全基因组测序能否扼制传染病大规模地爆发?
生活随笔
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全基因组测序能否扼制传染病大规模地爆发?
小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
這個暫時還是難以實現(xiàn)的。全基因組測序的準確率很高,但個人覺得扼制傳染病大規(guī)模地爆發(fā)不太可能,在實現(xiàn)上難度想當大。首先,既然是傳染病,想要扼制大規(guī)模地爆發(fā),就得遏制每一個人的生病,因為一點有一個人生病,那就不受基因控制了,傳染是必然的。其次,要從基因層面上實現(xiàn)每一個人的控制,現(xiàn)在聽起來像是天方夜譚。
2011年底,英國一家醫(yī)院的多名嬰兒被耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)感染。隨后,Wellcome Trust Sanger研究院的一個研究小組開始分析這些病例的樣本。想要確定,這些感染是否構成了爆發(fā)。總的來說,醫(yī)院的數(shù)據不是那么明確;病例傳播的時間軸上存在缺口,讓人難以下結論過去六個月內是否存在爆發(fā)。醫(yī)生們于是聯(lián)系了研究小組。此時,新的病例突然出現(xiàn)在同一病房中。 研究小組分析了新的MRSA樣本,確認新病例屬于原先爆發(fā)的一部分。使用了高分辨率的基因組測序技術,研究人員能夠告訴醫(yī)生,盡管傳播的時間軸上有缺口,但醫(yī)院中的所有MRSA菌株都是相關的。此外,數(shù)據表明這是個內部問題,一名工作人員很有可能充當了MRSA傳染的攜帶者。于是,他們對150名工作人員進行采樣并測序。在發(fā)表于《柳葉刀-傳染病》的文章中,研究人員確定一名醫(yī)護人員為攜帶者1。此人被隔離、治療,后重返工作崗位。自此,醫(yī)院再沒有MRSA感染。這是基因組測序首次被實時應用,來干預傳染病爆發(fā)。若沒有測序,一個新病例不足以讓我們采取行動。因為DNA測序將被常規(guī)使用,所以便能搞清楚這些耐藥細菌的爆發(fā)。
全基因組測序對于開發(fā)傳染病對抗藥物是有幫助的,如:抗埃博拉病毒(Ebola)藥物。但由于這類病毒的變異性特別強,所以先前測得的全基因組數(shù)據可能在病毒變異后用處大大降低,所以只依靠基因測序技術顯然不能阻止大規(guī)模傳染病爆發(fā)。
2011年底,英國一家醫(yī)院的多名嬰兒被耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)感染。隨后,Wellcome Trust Sanger研究院的一個研究小組開始分析這些病例的樣本。想要確定,這些感染是否構成了爆發(fā)。總的來說,醫(yī)院的數(shù)據不是那么明確;病例傳播的時間軸上存在缺口,讓人難以下結論過去六個月內是否存在爆發(fā)。醫(yī)生們于是聯(lián)系了研究小組。此時,新的病例突然出現(xiàn)在同一病房中。 研究小組分析了新的MRSA樣本,確認新病例屬于原先爆發(fā)的一部分。使用了高分辨率的基因組測序技術,研究人員能夠告訴醫(yī)生,盡管傳播的時間軸上有缺口,但醫(yī)院中的所有MRSA菌株都是相關的。此外,數(shù)據表明這是個內部問題,一名工作人員很有可能充當了MRSA傳染的攜帶者。于是,他們對150名工作人員進行采樣并測序。在發(fā)表于《柳葉刀-傳染病》的文章中,研究人員確定一名醫(yī)護人員為攜帶者1。此人被隔離、治療,后重返工作崗位。自此,醫(yī)院再沒有MRSA感染。這是基因組測序首次被實時應用,來干預傳染病爆發(fā)。若沒有測序,一個新病例不足以讓我們采取行動。因為DNA測序將被常規(guī)使用,所以便能搞清楚這些耐藥細菌的爆發(fā)。
全基因組測序對于開發(fā)傳染病對抗藥物是有幫助的,如:抗埃博拉病毒(Ebola)藥物。但由于這類病毒的變異性特別強,所以先前測得的全基因組數(shù)據可能在病毒變異后用處大大降低,所以只依靠基因測序技術顯然不能阻止大規(guī)模傳染病爆發(fā)。
總結
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