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定制Circos圖：使用TBtools，從數據準備到可視化

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/imt2.35

●2022年7月4日，華南農業大學夏瑞團隊在iMeta在線發表了題為“A painless way to customize Circos plot: From data preparation to visualization using TBtools”的文章。

●?在該文章中，作者在TBtools中開發了“Advanced Circos”功能，提供構造Circos圖的簡單方法?！癆dvanced Circos”功能提供了一個用戶友好界面，用于定制參數設置，并可用于可視化各種基因組水平數據，如基因組關聯信息、比對數據、基因密度和QTL位置。

●? 第一作者：陳程杰

●? 通訊作者：夏瑞?(rxia@scau.edu.cn)

●??合作作者：吳亞

摘? ?要

Circos圖使科學家能夠輕松地在全基因組尺度上探索生物大數據，但繁瑣的輸入數據準備和復雜的參數配置限制了其應用。我們在TBtools中開發了“Advanced Circos”功能，提供構造Circos圖的簡單方法。作為一個開箱即用的軟件，TBtools集成了系列便于輸入數據準備的功能?！癆dvanced Circos”功能提供了一個用戶友好界面，用于定制參數設置，并可用于可視化各種基因組水平數據，如基因組關聯信息、比對數據、基因密度和QTL位置。本文介紹了“Advance Circos”的主要特點和上游數據準備方法，旨在讓更多用戶能夠使用Circos圖進行基因組大數據探索。

關鍵詞：Circos, TBtools, 全基因組水平, 數據可視化

亮? ?點

●?全基因組尺度數據可視化的開箱即用解決方案

●?Circos圖繪制與參數定制的手把手教程

●?可重現的項目管理

視頻教程

Bilibili：https://www.bilibili.com/video/BV1iT411u7y1/??

Youtube：https://youtu.be/ERWo7KhLQs0

中文翻譯、PPT、中/英文視頻解讀等擴展資料下載

請訪問期刊官網：http://www.imeta.science/

全文解讀

開發動機

隨著測序技術的快速發展和數據分析技術的進步，越來越多的生物基因組序列被解碼。隨之而來，生物學研究進入了后基因組時代。這要求我們從全基因組范圍內更頻繁地探索大型生物數據。2009年，Krzywinski提出了Circos圖可視化模式。這是一種可視化基因組大數據的強大方法[1]。自那時以來，Circos已被用于許多比較基因組學分析，但由于其在繪制配置和程序使用方面的復雜性，其效用尚未完全釋放。雖然目前已有幾種用于快速繪制Circos圖的工具[1-7]，但其間仍有地方值得優化：（1）多數Circos繪制工具的安裝復雜，或需要在命令行環境下工作，要求用戶具備較高水平的計算機技能，如Perl-Circos；（2）Circos圖繪制往往需要用戶使用其他各類軟件或自行編寫腳本整理數據；（3）繪制圖稿不支持交互式編輯、直接重繪和中間工程文件的協作共享能力有限。

因此，我們在TBtools [8]中開發了“Advanced Circos”功能，旨在提供創建Circos圖的最簡單、最方便的方法。用戶需要做的是按照TBtools圖形界面中的簡單提示來組織以制表符分隔的輸入文件。所有繪圖參數可以交互調整，Circos圖可以立即生成和刷新。用戶可以保存工作項目以供進一步修改、復制和共享。此外，TBtools作為一個多功能工具包，具有一系列文本處理和數據整理功能，幫助用戶輕松快速地準備輸入數據，為Circos繪圖創建提供一站式解決方案。

數據類別

TBtools中的“Advanced Circos”功能支持可視化多組連續或離散數據。通常，這些數據類型可分為四大類，如圖1所示：

圖1. 不同數據類型在TBtools的“Advanced Circos”的可視化模式

（A）染色體骨架；（B）熱圖；（C）條形圖；（D）折線圖；（E）點圖；（F）三角形；（G）箭頭；（H）bézier曲線；（I）區塊；（J）文本標簽。與每個標簽字符相鄰的是其相應輸入數據格式示例?；疑尘暗奈谋颈硎鞠鄳牧惺强蛇x的。

第一類是染色體骨架（圖1A），呈現特定染色體或其他基因組序列（如支架或重疊群）。它是Circos圖的主干，是必需的輸入數據。默認輸入數據由兩個必填列，一個是染色體ID，另一個是染色體長度信息。用戶也可以在第三列增加可選RGB代碼，以指定染色體骨架的顏色。

