维达健基因董事长徐谋胜说,在中国人中影响最大的乳腺癌基因是ESR1(雌激素受体基因)?
生活随笔
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维达健基因董事长徐谋胜说,在中国人中影响最大的乳腺癌基因是ESR1(雌激素受体基因)?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
說實話,不知是文案編輯水平問題還是其他原因,一段話讀下來覺得各種語焉不詳。“在中國人中影響最大的乳腺癌基因是ESR1(雌激素受體基因),中國一半的乳腺癌患者和這個基因有關。ESR1的一個風險變異使乳腺癌的風險上升30%,雙份變異上升66%,和高膽固醇對冠心病的貢獻差不多了”這個“ESR1基因在中國人中影響最大,中國一半的乳腺癌患者和這個基因有關。”,是指何種有關?是基因的表達陽性情況嗎?現在常規乳腺癌檢測指標中的確都有ER表達水平的檢測,可接下來的描述“ESR1的一個風險變異使乳腺癌的風險上升30%,雙份變異上升66%”從這句話中可以推斷出原來徐博的意思是ESR1基因上存在的“風險位點”,也就是DNA水平上的“堿基變異”會對中國人群乳腺癌風險造成影響。問題來了,ESR1基因的“風險變異”是影響乳腺癌患病風險,那么是通過什么形式來影響?“一個風險變異上升30%”之后,“雙份變異上升66%”。絞盡腦汁能猜測這句話可能是想用來表達這個SNP位點的雜合基因型和純合基因型的風險位點,于是按照這個思路簡單在PUBMED上檢索了一下包含“ESR1”,“BREAST CANCER”,“CHINESE”,“RISK”等相關關鍵詞的研究文獻,發現幾十篇研究ESR1基因與中國人群乳腺癌風險相關的文獻(只隨便找了一些PMID:24127041,23486537,23272245,21528353,22879957,23609471,19760036,25116933)。某些GWAS研究發現ESR1基因一系列相關SNP位點(rs2046210,rs2228480,rs3798758,rs3734805,rs3757318,rs9383951,rs2747648, rs1062577, rs3020314)經過統計學分析表明與乳腺癌風險升高/降低相關。如果沒弄錯,這類文獻中“一個風險變異”其實指外顯率較低的常見多態性位點,所造成的風險升高/降低大多以HR/RR/OR表述,不知道報道所言”30%“和”66%“是否指OR/RR/HR=1.3/1.66。然而前文“BRCA1,這個基因突變使乳腺癌的風險高達87%”中87%是積累風險(cumulative risk,定義可參考文獻PMID: 9497246),兩者在定義,計算方式,用途等方面均無法直接比較。混淆這些概念,是否有魚目混珠之嫌?當然,如果有ESR1基因在中國人群乳腺癌方面的積累風險研究,希望能分享并共同學習。除此之外,檢索過程中,一些研究發現ESR1基因上部分SNP位點多態性可能與ER表達情況相關(PMID: 19760036,25116933),至于這些SNP位點多態性影響ER表達以致與乳腺癌的關聯仍需要通過濕實驗探明。維達健公司創始人徐博士在哈佛公衛學院從事過癌癥流行病學研究,在GWAS算法上頗有建樹(PMCID: PMC3148549),本還輪不到我等班門弄斧之徒來普及概念。只是,不論是否出于推進所在公司基因檢測的目的,以上這段存在多處偷換概念的話出自如此專業人士之口,無論如何不能相信。
總結
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