是以二代或二代以上的家系材料為基礎，觀察標記位點與疾病致病基因位點在家系內是否呈共分離，并計算出遺傳距離及連鎖程度。目前最常用的方法是優勢對數計分（Lods）法，Lod值代表兩位點連鎖的機率與不呈連鎖的機率比的對數值，>3肯定連鎖，<－2否定連鎖，介于1與－2之間則需增加家系材料。該法優點在于對連鎖的判斷能力強，能確定連鎖程度，適于呈孟德爾遺傳、外顯率高、純一的單基因突變病分析，如糖尿病中的一種亞型MODY及少數呈多代多發患者的IDDM及NIDDM家系。缺點是需要完整的系譜材料，結果受遺傳模型設定的影響，對遺傳參數如基因頻率、基因傳遞率、外顯率及表型模擬率等依賴較大，故對一些復雜多基因疾病進行家系連鎖分析很難獲得滿意結果。

家系分析法可以確定女性的單體型。常用的連鎖分析方法有家系連鎖分析法[對數優勢記分法(Logoddsscore，LOD)]、患者同胞對分析法和患者家系成員分析法(affectedpedigreemember，APM)。ASP和APM均為非參數分析方法，是性狀—模型非依賴性分析

總結

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