有的。一般是使用比對軟件直接將測序得到序列與miRBase數據庫比對來鑒定miRNA的，用來比對的軟件一般是bowtie，用來鑒定和識別新miRNA的話，則使用miRDeep2。miRBase數據庫主要收集了現在已知miRNA的序列，并有注釋和miRNA靶基因等信息，一般要識別已知miRNA，就可以用bowtie將序列比對到miRBase數據庫來確定，但是要鑒定新的miRNA只用這個數據庫就不夠了，就需要依據miRNA的結構特點，進行預測，這時候就要用到miRDeep2了。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的有没有软件，直接给一大段序列，然后预测里面是不是有miRNA呢？的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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