3Dslicer2:数据与帮助
生活随笔
收集整理的這篇文章主要介紹了
3Dslicer2:数据与帮助
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
1.數據加載
1.1 3Dslicer支持的數據格式
Slicer支持多種醫學圖像數據的處理。由于Slicer的功能通過模塊實現。數據類型也由模塊來進行使用,某一個模塊支持的數據類型可能有多種,例如數據模塊可以對場景數據進行讀取、寫入的操作;體數據模塊對影像圖數據提供支持,這些影像圖數據的格式不僅包括jpeg、png等Windows操作系統下最常見的圖像文件格式,還包括標準的醫學影像數據DICOM等。Slicer支持的場景數據有MRML格式,MRB格式和ZIP格式三種。MRML(Medical Reality Modeling Language)用于描述醫學圖像三維場景,是3D Slicer獨創的一種數據格式。每一個MRML Scene數據對象都包含了Slicer 應用程序的狀態、原始數據和可視化參數等多種數據,例如(體數據;模型數據;圖像變換方式數據;基準點數據等等)。每一個數據類型是由特定的MRML Node來表示的。MRML Scene 是MRML Nodes 的集合。
3D Slicer為了能夠處理不同醫學影像產生的醫學圖像,引入了對DICOM格式文件的支持。雖然3D Slicer支持DICOM數據格式有著良好的支持,但是對于醫學影像設備廠商生產的設備產生的擴散張量成像數據并不完全符合DICOM標準,因此,為了更好的處理DWI成像,3D Slicer引入了一種新的數據格式,即NRRD數據格式。NRRD數據可以完全表示DWI圖像的所有信息,使用兩種后綴名,“nrrd”和“nhrd”,后者一般在舊版本的Slicer中使用。
1.2 添加數據
Slicer通過功能模塊實現功能,雖然這些功能模塊數量眾多,支持的數據格式也不盡相同。Slicer將除DICOM數據之外的所有數據類型添加到Slicer中的過程都是通過“添加數據對話框”來完成,數據被添加到現有的場景。而DICOM數據由于標準較多,通過一個獨立的功能模塊進行添加,后面再詳細學習。“AddData”既可以通過主菜單打開,也可以通過工具欄、快捷鍵等多種方式打開,對話框的界面如下圖所示:
- ChooseDirectorytoAdd:添加該文件夾下的所有文件;
- ChooseFilestoAdd:添加所有指定的文件;
- ShowOptions:復選框顯示/隱藏加載一個對象時的屬性的各種選項;
- Reset:清除加載文件列表;
- OK:確認加載;
- Cancel:取消加載;
2.數據保存
Slicer可以保存當前場景(包括所有場景快照,基準點列表等)或者單個數據集,界面如圖所示:為了給保存數據提供更加豐富的選項,“保存場景對話框”的界面并沒有使用系統自帶的資源管理器。
總結
以上是生活随笔為你收集整理的3Dslicer2:数据与帮助的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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