开源免费的脑电/脑磁图数据分析软件汇总
常用的MEG/EEG工具包
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MNE-python:?http://mne.tools
基于python開發(fā)的開源軟件包,用于探索,可視化和分析諸如MEG,EEG,sEEG,ECoG等人類神經(jīng)生理學數(shù)據(jù)。它包括用于數(shù)據(jù)輸入/輸出,預(yù)處理,可視化,源估計,時頻分析,連接性分析,機器學習和統(tǒng)計的模塊。 -
Brainstorm:https://neuroimage.usc.edu/brainstorm/Introduction
Brainstorm是一款基于MATLAB開發(fā)的協(xié)作式開源應(yīng)用程序,致力于分析腦部記錄:MEG,EEG,fNIRS,ECoG,深度電極和動物電生理學。包含常用的數(shù)據(jù)預(yù)處理、時頻分析、溯源分析等。 -
Fieldtrip:http://www.fieldtriptoolbox.org/
FieldTrip是用于MEG,EEG,iEEG和NIRS分析的MATLAB軟件工具箱。它提供了預(yù)處理和高級分析方法,例如時頻分析,使用偶極子進行源重構(gòu),分布式源和波束形成器以及非參數(shù)統(tǒng)計測試。它支持所有主要MEG系統(tǒng)以及最受歡迎的EEG,iEEG和NIRS系統(tǒng)的數(shù)據(jù)格式。可以輕松添加新的數(shù)據(jù)格式。 FieldTrip包含高級功能,您可以使用這些功能將自己的分析協(xié)議構(gòu)建為MATLAB腳本。(個人感覺難度稍大,適合已經(jīng)熟悉MATLAB編程的同學。) -
SPM:https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/
SPM基于Matlab的用于分析腦成像數(shù)據(jù)序列的軟件包。序列可以是來自不同隊列的一系列圖像,也可以是來自同一受試者的時間序列。旨在分析fMRI,PET,SPECT,EEG和MEG。 -
EEGLAB:https://sccn.ucsd.edu/eeglab/index.php
EEGLAB是一個交互式Matlab工具箱,用于處理連續(xù)的和事件相關(guān)的EEG,MEG和其他電生理數(shù)據(jù),并結(jié)合了獨立成分分析(ICA),時間/頻率分析,偽像排除,事件相關(guān)的統(tǒng)計數(shù)據(jù)以及幾種有用的平均值可視化模式和單次試驗數(shù)據(jù)。 EEGLAB在Linux,Unix,Windows和Mac OS X下運行。
分析和可視化復雜的網(wǎng)絡(luò)
- Brain Connectivity Toolbox (BCT) [31]
- BrainNet Viewer [32]
- the GCCA toolbox [33] www.anilseth.com,格蘭杰因果分析(Granger)
- the connectome mapper [34]
- Gephi [35]
- the connectome Viewer [36]
- the eConnectome [37]
- the Connectome Visualization Utility (CVU) [38]
- GraphVar [39].
其他的一些相關(guān)工具包
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FastICA: (www.cis.hut.fi/projects/ica/fastica)用于執(zhí)行ICA分解,在去除偽跡成分后,剩下的功能網(wǎng)絡(luò)就可以進行因果連接和源定位分析。
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GIFT 空間ICA分解,成分個數(shù)可以通過GIFT工具包的最小描述長度函數(shù)加以估計。
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biosig:?http://biosig.sourceforge.net/? BCI 特征提取,數(shù)據(jù)的預(yù)處理(去基線,去眼電肌電偽跡等),特征提取ERD/ERS和CSP等方法,分類器包括LDA和KNN.
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Letswave :免費?letswave.cn,https://www.letswave.org/
Letswave是一個免費的開源Matlab工具箱,用于分析EEG / MEG和其他神經(jīng)生理信號。該工具箱位于Github上。與其他信號處理工具箱相比,重點放在直觀且簡化的處理和可視化EEG數(shù)據(jù)。新版本提供了高級腳本編寫可能性。 -
Psychotoolbox 3: 刺激呈現(xiàn)和行為數(shù)據(jù)記錄
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cartool:https://sites.google.com/site/cartoolcommunity/
基于C++實現(xiàn)的高效多通道腦電圖的時空分析(只在windows平臺運行),詳細文獻解釋如下:
https://www.researchgate.net/publication/49772884_Spatiotemporal_analysis_of_multichannel_EEG_CARTOOL -
BrainWave(java)http://home.kpn.nl/stam7883/brainwave.html
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Harvard Automated Processing Pipeline for EEG (HAPPE):數(shù)據(jù)預(yù)處理、偽跡去除和數(shù)據(jù)質(zhì)量評估在實現(xiàn)。(https://github.com/lcnhappe/happe)
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batch electroencephalography automated processing platform (BEAPP) software實現(xiàn):批處理。(https://github.com/lcnbeapp/beapp)
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總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的开源免费的脑电/脑磁图数据分析软件汇总的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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