EEGLAB合辑 | 第一节 往EEGLAB导入数据
1、學習Matlab
EEGLAB圖形界面建立在強大的Matlab腳本語言之上。要使用EEGLAB構(gòu)建宏命令和執(zhí)行自定義和自動化處理的全部功能，就需要能夠在Matlab中操縱EEGLAB數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)。由于時間限制，這個wiki沒有提供關(guān)于Matlab腳本語言的介紹。相反，用戶需要在開始研究之前熟悉Matlab。
2、安裝EEGLAB和教程文件
首先下載包含教程數(shù)據(jù)集的EEGLAB（30MB），附下載地址。
（https://sccn.ucsd.edu/eeglab/downloadtoolbox.php）
解壓EEGLAB時，您將獲得一個名為“eeglabxxxx”的文件夾（注意：當前版本號“xxxx”將有所不同）。在Windows下，Matlab通常建議將工具箱放在Application/MatlabRxxxx/toolbox/文件夾中（注意：該名稱應(yīng)隨Matlab版本的“xxxx”而變化）。在Linux中，Matlab工具箱文件夾通常位于/usr/local/pkgs/Matlab rxxxx/toolbox/和Mac中的“/Application/Matlab_rxxxx”。您也可以將文件夾放在路徑上的任何其他位置。
3、啟動Matlab和EEGLAB
這里我們將啟動Matlab和EEGLAB。
關(guān)鍵步驟1：啟動Matlab
Windows：開始，找到Matlab并運行它。
Mac：從dock或應(yīng)用程序文件夾中的Matlab圖標開始。
Linux：打開一個終端窗口，輸入“matlab”，然后按enter鍵。
關(guān)鍵步驟2：切換到EEGLAB目錄（文件夾）
您可以通過單擊屏幕右上角標有“…”的按鈕來瀏覽目錄。這將打開下面的窗口。雙擊目錄即可進入。雙擊文件夾列表中的“.”可將您提升到上一個層級的目錄。一旦找到你想要的文件夾或目錄，點擊OK。或者，從命令行使用“cd”（change direction）來到達所需的目錄。
關(guān)鍵步驟3：啟動EEGLAB
在Matlab命令行中輸入“eeglab”，然后按enter鍵。EEGLAB將自動添加到Matlab路徑中。
下面的藍色主EEGLAB窗口將彈出，它有七個菜單標題：文件、編輯、工具、繪圖、研究、數(shù)據(jù)集、幫助，按典型的（從左到右）使用順序排列。
探索嘗試（可選）：將EEGLAB添加到Matlab路徑
您可能需要將EEGLAB文件夾添加到Matlab搜索路徑中，以便下次啟動Matlab時能夠直接打開EEGLAB。如果您是通過Matlab的圖形界面啟動的，請轉(zhuǎn)到“文件”菜單項并選擇“設(shè)置路徑”。這將打開以下窗口。
或者，如果從命令行運行Matlab，鍵入“pathtool”并單擊return；這也將調(diào)用此窗口。單擊標記為Add folder的按鈕并選擇文件夾“eeglabxxxxx”，然后單擊“確定”（EEGLAB將負責添加其子文件夾本身）。在pathtool窗口中點擊save，這將使EEGLAB調(diào)用函數(shù)“EEGLAB”在以后的Matlab命令行中可用。注意，如果您安裝的是更新版本的EEGLAB，最好從Matlab路徑中刪除舊版本（選擇，然后點擊刪除），以避免調(diào)用過時的例程。最好不要添加“eeglab”路徑及其子文件夾，而是讓eeglab管理路徑（當您啟動“eeglab”時，它會自動添加所需的路徑。
4、打開現(xiàn)有數(shù)據(jù)集
關(guān)鍵步驟4：加載示例EEGLAB數(shù)據(jù)集
選擇菜單項“文件”，然后按子菜單項“加載現(xiàn)有數(shù)據(jù)集”。在本教程的其余部分中，我們將使用約定：Menu_item>Submenu_item來引用菜單選擇（例如，這里選擇Load existing dataset子目錄來加載數(shù)據(jù)集）。
在Unix中，將彈出以下窗口：
要了解如何從您自己的數(shù)據(jù)創(chuàng)建EEGLAB數(shù)據(jù)集，請參閱有關(guān)導(dǎo)入數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)事件的教程：
