链特异性转录组测序
鏈特異性轉錄組測序
2015年10月06日 21:50:56?xxxxy314?閱讀數:1384更多 個人分類:?Bioinformatic常規轉錄組測序首先將mRNA片段化,然后采用隨機引物進行cDNA雙鏈的合成。因此,常規轉錄組在測序序列中不能提供鏈方向的特征信息,很難確定反義轉錄本,且不能真實的反映轉錄情況。
鏈特異性轉錄組測序(ssRNA-SEQ)是指在構建測序文庫時,利用高保真Taq酶將mRNA鏈的方向信息保存到測序文庫中。測序后的數據分析可確定轉錄本是來自正義還是反義DNA鏈。與普通轉錄組測序相比,它更能準確地統計轉錄本的數量和確定基因的結構,同時可以發現更多的反義轉錄本,目前被廣泛地應用于研究基因結構和基因表達調控等領域范圍。
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總結
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