PacBio RS有哪些应用呢?
生活随笔
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PacBio RS有哪些应用呢?
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PacBio RS有以下四點應用:1.甲基化分析 美國芝加哥大學利用第三代單分子SMRT測序技術和5-hmC的選擇性化學標記方法來高通量檢測5-hmC。通過聚合酶動力學帶來的寶貴信息,研究人員可直接檢測DNA甲基化,包括N6-甲基腺嘌呤、5-mC和5-hmC。2.病原微生物鑒定由于PacBio從樣本制備到獲得序列信息所需時間非常短(<1天),在具有時效性的病原微生物鑒定中(例如生物反恐、流行病爆發監控等)也非常有優勢。一個國際小組利用Pacific Biosciences的單分子測序技術,深入研究了歐洲大腸桿菌菌株的致病性和進化起源,該研究成果發表在《新英格蘭醫學雜志》上。3.高GC含量區域測序美國加州大學戴維斯分校醫學院利用單分子實時測序技術,對脆性X染色體綜合征的關鍵基因FMR1中的CGG三核苷酸重復區域進行了測序。4.稀有突變檢測PacBio無需擴增、對每一個單分子模板都進行評估,對于混合群體中低至 1/100的稀有突變都可以檢出。http://www.ebiotrade.com/newsf ... 1.htmhttp://www.ebiotrade.com/newsf ... 3.htmhttp://www.ebiotrade.com/newsf ... 1.htmhttp://www.ebiotrade.com/emgzf ... 5.pdf
PacBio的讀長可以達到10kb以上,因此對于較小的微生物基因組,可以直接測通了,都不用拼接;另外如果測轉錄組的話,可以獲得全長轉錄本測序,拼接上肯定要比二代測序更準確和方便。
PacBio的讀長可以達到10kb以上,因此對于較小的微生物基因組,可以直接測通了,都不用拼接;另外如果測轉錄組的話,可以獲得全長轉錄本測序,拼接上肯定要比二代測序更準確和方便。
總結
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