linux非权限安装bioperl,bioperl的安装
1. 對于UNIX用戶
(1)下載BioPerl的源代碼,并解壓。我提供兩個網(wǎng)址:
(2)進入該目錄,然后執(zhí)行下列命令:$ perl Build.PL
$ ./Build test
# ./Build install (注意:執(zhí)行./Build install時必須要有系統(tǒng)管理員權(quán)限)
BioPerl和許多其他模塊有依賴關(guān)系,所以在安裝過程中系統(tǒng)會反復(fù)詢問你是否要安裝XX模塊。你最好要在連接Internet的情況下安裝才行。
如果你只想用BioPerl的核心模塊,不想使用額外附加功能,可以選擇不安裝。但我不敢保證以后使用是否會出現(xiàn)問題。
2. 對于windows用戶
(1)使用ActivestatePerl的PPM(Perl包管理器)來安裝。這種方法速度很慢,如果你機器配置不夠好的話只有等著死機。
(2)使用命令行模式安裝。這種方法很穩(wěn)定,強力推薦。注意安裝全過程必須要有穩(wěn)定的Internet連接?????? 你需要執(zhí)行的命令是:
C:> ppm-shell (回車出現(xiàn)下一行)ppm>
ppm> repo add uwinnipeg
ppm> repo add trouchelle
ppm> install BioPerl
判斷系統(tǒng)上是否已經(jīng)安裝了一個模塊,可以嘗試使用perldoc命令查看模塊的文檔。如果能夠查閱它的文檔,說明已經(jīng)安裝成功了。
對于BioPerl來說,我們可以查看其中的一個模塊的文檔:perldoc Bio::Seq
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的linux非权限安装bioperl,bioperl的安装的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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