对于非典型的植物基因,有什么研究方法吗?
生活随笔
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对于非典型的植物基因,有什么研究方法吗?
小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
有的,可以利用計算機模型進行功能預測后再研究。隨著近年來生物信息學分析的大力發(fā)展,已經(jīng)可以通過一些計算模型來進行基因功能的研究。針對非典型的植物基因,現(xiàn)在也有一種被稱為AraNet的計算機模型,可以幫助預測其基因功能。這種模型利用的是一種“社交網(wǎng)絡”的工作原理,能夠通過連接的形式找到不同基因之間的相關性,認為在物理位置上處于同一個區(qū)域的基因,或是要與其他基因共同配合才能發(fā)揮作用的基因,可能具有相同的特征或類似的功能,其原理類似于facebook中可以通過你的朋友名單來推測出你的一些特征。科學家利用這個工具在擬南芥上進行了實驗,發(fā)現(xiàn)它可以包含擬南芥中19600多個基因中的一百萬個連接,將這些連接依據(jù)相互關系做成一張完整的功能關系網(wǎng)絡圖后,就能夠利用已知特征的基因去預測未特征化基因的功能。這個模型主要利用兩種假設的方法來檢測,一是利用已知參與某個應激反應的一套基因作為“誘餌”來發(fā)現(xiàn)另一些也參與這個應急反應的新基因,之后通過幾十種計算或是相關實驗,證明這些基因是否真的相互關聯(lián),若這些關聯(lián)比偶然機會發(fā)生的關聯(lián)幾率要大得多,即出現(xiàn)關聯(lián)的頻率要高得多,就可以認為假設成立;另一個就是預測未知基因的功能,主要是通過它們與已知基因的關系來推測,可以為后期功能驗證找到一些候選基因。為了驗證這個模型的準確性,科學家選擇了三個未知基因進行功能預測,通過后期的驗證試驗,發(fā)現(xiàn)有兩種都表現(xiàn)出了該模型預測的表型,證明這種模型有一定的可靠性,至少比早前利用小規(guī)模網(wǎng)絡預測的結果更可靠。
有很多啊。這得看樓主是想針對研究什么了啊。要是樓主是想僅僅克隆一個基因的話很簡單的啊。你只要從NCBI里面找出模式植物里面的基因。然后你再用你所研究的植物的RNA進行測序,獲得unigene基因序列,通過擴增在進行比對,就能知道這個基因的大致功能的。
有很多啊。這得看樓主是想針對研究什么了啊。要是樓主是想僅僅克隆一個基因的話很簡單的啊。你只要從NCBI里面找出模式植物里面的基因。然后你再用你所研究的植物的RNA進行測序,獲得unigene基因序列,通過擴增在進行比對,就能知道這個基因的大致功能的。
總結
以上是生活随笔為你收集整理的对于非典型的植物基因,有什么研究方法吗?的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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