【白话机器学习】算法理论+实战之K-Means聚类算法
1. 寫在前面
如果想從事數據挖掘或者機器學習的工作,掌握常用的機器學習算法是非常有必要的,常見的機器學習算法:
監督學習算法:邏輯回歸,線性回歸,決策樹,樸素貝葉斯,K近鄰,支持向量機,集成算法Adaboost等
無監督算法:聚類,降維,關聯規則, PageRank等
已發布:
【白話機器學習】算法理論+實戰之K近鄰算法
【白話機器學習】算法理論+實戰之決策樹
【白話機器學習】算法理論+實戰之樸素貝葉斯
【白話機器學習】算法理論+實戰之支持向量機(SVM)
【白話機器學習】算法理論+實戰之AdaBoost算法
為了詳細的理解這些原理,曾經看過西瓜書,統計學習方法,機器學習實戰等書,也聽過一些機器學習的課程,但總感覺話語里比較深奧,讀起來沒有耐心,并且理論到處有,而實戰最重要, 所以在這里想用最淺顯易懂的語言寫一個白話機器學習算法理論+實戰系列。
個人認為,理解算法背后的idea和使用,要比看懂它的數學推導更加重要。idea會讓你有一個直觀的感受,從而明白算法的合理性,數學推導只是將這種合理性用更加嚴謹的語言表達出來而已,打個比方,一個梨很甜,用數學的語言可以表述為糖分含量90%,但只有親自咬一口,你才能真正感覺到這個梨有多甜,也才能真正理解數學上的90%的糖分究竟是怎么樣的。如果算法是個梨,本文的首要目的就是先帶領大家咬一口。另外還有下面幾個目的:
檢驗自己對算法的理解程度,對算法理論做一個小總結
能開心的學習這些算法的核心思想, 找到學習這些算法的興趣,為深入的學習這些算法打一個基礎。
每一節課的理論都會放一個實戰案例,能夠真正的做到學以致用,既可以鍛煉編程能力,又可以加深算法理論的把握程度。
也想把之前所有的筆記和參考放在一塊,方便以后查看時的方便。
學習算法的過程,獲得的不應該只有算法理論,還應該有樂趣和解決實際問題的能力!
今天是白話機器學習算法理論+實戰的第八篇 之KMeans聚類算法, 聽到這個名字,你可別和第七篇K近鄰算法搞混了,K-Means 是一種非監督學習,解決的是聚類問題,這里的K表示的是聚成K類。而之前的K近鄰算法是監督學習算法,解決的是分類問題,這里的K表示的是K個鄰居。相差十萬八千里吧, 一條取經路呢。一定要區分開。這個算法也不是很難,前面說道,K近鄰算法的原理可以用八個大字叫做“近朱者赤,近墨者黑”來總結,這里我依然放出八個大字:“人以類聚,物以群分”,形容KMeans最好不過了。
通過今天的學習,掌握KMeans算法的工作原理,然后會使用sklearn實現KMeans聚類,最后我們來做一個實戰項目:如何使用KMeans對圖像進行分割??下面我們開始吧。
大綱如下:
KMeans聚類的工作原理(結合足球隊等級劃分談一談)
20支亞洲足球隊,你能劃分出等級嗎?(KMeans聚類應用)
KMeans聚類的實戰:圖像分割
OK, let's go!
2. K-Means的工作原理
上面我們說過,K-Means 是一種非監督學習,解決的是聚類問題。K 代表的是 K 類,Means 代表的是中心,你可以理解這個算法的本質是確定 K 類的中心點,當你找到了這些中心點,也就完成了聚類。
那么這里有兩個問題:如何確定K類的中心點?如何把其他類劃分到K個類中去?
先別慌, 先和我考慮一個場景,假設我有 20 支亞洲足球隊,想要將它們按照成績劃分成 3 個等級,可以怎樣劃分?
元芳, 你怎么看?
