如何降低下一代测序1%的碱基错误识别?
生活随笔
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如何降低下一代测序1%的碱基错误识别?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
樓上提到的雙重測序可能不會代替標準方法。其中一個原因是,對于全外顯子組測序來說,這種方法過于昂貴。它對于細胞的測序不均勻混合物或提問的生物學問題,真的很有用,因為它們需要超級精確度。所以,從某種意義上說,雙重測序可能會被限制在癌癥研究、病毒群、古DNA取證之類的事情。”
之前在某一篇文章見過這種方法,具體我不是很清楚,稱之為雙重測序(Duplex Sequencing),相關研究結果發表在2012年的《PNAS》雜志。通過對DNA雙鏈體的兩條鏈進行獨立標記和測序,這種方法實現的理論背景誤差率為,小于每十億個核苷酸序列中有1個人為突變。因此,這種方法對于檢測罕見DNA變異以及單分子計數具有很高的靈敏度,可精確地確定DNA或RNA拷貝數的絕對值。
目前降低下一代測序技術堿基出錯的方法主要有兩個方面:1、雙重測序——降低誤差率2、添加金屬螯合劑降低DNA氧化偏差——實現精確度具體可參見:http://www.51atgc.com/xingyezi ... .html
之前在某一篇文章見過這種方法,具體我不是很清楚,稱之為雙重測序(Duplex Sequencing),相關研究結果發表在2012年的《PNAS》雜志。通過對DNA雙鏈體的兩條鏈進行獨立標記和測序,這種方法實現的理論背景誤差率為,小于每十億個核苷酸序列中有1個人為突變。因此,這種方法對于檢測罕見DNA變異以及單分子計數具有很高的靈敏度,可精確地確定DNA或RNA拷貝數的絕對值。
目前降低下一代測序技術堿基出錯的方法主要有兩個方面:1、雙重測序——降低誤差率2、添加金屬螯合劑降低DNA氧化偏差——實現精確度具體可參見:http://www.51atgc.com/xingyezi ... .html
總結
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