https://sccn.ucsd.edu/wiki/A01:_Importing_Continuous_Epoched_Data
選擇文件”eeglab_dataset.set”，位于EEGLAB的“sample_data”文件夾中，也可以在此處下載：
https://sccn.ucsd.edu/mediawiki/images/9/9c/Eeglab_data.set）
然后導(dǎo)入EEGLAB.當數(shù)據(jù)集被EEGLAB加載時，EEGLAB主窗口顯示關(guān)于它的相關(guān)信息——它的通道數(shù)、采樣率等。
5、事件標簽
在教程數(shù)據(jù)集中腦電圖事件結(jié)構(gòu)字段type、position和latency是為數(shù)據(jù)集中標記的154個事件中的每個事件指定的。我們接下來編輯事件標簽的值。
選擇菜單Edit > Event Values 以調(diào)出一個窗口，在其中我們可以讀取和編輯這些值：
按上面的>、>>、<和<<鍵來滾動選擇標簽。現(xiàn)在，我們將簡要描述生成示例數(shù)據(jù)集的實驗。
6、示例實驗描述
在這個實驗中，有兩種類型的事件“square”和“rt”；“square”事件對應(yīng)于顯示器中綠色正方形中填充的方塊的出現(xiàn)，“rt”表示被試按下按鈕。
方塊可以顯示在屏幕上的五個正方形中的任何一個，一個是綠色的，其他四個是藍色的，沿著水平軸分布。這里我們只考慮左側(cè)的表示，即位置字段所指示的位置1和位置2（水平視角分別約為5.5度和2.7度）。
在這個實驗中，受試者僅關(guān)注計算機屏幕上的一個選定位置（綠色方塊），只有當方塊出現(xiàn)在這個位置時，他們才會快速按下拇指按鈕。他們將忽略其他位置（藍色方塊）出現(xiàn)的圓圈。為了減少下載和處理所需的數(shù)據(jù)量，此數(shù)據(jù)集僅包含單個受試者左視野注意位置的目標（即“正方形”）刺激。關(guān)于這個實驗的更多細節(jié)，見Makeig等人（Science,2002,295:690-694）。
在EEGLAB數(shù)據(jù)集中使用事件時，有兩個必需的事件字段：type和latency，以及任意數(shù)量的其他用戶定義的信息字段。這里必須理解字段的名稱是由創(chuàng)建數(shù)據(jù)集的用戶定義的，并且可以根據(jù)需要創(chuàng)建、保存和加載任意多個事件字段。
還要注意，type和latency（小寫）是EEGLAB明確識別的兩個關(guān)鍵字，除非導(dǎo)入epoch事件信息，否則這些字段必須由用戶定義（注意：如果只定義了field latency，那么EEGLAB將為每個事件創(chuàng)建一個常量默認值為1的字段類型）。除非定義了這兩個字段，否則EEGLAB將無法正確處理事件以提取epochs、繪制反應(yīng)時間等。導(dǎo)入數(shù)據(jù)教程將解釋如何導(dǎo)入事件信息和定義字段。
7、關(guān)于此數(shù)據(jù)集
這里我們描述如何編輯和查看描述當前數(shù)據(jù)集并作為該數(shù)據(jù)集的一部分存儲的文本字段，選擇Edit > About this dataset 。彈出一個文本編輯窗口，允許用戶編輯當前數(shù)據(jù)集的描述。
對于示例數(shù)據(jù)，我們輸入了以下描述，完成后按SAVE。
8、滾動查看數(shù)據(jù)
在這里，我們將學習如何可視化和拒絕連續(xù)EEG通道數(shù)據(jù)的選定部分。
選擇Plot > Channel data (scroll)，這將彈出eegplot（）下面的滾動數(shù)據(jù)顯示窗口，請注意，此示例數(shù)據(jù)文件包含的看起來是連續(xù)的EEG數(shù)據(jù)。
為了減少下載時間，這個“偽連續(xù)”EEG數(shù)據(jù)集實際上是通過連接80個獨立的3秒數(shù)據(jù)周期（稍后我們將再次分開）來構(gòu)建的，這解釋了在某些數(shù)據(jù)通道中可能會看到的一些突然跳變。
繪圖窗口的右側(cè)是垂直刻度值（及其單位微伏），表示垂直刻度條的“振幅”。在這種情況下，該值為80（微伏）。同樣的值也顯示在右下角的編輯框中，我們可以按照下面的說明更改它。通過反復(fù)單擊“-”按鈕或從鍵盤編輯文本值，將”scale”編輯文本框的值更改為大約50，然后按Enter鍵更新滾動窗口。
