最近 CSCD 更新了2.0 的版本：CSCD2.0

相比較之前的版本， CSCD2 主要是增加了分析的數(shù)據(jù)量。在 2.0 版本當(dāng)中，作者從 ENCODE 和 SRA 數(shù)據(jù)庫中收集了來自組織或細(xì)胞系的 1113 個(gè)樣本的 RNA-Seq 數(shù)據(jù)集，包括 ==472 個(gè)癌組織樣本、353 個(gè)正常組織樣本、91 個(gè)癌細(xì)胞系樣本和 197 個(gè)正常細(xì)胞系樣本==。

功能方面的話，和之前版本沒有多大的區(qū)別，主要也是用來預(yù)測 circRNA 和 miRNA/RBP 的相互作用。但是在數(shù)據(jù)查詢方面的， 1.0的版本只提供了基于 circRNA 的查詢。在 2.0 版本當(dāng)中，則可以基于 miRNA/RBP 來進(jìn)行查詢。

最后在 2.0 當(dāng)中也提供了數(shù)據(jù)下載的功能。有興趣 DIY 的可以直接下載原始數(shù)據(jù)。

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的circRNA相互作用预测数据库CSCD2的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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