Nature子刊:基于静息态EEG功能连接模式识别精神疾病亚型
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摘要:精神疾病在神經(jīng)生物學(xué)和臨床表征上存在異質(zhì)性,基于數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的疾病亞型識(shí)別有助于精神疾病的診斷和治療,本文報(bào)告了創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙(PTSD)和重度抑郁障礙(MDD)兩種臨床相關(guān)亞型的識(shí)別,這兩種疾病亞型主要通過(guò)在額頂葉控制網(wǎng)絡(luò)(FPCN)和默認(rèn)模式網(wǎng)絡(luò)內(nèi)(DMN)中穩(wěn)定、有區(qū)分度的功能連接模式來(lái)建立。本文分析了四組PTSD和MDD患者數(shù)據(jù)集,在高密度靜息態(tài)腦電圖中重建信號(hào),探究重建信號(hào)的能量包絡(luò)連接性特征(PEC),通過(guò)有監(jiān)督和無(wú)監(jiān)督的機(jī)器學(xué)習(xí)確定疾病亞型,并表明這些疾病亞型在不同條件下記錄的獨(dú)立數(shù)據(jù)集之間是可轉(zhuǎn)移的。與健康對(duì)照組相比,功能連接差異較大的疾病亞型對(duì)PTSD的心理治療反應(yīng)較差,對(duì)MDD的抗抑郁藥物沒(méi)有反應(yīng)。在MDD數(shù)據(jù)集中,PTSD和MDD兩種臨床相關(guān)亞型對(duì)接受心理治療同時(shí)接受重復(fù)經(jīng)顱磁刺激(rTMS)治療反應(yīng)相似。本文通過(guò)稀疏聚類(lèi)的數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)方法可能為基于連接組的診斷提供一個(gè)有效的解決方案。
一、背景介紹
精神病的診斷是根據(jù)一系列癥狀來(lái)定義的。例如,創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙(PTSD)涉及一系列情緒、認(rèn)知和軀體癥狀,這些癥狀可能在一個(gè)人經(jīng)歷或目睹了一個(gè)對(duì)個(gè)人造成嚴(yán)重傷害或威脅的創(chuàng)傷事件后出現(xiàn)。同樣,重度抑郁癥(MDD)以持續(xù)的負(fù)面情緒為特征,通常與生理、心理或社會(huì)壓力來(lái)源有關(guān)。研究精神疾病神經(jīng)生物學(xué)的傳統(tǒng)方法遵循了這一診斷框架,通過(guò)病例對(duì)照研究,將所有精神疾病患者與健康個(gè)體進(jìn)行比較。然而,研究病例-對(duì)照組的差異可能會(huì)阻礙精神病學(xué)生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和對(duì)精神病理生物學(xué)的理解,在當(dāng)前的臨床診斷定義中,患者和健康對(duì)照患者中存在高度的生物學(xué)異質(zhì)性,而這種生物異質(zhì)性對(duì)治療結(jié)果有重大影響,如何識(shí)別和復(fù)制能夠闡明這種異質(zhì)性的生物標(biāo)志物是一個(gè)長(zhǎng)期的挑戰(zhàn)。本文試從高密度靜息態(tài)腦電圖(rsEEG)中重建源信號(hào),并從重建的信號(hào)中提取功能包絡(luò)連接特征(PEC),從PEC特征中尋找生物標(biāo)志物。
研究主要目標(biāo):描述PTSD和MDD的神經(jīng)生物學(xué)異質(zhì)性,通過(guò)稀疏聚類(lèi)的數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)方法,從靜息態(tài)腦電圖的功能包絡(luò)連接(rsEEG-PEC)中識(shí)別出生物標(biāo)志物,從而闡明精神病學(xué)在神經(jīng)生物學(xué)和臨床表征上的異質(zhì)性。
研究方法概覽
