RNA測(cè)序也就是所謂的RNA-seq，通常指的是轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，只測(cè)細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄本，只有基因組中被轉(zhuǎn)錄出來的那部分能測(cè)到，通常用于尋找差異表達(dá)基因以及發(fā)現(xiàn)新基因。DNA測(cè)序是測(cè)基因組，不管轉(zhuǎn)錄不轉(zhuǎn)錄，通常用于基因組組裝，重測(cè)序進(jìn)行基因分型等。相對(duì)而言，RNA測(cè)序影響準(zhǔn)確度的因素要多一些。

DNA測(cè)序是將RNA反轉(zhuǎn)錄成DNA然后測(cè)序，在反轉(zhuǎn)錄的過程中會(huì)存在一定小概率的錯(cuò)配、缺失等。 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序主要通過高通量測(cè)序研究特定組織或細(xì)胞在某個(gè)時(shí)期轉(zhuǎn)錄出來的mRNA。

最近，由美國(guó)FDA牽頭的測(cè)序質(zhì)量控制（SEQC）項(xiàng)目對(duì)RNA測(cè)序的準(zhǔn)確性、可重現(xiàn)性和信息含量進(jìn)行了綜合性評(píng)估，并將初步調(diào)查結(jié)果發(fā)表在近日的Nature Biotechnology雜志上。研究人員發(fā)現(xiàn)，所有測(cè)序深度都會(huì)出現(xiàn)未注釋的外顯子-外顯子連接區(qū)域，其中80%以上都得到了qPCR的驗(yàn)證。用RNA測(cè)序檢測(cè)相對(duì)表達(dá)可以得到準(zhǔn)確且可重復(fù)的結(jié)果，但RNA測(cè)序和芯片都不能提供精確的絕對(duì)測(cè)量，而且研究用到的平臺(tái)都存在基因特異性的偏好，包括qPCR。數(shù)據(jù)分析的算法也會(huì)對(duì)RNA測(cè)序產(chǎn)生很大影響，不同算法生成的轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)差異很大。

整體來說還是可靠的，雖說會(huì)有些許錯(cuò)配但是不會(huì)太影響。如果與DNA測(cè)序相比，還是有所不如的~

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的RNA测序可靠性如何？的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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