第二類是特定染色體區域的標記數據（圖1J），可用于標記特定區間，如基因或QTL（數量性狀基因座）位置。相應的輸入是一個以制表符分隔的文件，其中包含四個必填列和一個可選列：染色體ID、區域標記標簽、起始坐標、結束坐標和RGB代碼（可選）。

第三類顯示染色體區域的關聯信息（圖1H），通常用于顯示同源區域或染色體相互作用關系等。這類數據通常放在Circos圖的最內層。輸入文件由六個必填列和一個可選列組成，以制表符分隔，分別是染色體ID、起始坐標、終止坐標、染色體ID、起始坐標、終止坐標和RGB代碼（可選）。

第四類是染色體區域統計數據（圖1B-G，1I），可以以各種方式顯示，包括連續數據（以熱圖、條形圖、折線圖或點圖顯示）和離散數據（以三角形、箭頭或平鋪/矩形顯示）。對于連續數據，輸入文件的格式為“染色體ID、起始坐標、結束坐標和以數字標示的值”（圖1B-E）；對于離散數據，輸入文件格式為“染色體ID、起始坐標、結束坐標和RGB代碼”（圖1F、1G、1I）。對于箭頭符號（圖1G），當起始坐標大于結束坐標時，其方向相反。通過調整繪圖跨度，可以堆疊Circos繪圖上的不同軌跡，以實現各種可視化類型組合，如圖1I和圖6所示。矩形/平鋪軌跡用于突出顯示染色體部分區域。

圖形界面

●??主界面

打開TBtools->“Graphics”->“Advanced Circos”，在彈出的界面（圖2A-E）中，有三個輸入文件字段和兩個功能按鈕。

1、Chr長度文件（必填）；

2、基因組特征信息（可選）；

3、關聯區域信息（可選）；

4. “Load Project…” 按鈕加載預先存在的Circos項目；

5、“Show My Circos Plot!” 按鈕生成基因組骨架圖。

圖2.? Advanced Circos的主界面和參數面板

（A）-（C）輸入文件面板；（D）現有項目恢復按鈕；（E）按鈕點擊生成基因組骨架圖；（F）Cirocs繪圖的全局參數設置；（G）用于導出繪圖或保存項目的按鈕；（H）每個染色體區域統計可視化的參數設置。

●??高級參數設置

通過單擊“Show Control Dialog”按鈕，可以打開高級Circos控制面板。參數設置面板可分為三個主要部分（圖2F-G）。

1、位于界面底部的保存按鈕（圖2G）?！癝ave Graph”按鈕用于導出當前繪圖，支持位圖和矢量格式；“Save Curr. Project”按鈕可用于保存正在進行的項目，該項目可通過上述“Load Project…”恢復，也可以直接與其他用戶共享或直接在其他設備上復現；

2、位于界面左側的全局參數設置（圖2F）。這些設置用于控制總體繪圖細節，詳細分為幾個部分：圖形設置、顏色欄、顏色標簽、顏色記號、關聯信息、特征標簽、熱圖顏色比例。而頂部的“Refresh Graph”按鈕用于應用調整后的參數并刷新當前繪圖。

3、位于界面右側的單道圖形控制參數（圖2H）。它們用于控制染色體區域統計信息的可視化細節，染色體區域統計信息也分為幾個部分，包括BIN設置、顏色設置、Bar設置和線條設置。單擊“添加”按鈕，將生成圖形軌道。對于每個參數的詳細效果，建議用戶使用示例數據自行探索（見支持數據1）。

●??案例演示

Advanced Circos是TBtools的內置功能之一，它與一系列可用于輸入數據準備的功能集成在一起。在本節中，我們將逐步演示如何使用TBtools的Advanced Circos功能從常見的生物大數據出發，到Circos圖生成。

(a) 染色體骨架文件制備

染色體骨架是Circos圖的主干?？梢允褂肨Btools中的“Fasta Stat”功能從基因組序列文件中獲取有關基因組的信息（圖S1）。

功能位置：“Sequence Toolkit”->“Fasta Tools”->“Fasta Stats”；

輸入文件：“Arabidopsis_ thaliana.genome.fna”

輸出文件：“Arabidopsis_ thaliana.genome.fna.ChrLen.txt”