在四個(gè)獨(dú)立的數(shù)據(jù)集中進(jìn)行亞型分析,數(shù)據(jù)集包括兩個(gè)PTSD數(shù)據(jù)集和兩個(gè)MDD數(shù)據(jù)集。從一個(gè)PTSD數(shù)據(jù)集的rs-EEG中重建信號(hào),從信號(hào)中提取PEC特征,根據(jù)PEC特征確定兩種穩(wěn)定且可復(fù)制的臨床相關(guān)亞型。然后在其他數(shù)據(jù)集上對(duì)發(fā)現(xiàn)的亞型進(jìn)行復(fù)制分析,探究數(shù)據(jù)集疾病亞型的可轉(zhuǎn)移性,最后探究發(fā)現(xiàn)的疾病亞型在不同的臨床干預(yù)下的反應(yīng),分析亞型的臨床意義。
二、研究設(shè)計(jì)
數(shù)據(jù)集1:106名創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙患者和95名健康對(duì)照者(曾受創(chuàng)傷的健康參與者)的創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙數(shù)據(jù)集;研究人員使用BrainAmp直流放大器(Brain Products)以5 kHz采樣率采集PTSD患者的腦電圖數(shù)據(jù),模擬帶通濾波在0 - 1 kHz之間。按照標(biāo)準(zhǔn)的10-20系統(tǒng),使用帶有64個(gè)Ag/AgCl電極的Easy EEG帽進(jìn)行數(shù)據(jù)記錄。參考電極被固定在鼻尖上。在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,參與者被安排坐在一張舒適的椅子上,并被要求保持清醒,完成兩個(gè)階段(閉上眼睛三分鐘和睜開(kāi)眼睛三分鐘),之后進(jìn)行腦電信號(hào)的預(yù)處理。
數(shù)據(jù)集2:創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙135例患者,這些參與者是在北加州或新墨西哥州的退伍軍人事務(wù)診所的心理治療評(píng)估中,基于符合創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙的臨床標(biāo)準(zhǔn)而招募的。采用 (EGI)放大器,以1 kHz采樣率和256個(gè)電極采集創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙患者的腦電圖數(shù)據(jù),在數(shù)據(jù)記錄期間電極阻抗保持在50 KΩ以下。在實(shí)驗(yàn)中,參與者坐在一張舒適的椅子上,并被要求保持清醒,完成兩個(gè)階段(10分鐘閉眼和10分鐘睜開(kāi)眼)。靜息狀態(tài)的腦電圖預(yù)處理。記錄的rsEEG數(shù)據(jù)使用與PTSD研究數(shù)據(jù)集1中相同的方式處理。
數(shù)據(jù)集3:重度抑郁癥266例患者,在四個(gè)研究地點(diǎn):德克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心(TX)、麻省總醫(yī)院(MG)、哥倫比亞大學(xué)(CU)和密歇根大學(xué)(UM),根據(jù)機(jī)構(gòu)審查委員會(huì)批準(zhǔn)的方案,每個(gè)參與者都獲得了書(shū)面知情同意。rsEEG記錄了四個(gè)研究地點(diǎn)。在所有研究地點(diǎn),都進(jìn)行了放大器校準(zhǔn)。實(shí)驗(yàn)人員通過(guò)視頻會(huì)議演示了準(zhǔn)確的腦電圖帽放置和任務(wù)指令傳遞,試驗(yàn)受試者腦電圖數(shù)據(jù)獲得了哥倫比亞腦電圖團(tuán)隊(duì)的認(rèn)證。rsEEG被記錄在4個(gè)2分鐘的區(qū)塊中(兩個(gè)閉著眼睛的區(qū)塊和兩個(gè)睜開(kāi)眼睛的區(qū)塊)。參與者被要求保持靜止,盡量減少眨眼或眼球運(yùn)動(dòng),并在眼睛睜開(kāi)的情況下注視中心呈現(xiàn)的十字。記錄的rsEEG數(shù)據(jù)使用與PTSD研究數(shù)據(jù)集1中相同處理。結(jié)果,在266例治療前腦電圖記錄的患者中,228例有可用的腦電圖數(shù)據(jù)可供分析。38例無(wú)法使用腦電圖記錄的患者主要表現(xiàn)為不良腦電圖通道過(guò)多、通道總功率過(guò)大。