★對亞洲足球隊的水平,你可能也有自己的判斷。比如一流的亞洲球隊有誰?你可能會說伊朗或韓國。二流的亞洲球隊呢?你可能說是中國。三流的亞洲球隊呢?你可能會說越南。
”其實這些都是靠我們的經驗來劃分的,那么伊朗、中國、越南可以說是三個等級的典型代表,也就是我們每個類的中心點。
所以回過頭來,如何確定 K 類的中心點?一開始我們是可以隨機指派的,當你確認了中心點后,就可以按照距離將其他足球隊劃分到不同的類別中。
這也就是 K-Means 的中心思想,就是這么簡單直接。
你可能會問:如果一開始,選擇一流球隊是中國,二流球隊是伊朗,三流球隊是韓國,中心點選擇錯了怎么辦?其實不用擔心,K-Means 有自我糾正機制,在不斷的迭代過程中,會糾正中心點。中心點在整個迭代過程中,并不是唯一的,只是你需要一個初始值,一般算法會隨機設置初始的中心點。
那下面就給出K-Means的工作原理,兩步就搞定,就是那兩個問題的解決:
選取 K 個點作為初始的類中心點,這些點一般都是從數據集中隨機抽取的;
將每個點分配到最近的類中心點,這樣就形成了 K 個類,然后重新計算每個類的中心點;(這個怎么算最近,一般是歐幾里得距離公式, 那么怎么重新計算每個類的中心點, 每個維度的平均值就可以的)
重復第二步,直到類不發生變化,或者你也可以設置最大迭代次數,這樣即使類中心點發生變化,但是只要達到最大迭代次數就會結束。
什么?還不明白??好吧,那直接看看亞洲球隊聚類的例子吧
3. 如何給亞洲球隊做聚類
對于機器來說需要數據才能判斷類中心點,所以下面整理了 2015-2019 年亞洲球隊的排名,如下表所示。
我來說明一下數據概況。
其中 2019 年國際足聯的世界排名,2015 年亞洲杯排名均為實際排名。2018 年世界杯中,很多球隊沒有進入到決賽圈,所以只有進入到決賽圈的球隊才有實際的排名。如果是亞洲區預選賽 12 強的球隊,排名會設置為 40。如果沒有進入亞洲區預選賽 12 強,球隊排名會設置為 50。我們怎么做聚類呢?可以跟著我的思路走了:
首先,針對上面的排名,我們需要做的就是數據規范化,你可以把這些值劃分到[0,1]或者按照均值為 0,方差為 1 的正態分布進行規范化。我先把數值規范化到了[0,1]空間中,得到了下面的數值表:如果我們隨機選取中國、日本、韓國為三個類的中心點,我們就需要看下這些球隊到中心點的距離。
下面就是把其其他樣本根據距離中心點的遠近劃分到這三個類中去,有關距離可以參考KNN那一篇博客。?常用的有歐氏距離,曼哈頓距離等。這里采用歐式距離。
歐氏距離是最常用的距離計算方式,這里選擇歐氏距離作為距離的標準,計算每個隊伍分別到中國、日本、韓國的距離,然后根據距離遠近來劃分。我們看到大部分的隊,會和中國隊聚類到一起。這里我整理了距離的計算過程,比如中國和中國的歐氏距離為 0,中國和日本的歐式距離為 0.732003。如果按照中國、日本、韓國為 3 個分類的中心點,歐氏距離的計算結果如下表所示:然后我們再重新計算這三個類的中心點,如何計算呢?最簡單的方式就是取平均值,然后根據新的中心點按照距離遠近重新分配球隊的分類,再根據球隊的分類更新中心點的位置。計算過程這里不展開,最后一直迭代(重復上述的計算過程:計算中心點和劃分分類)到分類不再發生變化,可以得到以下的分類結果:所以我們能看出來第一梯隊有日本、韓國、伊朗、沙特、澳洲;第二梯隊有中國、伊拉克、阿聯酋、烏茲別克斯坦;第三梯隊有卡塔爾、泰國、越南、阿曼、巴林、朝鮮、印尼、敘利亞、約旦、科威特和巴勒斯坦。
這個就是KMeans進行聚類的過程了。簡單點,就是反復兩個過程:
確定中心點
把其他的點按照距中心點的遠近歸到相應的中心點
上面這個也可以使用sklearn中的K-Means進行實戰一下子,作為圖像分割圖像的準備期。
4. KMeans聚類實戰:如何使用KMeans對圖像進行分割?
還是老規矩,我們在實戰之前,先看一下如何調用sklearn實現KMeans。
4.1 如何使用sklearn中的KMeans算法
sklearn 是 Python 的機器學習工具庫,如果從功能上來劃分,sklearn 可以實現分類、聚類、回歸、降維、模型選擇和預處理等功能。這里我們使用的是 sklearn 的聚類函數庫,因此需要引用工具包,具體代碼如下:
from sklearn.cluster import KMeans當然 K-Means 只是 sklearn.cluster 中的一個聚類庫,實際上包括 K-Means 在內,sklearn.cluster 一共提供了 9 種聚類方法,比如 Mean-shift,DBSCAN,Spectral clustering(譜聚類)等。這些聚類方法的原理和 K-Means 不同,這里不做介紹。
我們看下 K-Means 如何創建:
KMeans(n_clusters=8, init='k-means++', n_init=10, max_iter=300, tol=0.0001, precompute_distances='auto', verbose=0, random_state=None, copy_x=True, n_jobs=1, algorithm='auto')這些參數解釋一下:
n_clusters: 即 K 值,一般需要多試一些 K 值來保證更好的聚類效果。你可以隨機設置一些 K 值,然后選擇聚類效果最好的作為最終的 K 值;max_iter:最大迭代次數,如果聚類很難收斂的話,設置最大迭代次數可以讓我們及時得到反饋結果,否則程序運行時間會非常長;
n_init:初始化中心點的運算次數,默認是 10。程序是否能快速收斂和中心點的選擇關系非常大,所以在中心點選擇上多花一些時間,來爭取整體時間上的快速收斂還是非常值得的。由于每一次中心點都是隨機生成的,這樣得到的結果就有好有壞,非常不確定,所以要運行 n_init 次, 取其中最好的作為初始的中心點。如果 K 值比較大的時候,你可以適當增大 n_init 這個值;
init:即初始值選擇的方式,默認是采用優化過的 k-means++ 方式,你也可以自己指定中心點,或者采用 random 完全隨機的方式。自己設置中心點一般是對于個性化的數據進行設置,很少采用。random 的方式則是完全隨機的方式,一般推薦采用優化過的 k-means++ 方式;
algorithm:k-means 的實現算法,有“auto” “full”“elkan”三種。一般來說建議直接用默認的"auto"。簡單說下這三個取值的區別,如果你選擇"full"采用的是傳統的 K-Means 算法,“auto”會根據數據的特點自動選擇是選擇“full”還是“elkan”。我們一般選擇默認的取值,即“auto” 。
在創建好 K-Means 類之后,就可以使用它的方法,最常用的是 fit 和 predict 這個兩個函數。你可以單獨使用 fit 函數和 predict 函數,也可以合并使用 fit_predict 函數。其中 fit(data) 可以對 data 數據進行 k-Means 聚類。predict(data) 可以針對 data 中的每個樣本,計算最近的類。
下面我們先跑一遍20支亞洲球隊的聚類問題:數據集在這下載
# coding: utf-8 from sklearn.cluster import KMeans from sklearn import preprocessing import pandas as pd import numpy as np # 輸入數據 data = pd.read_csv('data.csv', encoding='gbk') train_x = data[["2019年國際排名","2018世界杯","2015亞洲杯"]] df = pd.DataFrame(train_x) kmeans = KMeans(n_clusters=3) # 規范化到[0,1]空間 min_max_scaler=preprocessing.MinMaxScaler() train_x=min_max_scaler.fit_transform(train_x) # kmeans算法 kmeans.fit(train_x) predict_y = kmeans.predict(train_x) # 合并聚類結果,插入到原數據中 result = pd.concat((data,pd.DataFrame(predict_y)),axis=1) result.rename({0:u'聚類'},axis=1,inplace=True) print(result)運行結果如下:
國家 2019年國際排名 2018世界杯 2015亞洲杯 聚類 0 中國 73 40 7 2 1 日本 60 15 5 0 2 韓國 61 19 2 0 3 伊朗 34 18 6 0 4 沙特 67 26 10 0 5 伊拉克 91 40 4 2 6 卡塔爾 101 40 13 1 7 阿聯酋 81 40 6 2 8 烏茲別克斯坦 88 40 8 2 9 泰國 122 40 17 1 10 越南 102 50 17 1 11 阿曼 87 50 12 1 12 巴林 116 50 11 1 13 朝鮮 110 50 14 1 14 印尼 164 50 17 1 15 澳洲 40 30 1 0 16 敘利亞 76 40 17 1 17 約旦 118 50 9 1 18 科威特 160 50 15 1 19 巴勒斯坦 96 50 16 14.2 如何用KMeans對圖像進行分割?
圖像分割就是利用圖像自身的信息,比如顏色、紋理、形狀等特征進行劃分,將圖像分割成不同的區域,劃分出來的每個區域就相當于是對圖像中的像素進行了聚類。單個區域內的像素之間的相似度大,不同區域間的像素差異性大。這個特性正好符合聚類的特性,所以你可以把圖像分割看成是將圖像中的信息進行聚類。當然聚類只是分割圖像的一種方式,除了聚類,我們還可以基于圖像顏色的閾值進行分割,或者基于圖像邊緣的信息進行分割等。
將微信開屏封面進行分割。
我們現在用 K-Means 算法對微信頁面進行分割。微信開屏圖如下所示:我們先設定下聚類的流程,聚類的流程和分類差不多,如圖所示:在準備階段里,我們需要對數據進行加載。因為處理的是圖像信息,我們除了要獲取圖像數據以外,還需要獲取圖像的尺寸和通道數,然后基于圖像中每個通道的數值進行數據規范化。這里我們需要定義個函數 load_data,來幫我們進行圖像加載和數據規范化。代碼如下:
# 加載圖像,并對數據進行規范化 def load_data(filePath):# 讀文件f = open(filePath,'rb')data = []# 得到圖像的像素值img = image.open(f)# 得到圖像尺寸width, height = img.sizefor x in range(width):for y in range(height):# 得到點(x,y)的三個通道值c1, c2, c3 = img.getpixel((x, y))data.append([c1, c2, c3])f.close()# 采用Min-Max規范化mm = preprocessing.MinMaxScaler()data = mm.fit_transform(data)return np.mat(data), width, height因為 jpg 格式的圖像是三個通道 (R,G,B),也就是一個像素點具有 3 個特征值。這里我們用 c1、c2、c3 來獲取平面坐標點 (x,y) 的三個特征值,特征值是在 0-255 之間。
為了加快聚類的收斂,我們需要采用 Min-Max 規范化對數據進行規范化。我們定義的 load_data 函數返回的結果包括了針對 (R,G,B) 三個通道規范化的數據,以及圖像的尺寸信息。在定義好 load_data 函數后,我們直接調用就可以得到相關信息,代碼如下:
# 加載圖像,得到規范化的結果img,以及圖像尺寸 img, width, height = load_data('./weixin.jpg')假設我們想要對圖像分割成 2 部分,在聚類階段,我們可以將聚類數設置為 2,這樣圖像就自動聚成 2 類。代碼如下:
# 用K-Means對圖像進行2聚類 kmeans =KMeans(n_clusters=2) kmeans.fit(img) label = kmeans.predict(img) # 將圖像聚類結果,轉化成圖像尺寸的矩陣 label = label.reshape([width, height]) # 創建個新圖像pic_mark,用來保存圖像聚類的結果,并設置不同的灰度值 pic_mark = image.new("L", (width, height)) for x in range(width):for y in range(height):# 根據類別設置圖像灰度, 類別0 灰度值為255, 類別1 灰度值為127pic_mark.putpixel((x, y), int(256/(label[x][y]+1))-1) pic_mark.save("weixin_mark.jpg", "JPEG")代碼中有一些參數,下面說一下這些參數的作用和設置方法:
★我們使用了 fit 和 predict 這兩個函數來做數據的訓練擬合和預測,因為傳入的參數是一樣的,我們可以同時進行 fit 和 predict 操作,這樣我們可以直接使用 fit_predict(data) 得到聚類的結果。得到聚類的結果 label 后,實際上是一個一維的向量,我們需要把它轉化成圖像尺寸的矩陣。label 的聚類結果是從 0 開始統計的,當聚類數為 2 的時候,聚類的標識 label=0 或者 1。
