THANATOS数据库(自噬调节相关蛋白及其翻译后修饰信息数据库)使用指南
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THANATOS數據庫(THe?Autophagy,?Necrosis,?ApopTosis?OrchestratorS)收錄細胞凋亡、自噬和程序性壞死調控相關蛋白及其翻譯后修飾信息。
基于PubMed文獻報道中4,237個實驗鑒定的自噬和細胞死亡調控相關蛋白質信息,其中3,882個蛋白質來自于8個模式生物,即H. sapiens(Homo sapien, 人),M. musculus(mus musculus, 小鼠), R. norvegicus(Rattus norvegicus, 大鼠), D. rerio(Danio rerio, 斑馬魚), S. cerevisiae(Saccharomyces cerevisiae, 酵母), D. melanogaster(Drosophila melanogaster,果蠅), C. elegans(Caenorhabditis elegans, 秀隱線蟲)和A. thaliana(Arabidopsis thaliana, 擬南芥)。
同時在164個真核生物中進行直系同源比對,提供某個蛋白或信號通路在不同物種之間的保守性信息,集成并整合目標蛋白已經鑒定的蛋白翻譯后修飾(PTM)信息,構建凋亡、自噬及壞死相關通路蛋白調控/相互作用網絡。目前,THANATOS數據庫包含191,543個獨特的蛋白質條目,持續更新中。
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總結
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