數(shù)據(jù)集4:重度抑郁癥179例患者,179名患者來(lái)自荷蘭的三家門(mén)診精神保健診所。根據(jù)10-20電極國(guó)際系統(tǒng),所有通道的采樣率為500赫茲。受試者被要求睜開(kāi)眼睛,閉上眼睛,安靜地休息2分鐘。使用與數(shù)據(jù)集1同樣的方式處理記錄的rsEEG數(shù)據(jù)。
重復(fù)經(jīng)顱磁刺激治療:所有患者均接受了10 Hz到左側(cè)背外側(cè)前額葉皮層(DLPFC)或1 Hz到右側(cè)DLPFC的刺激方案的治療,或同時(shí)接受這兩種治療。
源定位PEC的計(jì)算:我們利用腦電源信號(hào)的源空間PEC特征作為分型分析的依據(jù)。PEC測(cè)量?jī)蓚€(gè)腦電信號(hào)的功率包絡(luò)之間的相關(guān)性,表征任何一對(duì)大腦區(qū)域之間的振幅同步。在計(jì)算功率包絡(luò)線(xiàn)之前,正交化兩個(gè)腦電信號(hào)的分析時(shí)間序列,PEC消除了零相位延遲連接。
神經(jīng)生理學(xué)亞型識(shí)別:對(duì)于每個(gè)參與者,我們將所有八種條件(四個(gè)典型頻帶和睜眼/閉眼)提取的PEC特征結(jié)合起來(lái),形成維度為465 × 8 = 3720的特征向量。如此大量的特征通常包括冗余信息,數(shù)據(jù)中出現(xiàn)的真正潛在子類(lèi)型可能只與部分PEC特征有關(guān)。為了在所有條件下自動(dòng)確定最明顯的PEC特征,以更準(zhǔn)確地識(shí)別神經(jīng)生理亞型,我們利用了稀疏聚類(lèi)算法,該算法實(shí)現(xiàn)聯(lián)合特征選擇和聚類(lèi)分析。圖1說(shuō)明了亞型識(shí)別的整個(gè)算法框架。
圖1 確定疾病亞型算法的框架
框架詳解:不同通道腦電圖信號(hào)首先通過(guò)帶通濾波成四個(gè)典型頻帶:theta (4-7 Hz)、alpha (8-12 Hz)、beta (13-30 Hz)和gamma (31-50 Hz)。通過(guò)源定位將通道空間腦電信號(hào)轉(zhuǎn)換為源空間信號(hào)。利用主成分分析將每個(gè)頂點(diǎn)處的三維估計(jì)源信號(hào)降化為主成分的一維時(shí)間序列。然后在每個(gè)頂點(diǎn)小波變換提取分析信號(hào),在小波分析信號(hào)的基礎(chǔ)上計(jì)算各頂點(diǎn)的功率包絡(luò)信號(hào),并對(duì)其他所有頂點(diǎn)進(jìn)行正交處理。PEC計(jì)算為每個(gè)頂點(diǎn)對(duì)的功率包絡(luò)之間的皮爾遜相關(guān)系數(shù),然后是Fisher的r-to-z變換。通過(guò)對(duì)所有對(duì)應(yīng)頂點(diǎn)對(duì)的PEC值進(jìn)行平均,進(jìn)一步提取PEC特征。然后使用稀疏聚類(lèi)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的方法來(lái)探索潛在重要的PEC生物標(biāo)志物,以發(fā)現(xiàn)神經(jīng)生理亞型。
三、結(jié)果
由于不同的頻帶和腦電圖靜息狀態(tài) (例如,睜眼和閉眼)可能攜帶不同的神經(jīng)生物學(xué)信息,哪種情況具有最豐富的特征用于亞型識(shí)別是先驗(yàn)未知的。本文沒(méi)有單獨(dú)分析每個(gè)條件,采用稀疏聚類(lèi)方法,通過(guò)最大化聚類(lèi)間的不相似性和對(duì)PEC特征的稀疏性約束來(lái)實(shí)現(xiàn)同時(shí)的特征選擇和聚類(lèi)。在創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)集(數(shù)據(jù)集1)上實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的亞型識(shí)別,結(jié)合了所有8種腦電圖條件(睜眼/閉眼條件下的4個(gè)頻帶(theta, alpha, beta和gamma)的PEC特征,并將這些特征提交給稀疏聚類(lèi)算法。如圖2a所示,所選PEC特征主要來(lái)自beta頻段和睜眼狀態(tài),且兩種臨床相關(guān)亞型在額葉和后葉區(qū)域處具有較強(qiáng)的連通性差異(圖2b)。觀察圖2c的健康對(duì)照組對(duì)照組與亞型1、亞型2 的平均連通性,圖2c散點(diǎn)圖顯示,健康對(duì)照組和亞型1之間的平均連通性模式高度相似(r = 0.94, P < 10?5),但健康對(duì)照組和亞型2之間的連通性較差(r = 0.44, P < 10?5)。