如果你想對圖像聚類的結果進行可視化,直接看 0 和 1 是看不出來的,還需要將 0 和 1 轉化為灰度值。灰度值一般是在 0-255 的范圍內,我們可以將 label=0 設定為灰度值 255,label=1 設定為灰度值 127。具體方法是用 int(256/(label[x][y]+1))-1。可視化的時候,主要是通過設置圖像的灰度值進行顯示。所以我們把聚類 label=0 的像素點都統一設置灰度值為 255,把聚類 label=1 的像素點都統一設置灰度值為 127。原來圖像的灰度值是在 0-255 之間,現在就只有 2 種顏色(也就是灰度為 255,和灰度 127)。
有了這些灰度信息,我們就可以用 image.new 創建一個新的圖像,用 putpixel 函數對新圖像的點進行灰度值的設置,最后用 save 函數保存聚類的灰度圖像。這樣你就可以看到聚類的可視化結果了,如下圖所示:如果我們想要分割成 16 個部分,該如何對不同分類設置不同的顏色值呢?這里需要用到 skimage 工具包,它是圖像處理工具包。你需要使用 pip install scikit-image 來進行安裝。這段代碼可以將聚類標識矩陣轉化為不同顏色的矩陣:
from skimage import color # 將聚類標識矩陣轉化為不同顏色的矩陣 label_color = (color.label2rgb(label)*255).astype(np.uint8) label_color = label_color.transpose(1,0,2) images = image.fromarray(label_color) images.save('weixin_mark_color.jpg')代碼中,我使用 skimage 中的 label2rgb 函數來將 label 分類標識轉化為顏色數值,因為我們的顏色值范圍是[0,255],所以還需要乘以 255 進行轉化,最后再轉化為 np.uint8 類型。unit8 類型代表無符號整數,范圍是 0-255 之間。
得到顏色矩陣后,你可以把它輸出出來,這時你發現輸出的圖像是顛倒的,原因可能是圖像源拍攝的時候本身是倒置的。我們需要設置三維矩陣的轉置,讓第一維和第二維顛倒過來,也就是使用 transpose(1,0,2),將原來的 (0,1,2)順序轉化為 (1,0,2) 順序,即第一維和第二維互換。
最后我們使用 fromarray 函數,它可以通過矩陣來生成圖片,并使用 save 進行保存。最后得到的分類標識顏色化圖像是這樣的:剛才我們做的是聚類的可視化。如果我們想要看到對應的原圖,可以將每個簇(即每個類別)的點的 RGB 值設置為該簇質心點的 RGB 值,也就是簇內的點的特征均為質心點的特征。
我給出了完整的代碼,代碼中,我可以把范圍為 0-255 的數值投射到 1-256 數值之間,方法是對每個數值進行加 1,你可以自己來運行下:
# -*- coding: utf-8 -*- # 使用K-means對圖像進行聚類,并顯示聚類壓縮后的圖像 import numpy as np import PIL.Image as image from sklearn.cluster import KMeans from sklearn import preprocessing import matplotlib.image as mpimg # 加載圖像,并對數據進行規范化 def load_data(filePath):# 讀文件f = open(filePath,'rb')data = []# 得到圖像的像素值img = image.open(f)# 得到圖像尺寸width, height = img.sizefor x in range(width):for y in range(height):# 得到點(x,y)的三個通道值c1, c2, c3 = img.getpixel((x, y))data.append([(c1+1)/256.0, (c2+1)/256.0, (c3+1)/256.0])f.close()return