操作步驟：

1、轉到“Fasta Stats”；

2、設置輸入文件和輸出文件；

3、勾選“僅保留序列長度”；

4、點擊“開始”按鈕，所需信息將保存到輸出文件

（“Arabidopsis_thaliana.genome.fna.ChrLen.txt”）。

注：演示數據的文件名為斜體

輸出文件（“Arabidopsis_thaliana.genome.fna.ChrLen.txt”）包含每個染色體的序列長度信息。用戶可以手動編輯。例如，我們在這里刪除了兩條質粒染色體的長度信息。

Chr1?????? 30427671

Chr2?????? 19698289

Chr3?????? 23459830

Chr4?????? 18585056

Chr5?????? 26975502

ChrM????? 366924

ChrC????? 154478

只需將染色體長度信息的結果文件拖放到Advanced Circos（圖2A）的第一個字段中，按“Show My Circos Plot!”按鈕，立即生成染色體骨架的Circos圖（圖3A）。

圖3：Advanced Circos的染色體骨架、區域標記和區域關聯數據可視化

（A）基本染色體骨架；（B）不同顏色著色的染色體骨架；（C）染色體骨架上的基因位置可視化；（D）染色體間的染色體區域關聯信息可視化。

通過向每行染色體長度信息添加RGB顏色代碼，可以對每個染色體進行不同著色。用戶還可以使用“Discrete Color Scheme Generator”自動生成一系列顏色（圖S2）

功能位置：“圖形”->“調色板”->“離散配色方案生成器”；

輸入文件：“Arabidopsis_thaliana.genome.fna.ChrLen.txt”

輸出文件：“Arabidopsis_thaliana.genome.fna.ChrLen.withColor.txt”

操作步驟：

1、切換到“離散顏色方案生成器”；

2、設置輸入文件和輸出文件；

3、點擊“開始”按鈕，RGB色碼將添加到輸出文件（“Arabidopsis_thaliana.genome.fna.ChrLen.withColor.txt”）。

輸出文件中的內容如下所示：

Chr1?????? 30427671????? 11,249,4

Chr2?????? 19698289????? 241,193,242

Chr3?????? 23459830????? 208,201,119

Chr4?????? 18585056????? 152,162,81

Chr5?????? 26975502????? 212,178,129

在Advanced Circos中用該文件替換染色體骨架信息，將生成彩色骨架圖（圖3B）。

(b) 添加基因組標簽信息

在許多情況下，我們希望在染色體上標記某些基因組特征，例如基因、QTL和TAD（拓撲關聯域）。例如，要突出顯示某些基因，用戶需要首先獲得每個基因的位置信息。TBtools的“GXF基因位置和信息提取”功能可用于獲得特定基因的相應基因組區域（圖S3）。

功能位置：“Sequence Toolkit” -> “GFF3/GTF Manipulate” -> “GXF Gene Position & Info Extract”

輸入文件：Arabidopsis_thaliana.genome.gff3

輸出文件：Arabidopsis_thaliana.genome.gff3.CDS.Info.xls

操作步驟：

1、設置輸入、輸出文件

2、點擊“Start”按鈕

輸出文件包含擬南芥所有CDS的位置信息。用戶可以使用Excel或其他文本編輯軟件從該表中選擇感興趣的基因信息。在這里，我們使用TBtools中的“Table Row Manipulate”功能，挑出了擬南芥中ARF家族的基因（必須提前準備ARF基因的ID列表）。

功能位置：“Others” -> “Table/Text File Manipulator” -> “Table Row Manipulate”

輸入文件: Arabidopsis_thaliana.genome.gff3.CDS.Info.xls

輸入ID列表: ARF.Family.IDs.txt

輸出文件: Arabidopsis_thaliana.genome.ARF.Pos.Info.xls

操作步驟:

1、設置輸入文件，選擇第一列進行處理；

2、設置輸入AtARF ID列表；

3、設置輸出文件；

4、點擊“Start”按鈕。

可以對結果文件進行簡單修改，即只保留前四列，具體文件信息如下：

Chr1 AT1G19220.1 6628068 6633087

Chr1 AT1G19850.1 6886879 6891374

Chr1 AT1G30330.1 10685822 10690838

...

