常見的繪制熱圖的方法有很多，如可用R包，OmicSare tools的熱圖工具，Heml等繪制。那么常規(guī)的科研作圖軟件 Origin 能不能繪制熱圖呢？今天就用Origin嘗試下繪制熱圖。

數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

本文的示例數(shù)據(jù)使用周老時(shí)在《》一文中所用的數(shù)據(jù)，是一個(gè)包含20個(gè)樣本，30個(gè)基因的表達(dá)量的“數(shù)據(jù)框”，通過點(diǎn)擊閱讀原文可到OmicSare論壇下載。

將數(shù)據(jù)復(fù)制粘貼到Origin中后，計(jì)算樣本兩兩之間的相關(guān)系數(shù)(當(dāng)然也可以將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)置后計(jì)算基因間的相關(guān)系數(shù))，具體方法見下面的動(dòng)圖。

計(jì)算結(jié)果會(huì)在新的Sheet中給出相關(guān)系數(shù)矩陣，以及對(duì)應(yīng)的p-value值等，如下圖，而本文主要用其中的相關(guān)系數(shù)矩陣。

熱圖繪制

Origin表格的與Excel的表格相類似，選中相關(guān)系數(shù)矩陣表中的數(shù)據(jù)部分，通過Plot\Contour\Heat Map(見下圖)進(jìn)入數(shù)據(jù)選擇窗口。

然后，在數(shù)據(jù)選擇窗口確定X軸和Y軸標(biāo)簽所對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)，主要的參數(shù)設(shè)置見下圖。

點(diǎn)擊OK按鈕，即可獲得初步的繪制結(jié)果，見下圖。

下面開始為每個(gè)“格子”添加數(shù)據(jù)標(biāo)簽。

由于這一版本無直接添加標(biāo)簽的功能，這里需要“間接”的方法。思路是為每個(gè)“格子”添加與之對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)點(diǎn)，然后為數(shù)據(jù)點(diǎn)添加標(biāo)簽，最后將這些數(shù)據(jù)點(diǎn)和連線隱藏。

添加數(shù)據(jù)之前，需要把多列數(shù)據(jù)合并為1列，選中數(shù)據(jù)后，通過Worksheet\Stack columns堆疊數(shù)據(jù)，注意勾選Include othercolumns，方法見下圖。

將堆疊生成的數(shù)據(jù)復(fù)制到一個(gè)新表中(注意，這一步很有必要，否則接下來步驟的可能會(huì)添加數(shù)據(jù)不成功)，選中C(Y)列后右鍵，在Properties窗口將列中數(shù)據(jù)設(shè)為兩位小數(shù)，方法如下。

然后右鍵A列，將A列數(shù)據(jù)設(shè)置為X，全選B(Y)列數(shù)據(jù)，將鼠標(biāo)指針移到右側(cè)邊緣處，拖動(dòng)到熱圖上，釋放鼠標(biāo)，完成數(shù)據(jù)添加，方法如下。

然后雙擊熱圖，進(jìn)入Plot Details窗口，改變細(xì)線(Line)的透明度來隱藏連線，然后給Label 添加C(Y)數(shù)據(jù)，見下圖。

圖表美化與導(dǎo)出

Origin 繪制的熱圖像繪制其他類型圖表相似，可自由的進(jìn)行自定義美化，方法也很相似。例如可以更改隱藏“坐標(biāo)軸”等，更有用的是改變“色條”的數(shù)值范圍(右鍵熱圖，在 Colormap 菜單下改變 level)，以及在Plot details窗口中自定義漸變顏色，見下圖。

最的繪制結(jié)果如下圖：

Tips：

今天的重點(diǎn)是在學(xué)習(xí)繪制熱圖的過程中，學(xué)會(huì)如何用Origin計(jì)算相關(guān)性系數(shù)；如何將多列數(shù)據(jù)堆疊為1列，以及給繪制好的圖表上添加Data(Label)的技巧。

今天的內(nèi)容就到這里啦~

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的origin做相关性分析图_如何用Origin绘制热图？的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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