np.mat(data), width, height # 加載圖像,得到規范化的結果imgData,以及圖像尺寸 img, width, height = load_data('./weixin.jpg') # 用K-Means對圖像進行16聚類 kmeans =KMeans(n_clusters=16) label = kmeans.fit_predict(img) # 將圖像聚類結果,轉化成圖像尺寸的矩陣 label = label.reshape([width, height]) # 創建個新圖像img,用來保存圖像聚類壓縮后的結果 img=image.new('RGB', (width, height)) for x in range(width):for y in range(height):c1 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 0]c2 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 1]c3 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 2]img.putpixel((x, y), (int(c1*256)-1, int(c2*256)-1, int(c3*256)-1)) img.save('weixin_new.jpg')結果如下:你可以看到我沒有用到 sklearn 自帶的 MinMaxScaler,而是自己寫了 Min-Max 規范化的公式。這樣做的原因是我們知道 RGB 每個通道的數值在[0,255]之間,所以我們可以用每個通道的數值 +1/256,這樣數值就會在[0,1]之間。
對圖像做了 Min-Max 空間變換之后,還可以對其進行反變換,還原出對應原圖的通道值。對于點 (x,y),我們找到它們所屬的簇 label[x,y],然后得到這個簇的質心特征,用 c1,c2,c3 表示:
c1 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 0] c2 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 1] c3 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 2]因為 c1, c2, c3 對應的是數據規范化的數值,因此我們還需要進行反變換,即:
c1=int(c1*256)-1 c2=int(c2*256)-1 c3=int(c3*256)-1然后用 img.putpixel 設置點 (x,y) 反變換后得到的特征值。最后用 img.save 保存圖像。
5. 總結
好了,寫到這關于KMeans,就要結束了。下面快速的回顧一下:
首先,通過足球隊聚類的例子引出了KMeans聚類的工作原理,簡單來說兩步,你可以回憶回憶。
然后,通過KMeans實現了對圖像分割的實戰,另外我們還學習了如何在 Python 中如何對圖像進行讀寫,具體的代碼如下,上文中也有相應代碼,你也可以自己對應下:
import PIL.Image as image # 得到圖像的像素值 img = image.open(f) # 得到圖像尺寸 width, height = img.size這里會使用 PIL 這個工具包,它的英文全稱叫 Python Imaging Library,顧名思義,它是 Python 圖像處理標準庫。同時我們也使用到了 skimage 工具包(scikit-image),它也是圖像處理工具包。用過 Matlab 的同學知道,Matlab 處理起圖像來非常方便。skimage 可以和它相媲美,集成了很多圖像處理函數,其中對不同分類標識顯示不同的顏色。在 Python 中圖像處理工具包,我們用的是 skimage 工具包。
好了,KMeans的故事就到這里吧。
參考:
http://note.youdao.com/noteshare?id=10dac8bb5d83358ffe73c792e1490a7b&sub=C7A3E74A1088435ABBE11AB91AC37194
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總結
以上是生活随笔為你收集整理的【白话机器学习】算法理论+实战之K-Means聚类算法的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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