此文件可直接用于Advanced Circos可視化。用戶還可以為每個基因附加RGB代碼，以呈現不同的文本顏色。如果特征標簽在繪圖中重疊，可以調整“全局參數設置”中“特征標簽”下的“重疊權重”值，如設置為“-4”或更大的數字，進而優化文本間距（圖3C）

(c) 基因組區域關聯圖

染色體序列在內部或染色體間是相互關聯的，例如序列同源、染色體相互作用以及基因相互調節。Circos圖通常用于顯示全基因組復制、大片段易位和串聯重復的基因組特征。用戶只需使用TBtools中的幾個函數，即可準備相關的輸入文件，例如，“One Step MCScanX”[9]（圖S3）。

功能位置：“Graphics” -> “Comparative Genomics” -> “One Step MCScanX”

輸入的基因組序列信息：Arabidopsis_thaliana.genome.fna

輸入的基因結構注釋信息: Arabidopsis_thaliana.genome.gff3

輸出文件夾: Synteny Result

在輸出目錄中，將生成一個后綴為“*.geneLinkedRegion.tab.xls”的文件。它可以用于Advanced Circos可視化。該文件的最后一列（第8列）包含有關同源基因對的信息，Advanced Circos將忽略這些信息。盡管如此，用戶可以選擇感興趣的關聯間隔，調整RGB代碼，并將這些行移動到輸入文件的頭部以突出顯示這些區域。示例文件，如下所示。結果圖將類似于圖3D。

Chr2?????? 19105112????? 19108331????? Chr3?????? 22887889????? 22891435????? 255,0,0?????? AT2G46530.3.match.AT3G61830.1

Chr2?????? 19105112????? 19108331????? Chr4?????? 12451277????? 12455014????? 255,0,0?????? AT2G46530.3.match.AT4G23980.1

Chr3?????? 22887889????? 22891435????? Chr4?????? 12451277????? 12455014????? 255,0,0?????? AT3G61830.1.match.AT4G23980.1

……

(d) 基因組數據可視化

GC含量 / GCskew / 未知堿基

核酸組成是基因組的一個基本特征。例如，GC含量與編碼基因和功能DNA元素的密度相關；GC-skew是一種度量鳥嘌呤和胞嘧啶鏈偏好的指數，可以幫助檢測細菌環形染色體中的DNA復制起始位點。未知堿基（N）分布可從一定程度上顯示基因組組裝質量。TBtools中的“Fasta Window Stat”功能可用于快速將基因組序列文件中的GC含量、GC偏斜和N比率制成表格。

功能位置：“Sequence Toolkit”->“Fasta Tools”->“Fasta Window Stat”

輸入基因組序列文件：Arabidopsis_thaliana.genome.fna

輸出文件前綴：Arabidopsis_thaliana.genome.Window.Stat

將生成三個前綴相同的文件。他們是

“Arabidopsis_thaliana.genome.Window.Stat.GCratio”, “Arabidopsis_thaliana.genome.Window.Stat.GCskew”, “Arabidopsis_thaliana.genome.Window.Stat.Nratio”

這三個輸出文件都適用于Advanced Circos可視化。這里，我們使用N比率統計文件作為第一個示例（圖4A）。

1、手動刪除N比為0的行（可選）；

2、如上所述加載染色體骨架信息后，點擊“Start”進行可視化；

3、進入參數控制界面（“Show Control Dialog”），點擊右側的“Add”按鈕，添加新的軌道；

4、設置N比率文件的輸入文件；

5、選擇軌道類型作為點，然后單擊“Refresh Graph”（圖4B）。

請注意，我們已經使用了滑動窗口方法來計算N比率，因此“BIN Mode”可以設置為“None”。

圖4：使用不同的軌道類型查看連續數據

（A）軌道參數面板；（B）在點圖中查看的N比率情況；（C）GC偏斜度；（D）熱圖中的基因密度；（E）條形圖中的排序覆蓋率。

類似地，我們可以使用線條圖來可視化GC偏斜。GC偏移的計算以0為界，因此我們在右側的行設置中將“Sep Line Value”設置為0，以實現正負偏移值的不同著色（圖4C）。

基因密度

基因組范圍內的基因密度分布通常通過Circos圖進行可視化。TBtools有一個方便的功能——“Gene Density Profile”，它允許用戶從基因結構注釋文件中計算基因密度，通常為GFF3和GTF格式。

功能位置: “Sequence Toolkits” -> “GFF3/GTF Manipulate” -> “Gene Density Profile”

