基因表达水平检测需要注意什么问题?各种技术的优缺点是什么?
生活随笔
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基因表达水平检测需要注意什么问题?各种技术的优缺点是什么?
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我說一下我知道的部分。熒光定量PCR需要采用具有5‘-3’外切酶活性的Taq酶擴增,合成一對普通引物和一條熒光雙標記的Taq-Man探針。要準確體現表達水平,半定量RT-PCR, 熒光定量PCR擴增的循環數比常規少,擴增產物一般都要求處在線性區,如果擴增過程已到達平臺區,擴增產物就不能反映基因拷貝數的高低。
在檢測基因表達上qPCR應該比Northern blot更加靈敏,定量上也更準確,而且Northern blot在操作中比qPCR更容易被RNase污染。Northern blot用RNA上樣,中間可能涉及RNA提取,放置降解,等量上樣等問題,持續時間長,是傳統的方法。qPCR不用調模板濃度,根據管家基因歸一化,熒光檢測,快速。為保證結果正確,需一定的重復次數。
在檢測基因表達上qPCR應該比Northern blot更加靈敏,定量上也更準確,而且Northern blot在操作中比qPCR更容易被RNase污染。Northern blot用RNA上樣,中間可能涉及RNA提取,放置降解,等量上樣等問題,持續時間長,是傳統的方法。qPCR不用調模板濃度,根據管家基因歸一化,熒光檢測,快速。為保證結果正確,需一定的重復次數。
總結
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