寫在前面

最近忙于分析數據寫文章，這個禮拜都沒有看新的文獻，也沒研究新的繪圖方法，就把之前整理的一個比較拿出來和大家分享一下吧。

主要內容是對于系統發育分析和系統進化樹構建的一些基礎知識，因為筆記整理好也有兩三年了，具體內容來源我已經忘記了，可能是來自于某一本書，也有一些應該是來自于網上的文章，但應該不是直接抄了某一篇文章，如果某位大神發現其中部分內容與之前寫的文章相近，覺得有侵權嫌疑的請與我聯系，謝謝！

分子進化

在長期的進化過程中，生物大分子在分子水平上的變異會被積累起來，形成與其祖先存在很大差異的生物大分子，因此，在核酸和蛋白質分子組成的序列中，蘊藏著大量生物進化的遺傳信息，根據各種生物間在分子水平上的進化關系，可以建立分子進化的系統發育樹，估測物種間的親緣關系，直觀地闡明物種間的進化歷程。

分子進化有兩個顯著特點，即進化速率的相對恒定性和進化的保守性。

進化速率的相對恒定是指核酸和蛋白質內的核苷酸或氨基酸替換頻率保持穩定，生物大分子隨時間的變化比例幾乎是恒定的，這是確定物種分歧時間的理論依據。

進化的保守性是指功能重要的大分子的進化速率要遠遠低于功能不重要的大分子，也就是用保守標志基因鑒定物種的理論依據。

分子進化的中性學說認為多數或絕大多數突變都是中性的或近中性的，即無所謂有利或不利，自然選擇對它們不起作用，因此對于這些中性突變不會發生自然選擇與適者生存的情況，生物的進化主要是中性突變在自然群體中進行隨機的“遺傳漂變”的結果，而與選擇無關（我個人比較傾向這種學說，“優勝劣汰，適者生存”不太靠譜）。

系統發育分析

往期精品(點擊圖片直達文字對應教程)

機器學習

后臺回復“生信寶典福利第一波”或點擊閱讀原文獲取教程合集

---

總結

以上是生活随笔為你收集整理的分子进化和系统发育的基础知识的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

如果覺得生活随笔網站內容還不錯，歡迎將生活随笔推薦給好友。