輸入文件: Arabidopsis_thaliana.genome.gff3

輸出文件: GeneDensity.profile

在“Control Dialog”面板中，單擊“Add”以獲得附加軌道，拖放基因密度信息文件（“GeneDensity.profile”），選擇熱圖模式，然后刷新繪圖（圖4D）。如果基因密度分布明顯有偏差，用戶可以在左下角面板的“Heat Color Scale”菜單中嘗試不同的顏色縮放模式，以獲得更好的視圖。每個熱圖軌道都會自動觸發繪制顏色方案圖例，并且這些圖例可以輕松移動。

測序數據覆蓋度分布

在許多情況下，除了基因組序列本身的特征外，我們還對查看實際NGS數據在基因組上的分布感興趣，例如，深度測序數據的覆蓋范圍。TBtools中的“SAM/BAM/CRAM BIN Cov”功能可用于根據映射工具生成的原始對齊文件（通常為SAM、BAM或CRAM格式）準備輸入文件。

功能位置: “Others” -> “HTS Data” -> “SAM/BAM/CRAM BIN Cov”

輸入文件: SRR17382349_1.bam

輸出文件: SRR17382349_1.bam.BINStat.tab.xls

這里，我們選擇了條形圖來可視化覆蓋率數據。勾選“Color by Chr”，使條形圖的顏色與染色體的顏色一致?！癇ar Fill”選項控制軌道的背景色，此處設置為灰色（圖4E）。

基因組變異數據

與比對文件（用于序列覆蓋）類似，在TBtools中，用戶還能夠處理基因組變異的數據，例如，包含基因組序列變異信息的VCF文件。“VCF BIN Cov”功能可用于輸入準備。

功能位置: “Others” -> “HTS Data” -> “VCF BIN Cov”

輸入文件: Est-1.qual50.filtered.direct.vcf.gz

輸出文件: Est-1.qual50.filtered.direct.vcf.BINCount.tab.xls

使用熱圖模式，可以全面查看染色體上序列變異的熱點區域?？傮w模式在很大程度上與上述基因密度分布互補。

QTLs/Arrow/TAD

上面使用的所有演示數據都是連續的基因組數據，“Advanced Circos”還提供了顯示離散數據的各種模式。我們可以參考上述Tile track的格式要求組織QTL信息，例如：

Chr3 7842037 11192039 56,108,176,0.7 Blue Light

Chr5 2899846 8562462 56,108,176,0.7 Blue Light

Chr1 19672910 24443023 227,26,28,0.7 Red Light

Chr1 592464 24581765 255,255,179,0.7 White Light

Chr5 1507102 5275918 255,255,179,0.7 White Light

使用此數據作為輸入，并選擇“Tile”模式以顯示它（圖5A）。請注意，最后一列是可選的，它的存在將自動觸發圖例生成。所有圖例都可以輕松移動。此外，“Advanced Circos”還可用于可視化TAD（使用“三角形”模式）或帶方向基因區間（使用“箭頭”模式）（圖1）。

圖5: 用不同軌道類型表示的離散數據

（A）QTL的平鋪圖；（B）修改平鋪圖以突出感興趣的基因組間隔。

(e) 其他自定義選項

區間高亮

通過調整Tile軌道的繪制范圍（“平鋪”軌跡的“Start Pos”和“End Pos”），可以實現高亮區域功能。從圖5A開始，將“Start Pos”設置為90，“Bar Border”設置為“null”，并刷新圖像，我們將得到如圖5B所示的圖。

軌道重疊

按照區域突出顯示功能的相同邏輯，可以將不同的軌跡合并為一個，這也可以通過調整每個軌跡的“Start Pos”和“End Pos”來實現。通過簡單地合并上述軌道，我們可以得到如圖6A。

圖6：Circos的重疊軌道

（A）從Circos圖的內部到外部分別是：基因組區域關聯的Bézier曲面；N-比率分布的點圖；GCskew的線圖；基因密度分布的熱圖與GC比率變化的線圖重疊；測序覆蓋率條形圖；倒置的條形圖；基因家族的標簽；（B）捋值的Circos

直線型還是環型？

Advanced Circos是基于我們一直在開發的TBtools強大的交互式繪圖引擎“JIGplot”開發的。因此，“Advanced Circos”具有坐標切換（笛卡爾坐標和極坐標之間）和交互式分析的功能。通過取消選中“Circulized”復選框，我們將獲得捋值了的Circos圖，即“Straight”模式（圖6B）。此外，用戶可以輕松編輯繪圖中的每個元素，例如，旋轉元素和更改文本字體和顏色。

