是白做了。
路徑的配置也是分為兩塊(bash和csh),如果是用csh安裝gamit的,則配置路徑如下:需要在主文件夾下新建一個空白文檔,并重命名為.cshrc。注意這是一個隱藏文件,因此在這之前,應該按ctrl +H ,顯示所有的隱藏文件。然后雙擊打開那個新建的.cshrc文件,復制一下內容到該文件中:
千萬注意了,你自己在復制的時候一定要將
改成你自己的gamit安裝位置哦。然后保存下。
回到終端(進入主目錄下面),輸入source ~/.cshrc,對該配置文件進行下加載。那么這個路徑就生效了。 若想驗證下有沒有配置成功,只需要在終端下輸入 echo $PATH,看看path中有沒有gamit的路徑,若有的話就成功了。
然后新開一個終端,檢驗下gamit是否安裝成功,輸入命令
sh_get_rinex若顯示command not foud,則安裝失敗,顯示一大堆的幫助信息,則成功了。
也可以輸入doy測試是否安裝成果。
以上為csh的路徑配置,下面介紹下bash的路徑配置,若有朋友是用默認的bash安裝gamit 的,則只需要在終端輸入
sudo gedit ~/.bashrc彈出一個文件編輯框,只需要在文件的最后添加以下代碼即可(千萬注意將gamit10.4改成你自己的安裝目錄哦):
export PATH="$PATH:/opt/gamit10.4/gamit/bin:opt/gamit10.4/com:/opt/gamit10.4/kf/bin" export HELP_DIR=/opt/gamit10.4/help/保存退出就可以啦,檢驗是否安裝成功的方法同上。好了,開始體驗gamit的神奇吧!
總結
以上是生活随笔為你收集整理的Ubuntu系统安装及Gamit 的安装流程的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
- 上一篇: Linux命令之hexdump
- 下一篇: 流星,刹那间划过天际