RNA-Seq分析软件HTSeq的安装
生活随笔
收集整理的這篇文章主要介紹了
RNA-Seq分析软件HTSeq的安装
小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
1.本人剛開始安裝的時候,先下載相關(guān)的軟件包,然后安裝installtion中的方法安裝,
?運行的時候老是報錯。根據(jù)錯誤提示安裝解決方法。也參考了其他的筆友的一些建議,
發(fā)現(xiàn)特別麻煩,后來無意中發(fā)現(xiàn)有小伙伴用bioconda來安裝,一個命令,簡單快捷。
2.bioconda安裝HTSeq操作如下:
下載安裝miniconda(即bioconda)。
添加channels
等等
(具體步驟參考本人的相關(guān)bioconda的博客)
安裝HTSeq的命令如下:
conda ? install ?HTSeq
輸入上述命令,根據(jù)提示操作,可能有點慢。
安裝完成后,測試一下HTSeq安裝是否成功。
$ python(HTSeq在Python中運行)
>>> import HTSeq
上述操作Import HTSeq如果沒有返回任何信息,
說明安裝成功。
PS:bioconda真心好用啊,但是好像不是所有的安裝都是
conda install softname,好像有的軟件需要其他的參數(shù)
記著就好啦,反正暫時沒有遇到。
轉(zhuǎn)載于:https://www.cnblogs.com/lmt921108/p/7499059.html
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的RNA-Seq分析软件HTSeq的安装的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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