軟件不夠好，很吃內(nèi)存

PacBio的單分子三代測(cè)序，該測(cè)序儀最大的特點(diǎn)就是測(cè)序長(zhǎng)度比454更長(zhǎng)，更加有利于基因組的拼接工作，有些較小的微生物可以直接將基因組測(cè)通成環(huán)狀。相對(duì)于二代測(cè)序，突破性的三代測(cè)序有如下優(yōu)勢(shì)：1）單分子實(shí)時(shí)檢測(cè)，每條堿基鏈的數(shù)據(jù)都得到評(píng)估，更易發(fā)現(xiàn)稀有變異2）最低DNA樣品量?jī)H500ng，無需PCR擴(kuò)增，測(cè)序覆蓋深度不受序列中 GC含量差異影響。可以對(duì) 100%A+T區(qū)域測(cè)序3）除堿基序列信息外，可同時(shí)獲得動(dòng)力學(xué)信息，因此可對(duì)諸如 DNA甲基化之類的堿基變化情況直接進(jìn)行分析4）無與倫比的長(zhǎng)序列讀長(zhǎng)5）測(cè)序速度快，聚合酶反應(yīng)速度（平均） 1 base/sec，從樣本制備到出結(jié)果，需時(shí) 1天6）靈活性極強(qiáng)，有一系列數(shù)據(jù)管理和分析軟件使二代三代測(cè)序流程實(shí)現(xiàn)無縫整合7）測(cè)序流程簡(jiǎn)單

1.成本高，PacBio的試劑成本和測(cè)序成本比二代測(cè)序高了好幾倍；2. 通量低，一個(gè)cell好像只有幾百M(fèi)，一個(gè)run能跑8個(gè)cell，比二代還是低了不少；3. 錯(cuò)誤率高，不過現(xiàn)在試劑升級(jí)了，準(zhǔn)確性提高不少，而且錯(cuò)誤率這個(gè)問題多跑一些cycles也能解決。

一個(gè)SMRT就產(chǎn)生380m，通量偏低

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的PacBio相对于二代测序还有哪些劣势？的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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