qPCR实验疑难杂问解答
看了別人文獻里的PCR方法,照搬了人家的引物,還是做得每次結果都不一樣?不是Ct值出現過晚,就是擴增曲線變化很奇怪,總是操作過程中時不時有這樣或者那樣的問題,遇到這些問題怎么處理呢?實踐出真知,今天給大家匯總一下qPCR常見的疑難解答,看下方詳細介紹:
疑問1:Ct值出現過晚(Ct>38)
答:
擴增效率低,反應條件不夠優化,降低退火溫度,增加鎂離子濃度。
反應成分降解或加樣量不足
PCR產物過長,一般采用80-150bp.
疑問2:標準曲線線性關系不佳
答:
加樣存在誤差,是樣品濃度不成梯度。
標準品出現降解,避免反復凍融。
引物或者探針設計不佳。
模板中存在抑制物或模板濃度過高。
疑問3:溶解曲線存在多個主峰
答:
引物設計不夠優化。
引物濃度不佳,上下游引物濃度比例不一致。
鎂離子濃度過高。
模板基因組的污染。
疑問4:同一樣品中,其中某一個熒光信號特別強。
答:
試劑配制時反應液沒有完全溶化,導致探針量在一管增多。
試劑配制時沒有充分混勻致各管中各成分的量不同。
PCR儀熱槽被熒光物質污染,需要清除熱槽中的污染。
疑問5:擴增曲線有一向上或向下的尖峰?
答:
反應過程中電壓不穩定
可能在20個循環左右時,儀器有停下或儀器有開蓋,使光線突然增強
如果尖峰向下,可能是由鹵素燈老化所致,這時應更換。
疑問6:部分樣本擴增效率過低?
答:
提取液殘留,一定程度抑制了PCR反應
反應液未嚴格取量混勻或分裝不均勻
試劑失效
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總結
以上是生活随笔為你收集整理的qPCR实验疑难杂问解答的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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