保存、共享和重新加載項目

在主繪圖面板中，單擊“Save Curr. Project”，將當前繪圖數據和狀態保存到指定目錄。用戶可以隨時直接從Advanced Circos主界面重現保存的項目，做進一步調整。此外，用戶只需打包目錄并將其發送給同事共享他們的Circos項目，或直接從其他設備工作。

結論

繁瑣的數據準備、復雜的配置和大量的文本整理操作限制了Circos圖在科學研究中的使用。本文簡要介紹了TBtools中“Advanced Circos”繪圖功能和相應參數接口，并詳細闡述了如何從常見的NGS數據出發，使用“Advanced Circos”制作信息豐富的Circos圖。幾乎所有步驟都可以在TBtools中通過簡單的點擊輕松完成。我們預計，本文中TBtools的“Advanced Circos”將使更多的研究人員能夠享受Circos圖在探索大型生物數據方面的優勢。

致謝

本研究由嶺南現代農業廣東實驗室（項目編號：NZ2021007）、國家自然科學基金（32102320）和廣東省專項支持計劃（2019TX05N193）資助。我們感謝華西醫院的于浩鵬博士和中國熱帶農業科學院的馮筠庭博士就改進TBtools的Advanced Circos功能提出的建設性建議。我們非常感謝40000多名TBtools用戶，尤其是30多名高級用戶的良好建議。

利益沖突

作者聲明沒有相互競爭的利益

作者貢獻

Chengjie Chen和Rui Xia構思了該項目；Chengjie Chen和Rui Xia設計了工具箱的功能；Chengjie Chen執行了所有Java編碼。Ya Wu測試了這些功能，并幫助編寫了教程手冊和圖表。Chengjie Chen和Rui Xia設計了這些圖形并撰寫了手稿。所有作者都閱讀并通過了最終手稿。

數據可用性

所有演示數據和TBtools的相應版本可在https://tbtools.cowtransfer.com/s/c60a5cfec3274f.補充材料（圖、表、腳本、圖形摘要、幻燈片、視頻、中文翻譯版和更新材料）可在在線DOI或iMeta Science中找到http://www.imeta.science/。

引文

Chen, Chengjie, Ya Wu, and Rui Xia. 2022. “A painless way to customize Circos plot: From data preparation to visualization using TBtools.” iMeta. e35. https://doi.org/10.1002/imt2.35

作者簡介

陳程杰（第一作者）

●??華南農業大學園藝學院教師，生信工具TBtools作者

●現已在Molecular Plant、Nature Communications、New Phytologist、Horticulture Research等國際知名雜志發表論文10余篇

夏瑞（通訊作者）

●博導，華南農業大學園藝學院教授

● 目前是亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室和農業部華南地區園藝作物生物學與種質創制重點實驗室的學術骨干和青年學科帶頭人。2019年獲得廣東省特支計劃科技創新領軍人才項目支持。長期致力于園藝植物基因組和小分子RNA相關研究，已取得了國際領先的研究成果，在Nature Genetics, Nature Communication, Molecular Plant和The Plant Cell等學術刊物發表SCI論文50多篇，累計引用>5000次。目前主要利用生物信息學、基因組學及分子生物學等手段，圍繞無患子科植物花性別分化機制以及南方主要水果花果發育調控機理等生物學問題開展研究。并已開發一系列生物信息數據分析工具數據庫，如TBtools和sRNAanno（www.plantsRNAs.org）等

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期刊簡介

“iMeta” 是由威立、腸菌分會和本領域數百位華人科學家合作出版的開放獲取期刊，主編由中科院微生物所劉雙江研究員和荷蘭格羅寧根大學傅靜遠教授擔任。目的是發表原創研究、方法和綜述以促進宏基因組學、微生物組和生物信息學發展。目標是發表前10%(IF > 15)的高影響力論文。期刊特色包括視頻投稿、可重復分析、圖片打磨、青年編委、前3年免出版費、50萬用戶的社交媒體宣傳等。2022年2月正式創刊發行！

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微微?

總結

以上是生活随笔為你收集整理的iMeta | 华南农大陈程杰/夏瑞等发布TBtools构造Circos图的简单方法的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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