python绘制概率密度曲线_[python常用图件绘制#04]核密度曲线图(峰值点显示)
一、關于核密度估計帶寬的一些說明
進行核密度估計Kernel Density Estimation(KDE)時,帶寬bw的選取尤為重要,不同的帶寬會對結果造成很大的影響。利用seaborn庫中kdeplot()繪制kde曲線時,可以選擇scott和silverman兩種自適應帶寬方法。
1-1
1-2
二、例圖
2-1
樣本數據的統計信息及其KDE曲線信息2-2
三、代碼3-1
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import seaborn as sns
import statsmodels.nonparametric.api as smnp
def kde_test(data, kernel, bw, gridsize, cut):
"""
:param data:有限樣本數據
:param kernel:核函數
:param bw:帶寬
:param gridsize:繪制擬合曲線中的離散點數;可理解為精度,會改變kde曲線的圓滑程度
:param cut: 源代碼說明——Draw the estimate to cut * bw from the extreme data points.
:return: kde估計曲線的x、y坐標
"""
fft = kernel == "gau"
kde = smnp.KDEUnivariate(data)
kde.fit(kernel, bw, fft, gridsize=gridsize, cut=cut)
return kde.support, kde.density
class Kdefitplot:
def __init__(self, data, kernel='gau', bw="scott", legends=None, labels=None, fsize=(10, 6.18), show_point=False, show_info=True):
"""
:param data:以列表格式存儲的數據
:param kernel:密度估計選用的核函數,可選{'gau'|'cos'|'biw'|'epa'|'tri'|‘triw’},默認為'gau'
:param bw:密度估計選用的自適應帶寬方法,可選{'scott'|'silverman'|scalar|pair of scalars},默認為"scott"
:param legends: 圖例名,默認為 "概率密度", "kde曲線", "最大值點"
:param labels:坐標軸標題名,默認為 "數據x", "概率密度"
:param show_info:是否顯示擬合結果信息,默認為True
:param show_point:在kde曲線上顯示目標點(最大值點),默認為False
"""
self.data = data
self.kernel = kernel
self.bw = bw
if legends is None:
legends = ["概率密度", "kde曲線", "最大值點"]
if labels is None:
labels = ["樣本數據", "概率密度"]
self.legends = legends
self.labels = labels
self.fsize = fsize
self.show_info = show_info
self.show_point = show_point
self.gridsize = 100
self.cut = 3
def change_legend(self, new_legends):
# 更改圖例
self.legends = new_legends
def change_label(self, new_labels):
# 更改坐標軸標題
self.labels = new_labels
def draw_plot(self):
# 利用seaborn庫對字體大小進行統一設置,為fgsize[1]的0.12倍,即畫布縱向大小為1000時,font_scale=1.2
sns.set_style("darkgrid")
sns.set_context("talk", font_scale=self.fsize[1] * 0.15)
plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei']
matplotlib.rcParams['axes.unicode_minus'] = False
plt.figure(figsize=self.fsize)
# 繪制頻率直方圖
sns.distplot(self.data, label=self.legends[0], rug=True, kde=True, kde_kws={"color": "g", "lw": 0})
# 以gau為核函數,scott為帶寬估計方法
sns.kdeplot(self.data,
kernel=self.kernel,
bw=self.bw,
label=self.legends[1],
color="r",
linewidth=self.fsize[0]*0.2
)
# 計算kde曲線的x、y值
kdefit_x, kdefit_y = kde_test(self.data,
self.kernel,
self.bw,
gridsize=self.gridsize,
cut=self.cut)
# point為kde曲線最大值點
point = np.where(kdefit_y == np.max(kdefit_y))
# 在kde曲線上顯示目標點,格式為黑色實心圓
if self.show_point:
plt.plot(kdefit_x[point], kdefit_y[point], "o", color='k', linewidth=self.fsize[0]*0.4, label=self.legends[2])
# 打印統計信息
if self.show_info:
# 顯示核密度估計信息:kernel為核函數、bw為自適應帶寬方法、point為kde曲線最大值點
# 基本統計信息:Size為樣本數據點個數、Average為平均值、Q25/Q50/Q75分別為25%/50%/75%分位數
q25, q50, q75 = [round(q, 4) for q in np.percentile(self.data, [25, 50, 75])]
base_info = f"Size:{len(self.data)}\nAver:{np.mean(self.data)}\nQ25:{q25}; Q50:{q50}; Q75:{q75}\n\n"
kde_info = f"kernel:{self.kernel}\nbw:{self.bw}\nMax point appear in {kdefit_x[point]}\n"
print(base_info + kde_info)
# 設置x、y坐標軸標題
plt.xlabel(self.labels[0])
plt.ylabel(self.labels[1])
plt.legend()
plt.tight_layout()
if __name__ == "__main__":
iqs_1 = 100 + 15 * np.random.randn(500) ?# 待繪制直方圖的數據
iqs_2 = 200 + 75 * np.random.randn(500)
kdeplot1 = Kdefitplot(iqs_1 + iqs_2, show_point=True)
kdeplot1.draw_plot()
plt.show()
總結
以上是生活随笔為你收集整理的python绘制概率密度曲线_[python常用图件绘制#04]核密度曲线图(峰值点显示)的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
- 上一篇: unity hub是什么东西_Unity
- 下一篇: 途昂x大灯碎了