要調(diào)整顯示的時間范圍（即水平刻度），請選擇eegplot()菜單項Settings > Time range to display，然后將所需窗口長度設(shè)置為“10”秒，如下所示：
然后按OK使指示的更改生效。
要調(diào)整顯示的通道數(shù)，請選擇菜單項Settings > Number of channels to display，然后輸入要在屏幕上顯示的所需通道數(shù)（例如“16”）。
減少顯示的通道數(shù)將返回一個滾動窗口，在繪圖的左側(cè)有一個垂直的通道設(shè)置滑塊。使用它可以在所有通道中滾動顯示（垂直）。
要放大數(shù)據(jù)窗口的特定區(qū)域，請選擇菜單項Settings > Zoom off/on > Zoom on。現(xiàn)在使用鼠標，在數(shù)據(jù)區(qū)域周圍拖動一個矩形以放大它。滾動窗口現(xiàn)在看起來可能與下面的類似。單擊鼠標右鍵再次縮小。使用Setting > Zoom off/on > Zoom off菜單項關(guān)閉縮放選項。
要在數(shù)據(jù)上顯示水平（x）和垂直（y）柵格線，請選擇Display > Grid > X grid on 或Display > Grid > Y grid on. 。重復(fù)此過程以關(guān)閉任一網(wǎng)格線。
另外，使用者也可以刪除(REJECT)連續(xù)數(shù)據(jù)的任意部分。
關(guān)閉當前的窗口，并在主EEGLAB窗口中選擇Tools > Reject Continuous Data by eye。出現(xiàn)警告消息則單擊繼續(xù)。要REJECT選定的數(shù)據(jù)部分，首先在感興趣的時間區(qū)域水平拖動鼠標（按住鼠標左鍵），將其標記為REJECT。如果您愿意，可以用這種方式標記多個要REJECT的區(qū)域。要撤消REJECT標記，請單擊標記的區(qū)域。
注意：必須禁用縮放以選擇部分數(shù)據(jù)。
現(xiàn)在，要刪除標記的數(shù)據(jù)區(qū)域，請單擊（右下角）REJECT按鈕（上圖）。將創(chuàng)建一個新的數(shù)據(jù)集，刪除標記的區(qū)域。注意：EEGLAB還將向新數(shù)據(jù)集事件列表添加新的“REJECT邊界”事件，并將這些事件鏈接到包含在腦電圖結(jié)構(gòu)。REJECT邊界事件確保后續(xù)的數(shù)據(jù)選擇不會跨越非連續(xù)的REJECT邊界。有關(guān)REJECT連續(xù)數(shù)據(jù)區(qū)域和數(shù)據(jù)時期的更多詳細信息，請參閱數(shù)據(jù)REJECT教程。
單擊下面的”O(jiān)K”以創(chuàng)建新的數(shù)據(jù)集，并刪除標記的數(shù)據(jù)部分。
按”O(jiān)K”創(chuàng)建新數(shù)據(jù)集，EEGLAB主窗口現(xiàn)在看起來像：
由于我們執(zhí)行此刪除只是為了說明目的，請通過選擇主窗口菜單項Datasets > Dataset 1: Continous EEG data 切換回原始數(shù)據(jù)集。要刪除新創(chuàng)建的第二個數(shù)據(jù)集，請選擇File > Clear dataset(s) 或 Edit > Delete dataset(s)，然后輸入數(shù)據(jù)集索引“2”，如下所示，然后按“OK”。
第二個數(shù)據(jù)集現(xiàn)在將從EEGLAB/Matlab工作區(qū)中刪除。
（注意：在刪除第二個數(shù)據(jù)集之前，不必切換回第一個數(shù)據(jù)集。通過輸入由空格分隔的索引，也可以從該窗口中一次刪除多個數(shù)據(jù)集。）
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的EEGLAB合辑 | 第一节 往EEGLAB导入数据的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
- 上一篇： 远程协助——向日葵
- 下一篇： DirectX修复工具出现0xc0000