圖2 靜息態(tài)腦電圖功率包絡(luò)連接在PTSD數(shù)據(jù)庫(kù)中定義了兩種臨床相關(guān)亞型
圖3 兩種亞型的PEC差異
如圖3 (a,b)顯示,亞型1與亞型2相比,額葉皮質(zhì)與其他區(qū)域之間的PEC更強(qiáng),而頂葉皮質(zhì)與其他區(qū)域之間的PEC更弱。圖2b是大腦連接差異(亞型1和亞型2)模式的可視化。PEC特征差異主要位于額頂控制網(wǎng)絡(luò)(FPCN)和默認(rèn)模式網(wǎng)絡(luò)(DMN)的區(qū)域。
圖4所示,為了測(cè)試數(shù)據(jù)集1發(fā)現(xiàn)的亞型是否可以復(fù)制,對(duì)135名PTSD患者(數(shù)據(jù)集2)進(jìn)行了相同的分析,數(shù)據(jù)集分為2個(gè)組,第一組是72名患者首次復(fù)制分析,第二組是63名患在第一組之后再分析,第二組可以進(jìn)一步復(fù)制第一組測(cè)試的臨床預(yù)測(cè)結(jié)果,使用相同的特征選擇過(guò)程,再次能夠產(chǎn)生兩個(gè)在beta波段和睜眼條件下的功能連通性具有較大差異,這與PTSD數(shù)據(jù)集1的結(jié)果一致,數(shù)據(jù)集2中兩個(gè)組可復(fù)制已識(shí)別的PEC亞型,數(shù)據(jù)集2的兩個(gè)組的亞型與數(shù)據(jù)集1中的亞型在功能連通性差異上具有高度相似的模式。
圖4 數(shù)據(jù)集2中兩個(gè)組復(fù)制已識(shí)別的PEC亞型
研究發(fā)現(xiàn)的亞型是否可以作為潛在的經(jīng)診斷的生物標(biāo)志物,圖5在重度抑郁患數(shù)據(jù)集上復(fù)制發(fā)現(xiàn)的亞型。觀察到兩個(gè)具有不同功能連接模式的亞型(圖5a-d),這與在兩個(gè)創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙數(shù)據(jù)集中發(fā)現(xiàn)的結(jié)果一致。
圖5 兩個(gè)MDD數(shù)據(jù)集中復(fù)制識(shí)別的PEC亞型
圖6所示,當(dāng)與其他數(shù)據(jù)集的亞型進(jìn)行比較時(shí),觀察到亞型具有相似的PEC特征分布。
圖6 四個(gè)數(shù)據(jù)集的亞型的PEC特征分布
驗(yàn)證數(shù)據(jù)集的疾病亞型的可傳遞性
從一個(gè)數(shù)據(jù)集的稀疏聚類(lèi)分析中提出基于聚類(lèi)質(zhì)心的模式分類(lèi)器(cluster-centroid-basedclassifier)(使用來(lái)自β波段的PEC特征和睜眼條件),然后應(yīng)用于另一個(gè)數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù),得到預(yù)測(cè)的類(lèi)別標(biāo)簽。通過(guò)將預(yù)測(cè)的類(lèi)別標(biāo)簽與從第二數(shù)據(jù)集的稀疏聚類(lèi)分析中獲得的類(lèi)別標(biāo)簽進(jìn)行比較來(lái)計(jì)算分類(lèi)精度。(a)是在一個(gè)數(shù)據(jù)集上訓(xùn)練,在另一個(gè)數(shù)據(jù)集上測(cè)試。(b)是在三個(gè)數(shù)據(jù)集上進(jìn)行訓(xùn)練,并在第四個(gè)數(shù)據(jù)集上進(jìn)行測(cè)試。結(jié)果顯示,分類(lèi)準(zhǔn)確率平均為90.6%,在所有情況下均大于86%(圖7a),我們?cè)谌齻€(gè)數(shù)據(jù)集上迭代訓(xùn)練分類(lèi)器,并在第四個(gè)數(shù)據(jù)集上進(jìn)行測(cè)試,平均準(zhǔn)確率為89.9%,所有數(shù)據(jù)集均大于88%(圖7b)。這些結(jié)果表明,發(fā)現(xiàn)的亞型可在使用不同腦電圖設(shè)備、使用不同臨床診斷和不同的記錄時(shí)間獲得的獨(dú)立數(shù)據(jù)集之間轉(zhuǎn)移。
圖7 驗(yàn)證數(shù)據(jù)集的亞型的可轉(zhuǎn)移性
這兩亞型在心理治療(針對(duì)創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙,抗抑郁藥物治療與安慰劑治療(針對(duì)MDD)的臨床結(jié)果方面有所不同。PTSD數(shù)據(jù)集2中的患者接受了PE或CPT治療,這是目前PTSD治療中可靠的治療方法。我們將數(shù)據(jù)集2分為兩組:72名患者用于初次亞型分析,63名參與者在首次分析后再次研究。使用創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙量表(CAPS)對(duì)創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙嚴(yán)重程度進(jìn)行評(píng)估,在數(shù)據(jù)集2的第一個(gè)組患者在創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙的心理治療中,亞型1具有更好的治療結(jié)果。為了進(jìn)一步探究亞型對(duì)心理治療的反應(yīng),我們對(duì)第二組進(jìn)行了創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙量表(CAPS)分析。與在第一個(gè)組中觀察到的一致,亞型1對(duì)心理治療的反應(yīng)明顯好于亞型2(圖6b)。
圖8 亞型對(duì)不同診斷和治療方式的反應(yīng)
MDD數(shù)據(jù)集3在腦電圖后隨即接受抗抑郁藥物舍曲林或安慰劑,在一項(xiàng)意向治療分析中,臨床評(píng)定抑郁嚴(yán)重程度的線(xiàn)性混合效應(yīng)模型(漢密爾頓抑郁評(píng)定量表(HAMD17))顯示,舍曲林藥物和安慰劑對(duì)這兩種亞型的反應(yīng)不同(圖8c),具體來(lái)說(shuō),舍曲林對(duì)亞型1 的反應(yīng)明顯優(yōu)于安慰劑,對(duì)亞型2,舍曲林或安慰劑對(duì)亞型的反應(yīng)區(qū)別不大。進(jìn)一步測(cè)試了在接受心理治療同時(shí)接受重復(fù)經(jīng)顱磁刺激(rTMS)治療結(jié)果的亞型之間的差異(圖8d),數(shù)據(jù)集4進(jìn)行10 Hz到左側(cè)背外側(cè)前額葉皮層(DLPFC)或1 Hz到右側(cè)DLPFC的rTMS刺激,貝克抑郁量表(BDI)顯示,亞型對(duì)任一方案的rTMS方案反應(yīng)相似。
四、總結(jié)
本文采用稀疏聚類(lèi)的數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的方法,從高密度靜息狀態(tài)腦電圖(rsEEG)中重建信號(hào),從信號(hào)的功率包絡(luò)連接性(PEC)特征中識(shí)別出兩種穩(wěn)定且可復(fù)制的臨床相關(guān)亞型。在任何數(shù)據(jù)集,這兩種臨床相關(guān)亞型在基線(xiàn)時(shí)臨床嚴(yán)重程度方面沒(méi)有差異,但在不同的臨床干預(yù)之后亞型表現(xiàn)出差異性和相似性。本文提供了一種描述神經(jīng)生物異質(zhì)性的可推廣的方法,可能有助于神經(jīng)性疾病的診斷和治療。具體來(lái)說(shuō),所選PEC特征主要來(lái)自beta頻段和睜眼狀態(tài),且兩種臨床相關(guān)亞型在額葉和后葉區(qū)域具有較強(qiáng)的連通性差異。亞型1與亞型2相比,額葉區(qū)有更強(qiáng)的β帶PEC,但頂葉區(qū)較弱的β帶PEC。亞型2對(duì)心理療法和抗抑郁藥物的反應(yīng)較弱,但我們的經(jīng)顱磁刺激試驗(yàn)結(jié)果顯示亞型1和亞型2對(duì)兩種不同的經(jīng)顱磁刺激治療方案(左前額葉10hz和右前額葉1hz)的反應(yīng)相似。這表明相對(duì)于心理療法和抗抑郁藥物,神經(jīng)刺激可能是治療亞型2的一個(gè)很好的選擇。
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總結(jié)
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